高校文献检索与科技论文写作课程的教学改革——以琼台师范学院生物学类本科专业为例

文献检索与科技论文写作是一门培养学生信息知识获取能力、科技论文写作和创新实践能力的课程,旨在为学生完成本科毕业论文和在以后的职业生涯中撰写论文奠定基础。文章以琼台师范学院生物学类本科专业为例,对文献检索与科技论文写作课程教学过程中存在的主要问题及其产生原因进行分析,提出生物学类本科专业应从转变学生观念、引入课程思政元素、采用多元化教学方式、优化实践教学内容和改革课程考核方式、提高授课教师的素质和能力、收集教学反馈信息等方面,对该课程进行教学改革,从而达到提升该课程教学效果和教学质量的目的。

湖南莽山国家级自然保护区不同海拔梯度隐翅虫物种多样性分布格局

【目的】海拔梯度对昆虫物种的分布和维持具有重要的影响。本研究通过探索保护区不同海拔梯度隐翅虫物种多样性的变化规律及其分布特征,为研究海拔梯度对昆虫分布的影响提供理论基础。【方法】于2020年5月-2021年4月,在湖南莽山国家级自然保护区采用飞行阻隔器、马氏网和诱罐3种被动式采集装置调查了在500-800 m(Ⅰ),800-1100 m(Ⅱ),1100-1400 m(Ⅲ)和1400-1700 m(Ⅳ)4个海拔梯度的隐翅虫物种。采用Excel 2016及past 3分析了不同海拔梯度隐翅虫物种多样性、群落结构相似性以及物种多度。【结果】于2020年5月-2021年4月,在湖南莽山国家级自然保护区共采集记录隐翅虫2135头,隶属9亚科45属111种,其中隐翅虫亚科(Staphylininae)物种最多(25属63种),突眼隐翅虫亚科(Steninae)和异形隐翅虫亚科(Oxytelinae)物种最少(均1属1种)。隐翅虫物种Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数、Berger-Parker优势度指数、Pielou均匀度指数分别为3.8280,2.3920,0.1217和0.4140。不同海拔梯度隐翅虫物种多样性指数存在差异,海拔梯度Ⅲ的物种数、个体数、Shannon-Wiener多样性指数和Margalef丰富度指数显著高于海拔梯度Ⅰ的。海拔梯度Ⅰ的隐翅虫物种贫乏,优势种突出,其群落结构相对稳定;海拔梯度Ⅱ为低海拔向中海拔的过渡梯度;海拔梯度Ⅲ的隐翅虫物种丰富,群落结构复杂,优势种较为突出且分布集中,群落结构相对较不稳定;海拔梯度Ⅳ相对于海拔梯度Ⅲ而言,隐翅虫物种相对贫乏。海拔梯度Ⅲ与梯度Ⅳ的隐翅虫物种相似性系数最高,为中等相似,其他海拔梯度间均为中等不相似。【结论】本研究结果说明,在不同海拔梯度间隐翅虫分布特征差异较大,总体隐翅虫物种丰富程度呈现单峰模式。低海拔地区隐翅虫物种贫乏,群落结构单一;中海拔地区物种丰富,群落结构复杂,优势种突出;高海拔相对于中海拔地区隐翅虫物种相对贫乏;中高海拔与高海拔地区隐翅虫物种相似性系数最高。

基于综合能力培养的生物化学教学创新与实践

针对生物化学教学过程中存在着教学方法单一、代谢途径复杂、缺乏前沿性、忽略创新培养、课程考核机制单一、缺乏能力评价体系等教学“痛点”问题,该教学团队以学生为中心,以综合能力培养为目标,对生物化学课程进行教学改革创新。主要有以下举措:一是构建师生学习共同体,开展线上线下、课内课外深度融合的混合式教学;二是重构教学体系,渗透专业思想,反映学科前沿,注重课程思政;三是进行实践教学改革,注重创新能力培养,发挥课程育人功能;四是建成多元考核评价体系,常态化反馈改进。通过以上改革,不但有效解决教学中存在的“痛点”问题,而且实现学生综合能力的培养,落实立德树人的根本任务。

