CDK12在甲状腺乳头状癌中的表达及临床病理意义

目的基于生物信息学探究细胞周期蛋白依赖性激酶12(Cycle protein-dependent kinase 12,CDK12)在甲状腺乳头状癌(Papillary thyroid carcinoma,PTC)中的表达及其临床病理意义,为PTC分子生物标志物筛选提供理论依据。方法利用Sanger学术平台(http://www.sangerbox.com)分析CDK12在PTC和正常甲状腺组织中的差异表达情况;使用UALCAN(https://ualcan.path.uab.edu/)分析CDK12与PTC患者临床病理特征之间的关系;使用ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)评估CDK12作为PTC患者诊断的临床价值;使用卡普兰-迈尔生存分析(Kaplan-Meier)预测CDK12对PTC患者预后的影响;采用基因本体(gene ontology,GO)分析CDK12的功能;利用Reactome在线数据库及GSEA富集预测CDK12相关通路;利用CIBERSORT在线分析CDK12与免疫细胞浸润相关性;临床收集21例在牡丹江医学院附属红旗医院接受诊治的PTC病人手术切除的肿瘤组织,采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和蛋白质印迹实验(Western Blot)检测PTC和癌旁组织中CDK12的表达情况。结果CDK12 mRNA在PTC组织中低表达;CDK12的表达与性别、年龄、种族、淋巴结转移等存在相关性;ROC曲线的AUC为0.774(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析显示CDK12高表达患者生存时间更短;GO富集分析显示CDK12与DNA模板转录延伸正调控等功能相关;Reactome数据库和GSEA富集分析显示CDK12高表达显著富集于p53信号通路并且起下调作用;CIBERSORT分析显示CDK12与初始B细胞等正相关、与浆细胞等负相关;qRT-PCR结果显示:CDK12 mRNA在PTC组织中低表达(P<0.0001);Western blot结果显示:CDK12蛋白在PTC组织中的表达显著高于配对癌旁组织(P<0.0001)。结论CDK12 mRNA在PTC组织中低表达,CDK12蛋白在PTC组织中高表达,且与患者预后不良相关,可作为PTC早期诊断及预测预后的标志物之一。