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数据库分析和验证HMMR为乳腺癌的主要生物标志物 被引量:1
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作者 刘馨璥 范苗苗 +2 位作者 赵奇 毕佳欣 宋洁 《牡丹江医学院学报》 2022年第3期60-63,84,共5页
目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因。方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。通过UALCA... 目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因。方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和通路。通过UALCAN和HPA数据库分析了mRNA和蛋白表达水平,通过Kaplan-Meier plotter数据库进行生存分析。QRT-PCR检测验证透明质酸介导的运动受体(Recombinant Hyaluronan Mediated Motility Receptor,HMMR)在乳腺癌细胞中的表达水平。结果 筛选到217个乳腺癌差异表达基因,确定了TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,TOP10枢纽基因与DNA复制、有丝分裂细胞周期的G1/S转变、有丝分裂细胞周期的G2/M转变相关,并且主要富集在p53信号通路上。经数据库验证,HMMR在乳腺癌中表达上调,并且与临床分期以及生存率负相关。QRT-PCR结果显示,与正常乳腺细胞MCF-10A相比,HMMR mRNA在乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、SKBR3的表达水平明显上调(P<0.05)。结论 通过生物信息学方法筛选出参与乳腺癌发生发展的关键基因和功能通路,并鉴定HMMR是乳腺癌的主要生物标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 枢纽基因 HMMR 生物标志物
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基于网络药理学和免疫浸润系统阐明红花注射液治疗肝细胞癌的潜在机制
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作者 刘梓璇 金雪 +3 位作者 桂金秋 刘洋 唐小云 石学魁 《牡丹江医学院学报》 2023年第6期26-33,87,共9页
目的运用网络药理学和免疫浸润的方法研究红花注射液治疗肝细胞癌(HCC)的分子机制。方法通过已发表的文献收集红花注射液主要有效成分,利用数据库预测红花注射液的成分靶点与HCC的靶点,借助Cytoscape 3.8.0构建“中药-成分-靶点-疾病”... 目的运用网络药理学和免疫浸润的方法研究红花注射液治疗肝细胞癌(HCC)的分子机制。方法通过已发表的文献收集红花注射液主要有效成分,利用数据库预测红花注射液的成分靶点与HCC的靶点,借助Cytoscape 3.8.0构建“中药-成分-靶点-疾病”网络,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作PPI网络并筛选关键靶点,运用CytoMCODE插件完成模块分析。应用R软件对共有靶点进行GO和KEGG富集分析,并构建“成分-靶点-通路”网络。通过TRRUST和MetaScape数据库进行转录因子及相关调控基因特异富集。利用GEPIA数据库对关键靶点进行表达差异分析和生存预后分析,最后利用TIMER数据库进行肿瘤细胞的免疫浸润分析。结果筛选出27种红花注射液有效成分和123个作用靶点,可通过介导癌症信号通路、Toll样受体、IL-17、TNF等炎症相关通路以及MAPK、PI3K-Akt等信号通路发挥抗肝细胞癌作用。探寻到11个相关转录因子。免疫浸润分析表明,ESR1表达水平与B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞等细胞的免疫浸润水平呈负相关(P<0.05);SRC则相反,呈正相关。结论本研究初步揭示了红花注射液治疗肝细胞癌的多成分、多靶点、多通路的作用机制,ESR1、SRC等靶点可能在治疗过程发挥重要作用。 展开更多
关键词 红花注射液 肝细胞癌 网络药理学 生存分析 免疫浸润
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谷胱甘肽硫转移酶基因多态性与宫颈癌的研究进展 被引量:5
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作者 王静 王涛 +1 位作者 朱莉莉 卜晓波 《中国实用医药》 2017年第4期190-192,共3页
谷胱甘肽硫转移酶(GSTs)是广泛分布于各种生物体内的一组多功能同工酶,具有清除体内自由基和超氧阴离子、防癌、抗氧化等作用。作为一种重要的Ⅱ相代谢酶,GSTs在人体的分布具有基因多态性,这种现象会导致编码酶的活性消失或降低,进而影... 谷胱甘肽硫转移酶(GSTs)是广泛分布于各种生物体内的一组多功能同工酶,具有清除体内自由基和超氧阴离子、防癌、抗氧化等作用。作为一种重要的Ⅱ相代谢酶,GSTs在人体的分布具有基因多态性,这种现象会导致编码酶的活性消失或降低,进而影响药物治疗效果。GSTs的基因多态性与多种妇科恶性肿瘤风险相关。本文主要对GSTs基因多态性与宫颈癌关系方面的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 谷胱甘肽硫转移酶 基因多态性 宫颈癌