海洋院校生物化学课程思政库的探索与实践

生物化学是海洋院校生命科学、生物技术、生态学、食品科学与工程等专业课程体系中的主干或专业基础课,在海洋类人才培养过程中发挥重要作用。在“四新”建设背景下,以学生知识、能力、素养协同发展为目标,在海洋类院校开展生物化学课程思政建设,是落实高校全员、全程、全方位培养青年海洋人才的重要途径。以生物化学课程为例,充分挖掘、提炼其蕴含的思政元素,构建具有海洋特色的生物化学课程思政元素案例库,开展课程思政教育的探索和实践,在将专业知识与思政元素有机融合,实现知识传授、能力培养和价值引领的“同频共振”。

斑马鱼肌肉Smyd1a蛋白生物信息学分析

通过使用美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库检索出斑马鱼Smyd1a蛋白的氨基酸序列信息,对其进行生理生化分析,并通过NBCI寻找同源性高的不同种属的序列构建系统发育树。结果显示:Smyd1a蛋白的氨基酸数量是489个,分子量是56376.54 Da,理论等电点是6.27;该蛋白中,谷氨酸(Glu)含量最高,为8.4%;其次是亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),分别为8.0%和7.0%。Smyd1a是一个亲水蛋白质,但不是一个分泌蛋白,不存在跨膜螺旋区域,存在蛋白质的无规则卷曲等构象,Smyd1a属于SET家族。

植物生物学课程思政元素挖掘与实施路径探析

植物生物学是高等学校生物类专业的一门专业基础必修课程,因此,在开展课程思政方面有着不可替代的优势和引领作用。该文通过挖掘和提炼植物生物学课程中的思政元素,并将家国情怀、科学精神和生态文明等思政元素有机融入课程中,并对课程思政实施路径进行探索,以期为高校同类课程的课程思政开展提供借鉴和参考。

篦子三尖杉在中国的地理分布及潜在分布区预测

【目的】预测不同气候情景下篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri Mast.)的地理分布格局,为其资源保护、合理利用与开发提供指导,也为其起源与地理演化研究奠定基础。【方法】基于100个分布点信息与19个气候因子,采用BIOCLIM模型构建当前(1970—2000年)以及未来(CO_(2)浓度倍增)篦子三尖杉的地理分布趋势,并采用主成分分析法分析影响其地理分布的主要气候因素。【结果】篦子三尖杉在中亚热带地区以低海拔分布为主。BIOCLIM模型结果显示:在当前气候条件下,篦子三尖杉最佳适生区集中在湖南、湖北、贵州和重庆;未来气候变化情境(CCM3)下,其潜在分布面积将减小,并有向西迁移的趋势;该模型受试者工作特征曲线下的面积为0.911±0.023,预测精度较高。主成分分析结果表明:温度季节性、气温年较差和昼夜温差与年温差比值是限制篦子三尖杉地理分布的主要因素,且温度因子的作用大于水分因子。【结论】随着全球气候变暖,篦子三尖杉的适生区有破碎化及丧失的风险,应重视对该物种的动态监测及迁地保护。

金鲳鱼肠炎病的病原菌分离鉴定及其中草药防治

从具有肠道糜烂、肛门突出体外病症的金鲳鱼(Trachinotus ovatus)体内筛选致病菌株,分离纯化获得菌株05A。通过活菌注射金鲳鱼腹腔回归感染试验,确定菌株05A为致病菌株。经单菌落形态特征、生理生化指标以及16S rRNA分子鉴定,确定其为哈维氏弧菌(Vibro harveyi)。中草药的体外抑菌实验表明,大蒜、儿茶、五倍子和石榴皮等4种中草药对病原菌05A有较好的抑菌效果,其次是仙鹤草、黄连、黄芩、甘草、大黄、五味子和诃子。