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同型半胱氨酸及MTHFR基因多态性与冠心病的相关性研究进展 被引量:3
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作者 王静 韩彦龙 +1 位作者 张洋 王涛 《中国现代药物应用》 2017年第3期196-198,共3页
冠心病是在全球范围内对人类生命健康危害性最大的疾病之一,除传统的独立危险因素之外,同型半胱氨酸也被认为是该病的新型独立危险因素,同时对于其代谢关键酶亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与冠心病的相关性也莫衷一是。本文特... 冠心病是在全球范围内对人类生命健康危害性最大的疾病之一,除传统的独立危险因素之外,同型半胱氨酸也被认为是该病的新型独立危险因素,同时对于其代谢关键酶亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与冠心病的相关性也莫衷一是。本文特对于同型半胱氨酸及MTHFR基因多态性与冠心病的相关性进行统一综述介绍。 展开更多
关键词 冠心病 亚甲基四氢叶酸还原酶 同型半胱氨酸
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筛选精子抗原的研究进展
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作者 朱雁飞 孙明 +3 位作者 宋宝辉 唐小云 张红军 张晓莉 《医学综述》 2010年第14期2118-2120,共3页
抗精子抗体的产生可能是引起不孕症的原因之一。近年来,对诱导抗精子抗体产生的精子抗原的研究逐渐深入,发现利用精子抗原的免疫原性可以达到免疫法避孕的目的。最近新发现了一些精子自身抗原和同种抗原,但是有些抗原在不孕症中的作用... 抗精子抗体的产生可能是引起不孕症的原因之一。近年来,对诱导抗精子抗体产生的精子抗原的研究逐渐深入,发现利用精子抗原的免疫原性可以达到免疫法避孕的目的。最近新发现了一些精子自身抗原和同种抗原,但是有些抗原在不孕症中的作用还没有得到证实。对精子抗原免疫反应本质的详细了解有助于发展避孕疫苗。 展开更多
关键词 不孕症 精子 抗精子抗体 抗原
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谷胱甘肽硫转移酶M1多态性及HPV16感染与宫颈癌的关系 被引量:3
6
作者 王静 王涛 +4 位作者 宋洁 韩彦龙 代海兵 邓代千 卜晓波 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2018年第7期1606-1608,共3页
目的探讨谷胱甘肽硫转移酶(GST)M1多态性及人乳头瘤病毒(HPV)16感染与宫颈癌的关系。方法选取2014年6月至2015年6月该院收治的116例宫颈癌患者作为病例组,选取同期该院诊断为子宫肌瘤的116例患者作为对照组,采用多重PCR方法检测两组血... 目的探讨谷胱甘肽硫转移酶(GST)M1多态性及人乳头瘤病毒(HPV)16感染与宫颈癌的关系。方法选取2014年6月至2015年6月该院收治的116例宫颈癌患者作为病例组,选取同期该院诊断为子宫肌瘤的116例患者作为对照组,采用多重PCR方法检测两组血标本中GSTM1基因型及宫颈刮片细胞标本中HPV16阳性率,分析其与宫颈癌发生的关系。结果病例组GSTM1 null型占比为59.48%,高于对照组的41.38%(P<0.05);病例组HPV16阳性率为65.52%,高于对照组的27.59%,差异有统计学意义(P<0.05);GSTM1 null型联合HPV16阳性者宫颈癌的发病率显著高于仅GSTM1 null型者或仅HPV16阳性者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 GSTM1纯合缺失型与HPV16感染可能存在协同作用,两者联合与宫颈癌的发生密切相关。 展开更多
关键词 宫颈癌 基因多态性 谷胱甘肽硫转移酶M1 人乳头瘤病毒16
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血浆同型半胱氨酸与缺血性脑血管病患者颈动脉粥样硬化斑块的关系研究 被引量:4
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作者 王静 李彩娟 +6 位作者 赵毅玲 姚丽红 刘春凤 刘云双 孙迎燕 冯冲 王涛 《中国现代医生》 2019年第3期16-18,共3页
目的探讨血浆同型半胱氨酸(Hcy)浓度与缺血性脑血管病患者颈动脉粥样硬化斑块的关系。方法选择2017年1月~2018年6月治疗的缺血性脑血管病患者307例作为研究对象,所有患者均行颈动脉彩色多普勒超声检查,根据超声检查结果分为三组:A组(... 目的探讨血浆同型半胱氨酸(Hcy)浓度与缺血性脑血管病患者颈动脉粥样硬化斑块的关系。方法选择2017年1月~2018年6月治疗的缺血性脑血管病患者307例作为研究对象,所有患者均行颈动脉彩色多普勒超声检查,根据超声检查结果分为三组:A组(稳定斑块)、B组(不稳定斑块)、C组(无斑块);对其血浆Hcy浓度进行检测,采用SPSS Pearson相关性分析软件对血浆Hcy浓度与颈动脉粥样硬化斑块的关系进行分析。结果 307例患者中,C组68例(占比22.15%),有颈动脉斑块239例(占比77.85%),其中,B组81例(占比33.89%),A组158例(占比66.11%)。此外,D组112例(占比46.86%),E组127例(占比53.14%);A组与B组的血浆Hcy浓度显著高于C组(P<0.05);B组的血浆Hcy浓度显著高于A组(P<0.05);D组的血浆Hcy浓度显著高于E组(P<0.05);SPSS Pearson相关性分析结果表明:血浆Hcy浓度与颈动脉粥样硬化斑块呈正相关(P<0.05)。结论血浆Hcy浓度与缺血性脑血管病患者颈动脉粥样硬化斑块的形成以及稳定性均存在密切关联,加强血浆Hcy浓度测定可评估患者预后,指导临床治疗。 展开更多
关键词 血浆同型半胱氨酸 缺血性脑血管病 颈动脉粥样硬化斑块 关系研究
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GSTT1基因缺失、多态性与肺癌易感性的研究 被引量:2
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作者 王涛 卜晓波 +6 位作者 宋洁 韩彦龙 张书捷 邓代千 孙凯 王春涛 王静 《中国医学创新》 CAS 2019年第7期122-125,共4页
目的:探讨GSTT1基因缺失、多态性与肺癌易感性的关系及其临床意义。方法:选取2016年4月-2017年8月在本院接受治疗的84例肺癌患者为研究组,另选取100例健康人群作为对照组,采用多重PCR技术检测研究对象的GSTT1基因缺陷情况。比较两组GSTT... 目的:探讨GSTT1基因缺失、多态性与肺癌易感性的关系及其临床意义。方法:选取2016年4月-2017年8月在本院接受治疗的84例肺癌患者为研究组,另选取100例健康人群作为对照组,采用多重PCR技术检测研究对象的GSTT1基因缺陷情况。比较两组GSTT1基因缺陷情况,比较两组中吸烟与不吸烟者的GSTT1基因缺陷情况,比较鳞癌患者与对照组的GSTT1基因缺陷情况。结果:研究组GSTT1(-)型基因缺失情况多于对照组(P<0.05);研究组吸烟者中GSTT1(-)情况多于对照组(P<0.05);鳞癌患者中GSTT1(-)型基因缺失情况多于对照组(P<0.05)。结论:GSTT1基因缺失、多态性与肺癌易感性息息相关,GSTT1(-)基因型有增加患肺癌的可能性,且与吸烟患者存在交互作用,进一步的研究将更好地理解目标基因如何影响肺癌风险,对于肺癌的预防和治疗有重要意义。 展开更多
关键词 GSTT1基因缺失 多态性 肺癌易感性 临床意义
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山药多糖调节Wnt/β-catenin信号通路对2型糖尿病大鼠肾脏保护作用的研究
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作者 齐悦 关红军 +2 位作者 杨勇 张启慧 孙凯 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2022年第8期47-49,共3页
分析山药多糖调节Wnt/β-catenin信号通路对2型糖尿病大鼠肾脏的保护作用。方法:选取48只SPF级雄性SD大鼠,随机分为空白对照组、糖尿病肾病组(未给予药物干预)、阳性对照组(雷公藤灌胃,1.8 g/kg·d-1)、山药多糖高剂量组(山药多糖灌... 分析山药多糖调节Wnt/β-catenin信号通路对2型糖尿病大鼠肾脏的保护作用。方法:选取48只SPF级雄性SD大鼠,随机分为空白对照组、糖尿病肾病组(未给予药物干预)、阳性对照组(雷公藤灌胃,1.8 g/kg·d-1)、山药多糖高剂量组(山药多糖灌胃,100 mg/kg·d-1)、山药多糖中剂量组(50 mg/kg·d-1)、山药多糖低剂量组(25 mg/kg·d-1)6组,每组8只。结果:8周后,各模型组大鼠空腹血糖水平、肾功能指标以及Wnt-1、β-catenin、C-myc和COX-2的mRNA相对表达量均明显高于空白对照组,且山药多糖高剂量组上述指标均明显低于山药多糖中剂量组、山药多糖低剂量组及阳性对照组(P<0.05)。结论:山药多糖可降低Wnt1、β-catenin表达水平,抑制Wnt/β-catenin信号通路异常活化,从而起到对2型糖尿病大鼠肾脏的保护作用。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖尿病肾病 大鼠 山药多糖 WNT/Β-CATENIN信号通路
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生物技术实验中荧光分光光度计的应用 被引量:2
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作者 祝慧慧 刘洋 《微量元素与健康研究》 CAS 2013年第3期56-57,共2页
针对日立F-4600型荧光分光光度计波长扫描、时间扫描和三维扫描的调试方法及其在生物技术实验中的应用做一介绍。
关键词 荧光分光光度计 扫描方式 调试
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长链非编码RNA HAGLR对乳腺癌预后的影响及其竞争性内源RNA互作网络的构建
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作者 范苗苗 赵奇 +2 位作者 毕佳欣 刘馨璥 宋洁 《肿瘤研究与临床》 CAS 2023年第1期29-34,共6页
目的探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表... 目的探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况,按HAGLR表达水平,将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组,采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况,并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因,将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站,进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA,通过Cytoscape3.8软件构建HAGLR的ceRNA网络。结果HAGLR基因定位于2q31.1,主要分布于细胞质;HAGLR在乳腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.001)。对lnCAR数据库和UCSC Xena数据库分析均显示,HAGLR高表达组OS较低表达组均差(均P<0.01);lnCAR数据库中HAGLR高表达组无转移生存较低表达组差(P=0.030)。前200个HAGLR共表达基因中与HAGLR负相关基因129个,与HAGLR正相关基因71个。KEGG通路分析显示,HAGLR与代谢通路、MAPK信号通路、JAK-STAT信号通路及癌症通路有关;GO注释分析显示,HAGLR主要富集在细胞周期、着丝粒复合体组装、有丝分裂进程、蛋白激酶结合、激酶活性的调节、细胞对DNA损伤刺激的反应等多种功能中。hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-1245b-5p、hsa-miR-182b-5p、hsa-miR-512-3p、hsa-miR-302b-3p、hsa-miR-185b-5p、hsa-miR-106b-5p为HAGLR靶向miRNA。结论HAGLR在乳腺癌组织中高表达,其可能是乳腺癌预后预测的生物标志物。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 医学信息学 RNA 长链非编码 HAGLR 竞争性内源RNA 预后
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口腔鳞状细胞癌机制研究 被引量:4
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作者 祝慧慧 刘洋 周晶琳 《微量元素与健康研究》 CAS 2013年第1期21-22,共2页
针对PD-1和PD-L1分子、p53和bcl-2蛋白、热休克蛋白70等表达水平情况与口腔鳞状细胞癌之间的关系进行探讨,深入研究口腔鳞状细胞癌发生机制。
关键词 鳞状细胞癌 口腔癌 机制
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儿童孤独症父母干预探究
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作者 祝慧慧 公长春 刘洋 《微量元素与健康研究》 CAS 2013年第2期17-18,共2页
针对儿童孤独症治疗原则之一,也就是家庭参与,让父母也成为治疗的合作者或参与者的实验研究进行深入探讨,以期为儿童孤独症的治疗提供有益的基础数据。
关键词 孤独症 儿童 父母干预
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原发性高血压与糖基化修饰相关研究进展 被引量:1
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作者 张萌萌 代海兵 +3 位作者 王菡 邓代千 宋洁 刘侠 《中华高血压杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期133-137,共5页
高血压是以体循环舒张压和收缩压不断增高为主要表现,伴随各种心脑血管病的综合征,严重威胁着人类的健康。我国95%的高血压属于原发性高血压(essential hypertension, EH),其促发了脑卒中、心肌梗死、充血性心力衰竭及慢性肾脏病的高发... 高血压是以体循环舒张压和收缩压不断增高为主要表现,伴随各种心脑血管病的综合征,严重威胁着人类的健康。我国95%的高血压属于原发性高血压(essential hypertension, EH),其促发了脑卒中、心肌梗死、充血性心力衰竭及慢性肾脏病的高发生率和死亡率[1]。2010年,全球成人高血压患病率为31.1%,约13.9亿人[2-3];2013-2016年美国年龄>20岁成年人平均高血压患病率为46.0%[4]. 展开更多
关键词 高血压患病率 慢性肾脏病 原发性高血压 充血性心力衰竭 心脑血管病 HYPERTENSION 糖基化修饰 心肌梗死
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