基于CNKI数据库与VOSviewer的中国古树研究分析

目的:古树是一种特殊的生物资源,兼具自然与人文属性,对科研、教育和文化传承具有重要意义。应用可视化方法分析梳理新世纪以来国内古树领域的研究进展、研究热点及前沿趋势。方法:检索中国知网(限中文核心和/或CSCD期刊)收录的古树相关文献,应用VOSviewer对文献来源分布情况、发文作者与研究机构、关键词进行可视化分析。结果:中国古树研究的发文量呈现“起步—兴盛—回落”3个阶段,其中发文量在2013年达到高峰。《安徽农业科学》《福建林业科技》和《浙江农林大学学报》发文量较大。高被引用论文显示,与古树资源调查相关的论文占较大的比例。中国古树研究的学者关系呈现出团队少、人数少、关系松散的格局。结论:当前国内古树的研究仍需进一步提升,加强机构与人员之间的合作。衰老机理、遗传多样性、环境相关性、大尺度空间格局等研究可能会成为未来古树研究的热点。

台湾泥鳅腐皮病霍乱弧菌的分离与鉴定

为研究台湾泥鳅(Paramisgumus dabryanus ssp.)腐皮病的病原,对其腐皮等病变部位进行细菌分离纯化,获得1株优势菌株,命名为P1,利用革兰氏染色观察其形态特征,利用PCR扩增技术、16S rRNA基因测序,得到病原菌的序列,用MEGA软件构建系统进化树,再结合生理生化分析结果鉴定菌种名称。结果发现:革兰氏染色阴性,弧形,两端钝圆;菌体长1~1.5μm,宽度1~1.2μm,有菌丝和鞭毛,16S rRNA基因1 395 bp。建立系统进化树后发现,P1与霍乱弧菌处于同一分支;生理生化实验结果与霍乱弧菌一致,从而鉴定该菌株为霍乱弧菌(Vibrio cholerae)。药敏实验结果表明,该分离菌株对头孢哌酮、卡那霉菌、万古霉素等10种抗生素高度敏感;对四环素中度敏感;对呋喃唑酮、复方新诺明、克林霉素等17种抗生素耐药。实验结果为台湾泥鳅腐皮病的病原鉴定与药物防治提供参考。

池塘高密度养殖条件下巴沙鱼生长性状研究

巴沙鱼是一种重要热带淡水经济鱼类,对生长环境要求不高,生长速度快,非常适合在中国南方地区推广.为了解巴沙鱼的生长速度,本实验测量了高密度池塘养殖模式中2、3、5、6、7月龄巴沙鱼的全长、体重,绘制巴沙鱼全长与体重的生长关系曲线,并计算肥满度.实验结果丰富了巴沙鱼的生长参数,为巴沙鱼的大面积推广打下理论基础.

抗菌肽SK_(66)的生物信息学分析

从数据库中检索出CG13551基因氨基酸序列信息,生理生化分析显示:SK_(66)蛋白含有107个氨基酸残基,分子量约11948.3Da,理论等电点为8.96。该蛋白中,甘氨酸(Gly)含量最高,为14.0%;其次为谷氨酸(Glu)和丙氨酸(Ala),分别为11.2%和9.3%。SK_(66)蛋白是一个亲水蛋白质但不是一个分泌蛋白。SK_(66)蛋白不存在跨膜结构域。蛋白质二级结构包括57.96%α-螺旋、10.28%β-折叠、β-转角以及31.78%无规则卷曲等构象。进化树显示,主要分成两类,较为高等的动物分为第一类,包括人、小鼠、河豚;而较为低等的动物归为一类,包括斑马鱼、果蝇。这与物种的进化程度相一致。

海口羊山湿地盘星藻属植物的数量分类学研究

应用聚类分析的方法,选取24个性状对13种(含变种)海口羊山湿地盘星藻属植物进行数量分类学研究,对性状数据进行R型聚类分析和主成分分析,对盘星藻种类进行Q型聚类分析。结果显示:所选用的多数性状指标较分散,具有相对的独立性,说明各性状的选取较为合理。24个性状可综合为7个主成分,累计贡献率达91.253%,其中贡献率较大的性状为外层细胞顶部与基部的宽窄程度、外层细胞之间侧壁连接程度、外层细胞两侧边情况、外层细胞角突数目和角突长度。13个种(含变种)可分为5组,第1组主要特征为外层细胞近四棱形并具2个角突;第2组为细胞壁具颗粒纹,外层细胞呈5~6边形,并具2个角突;第3组为外层细胞具有1个角状突起;第4组为内层细胞为近四棱形;第5组为外层细胞呈卵形。外层细胞形态、内层细胞形态、角突及细胞壁颗粒纹等性状对盘星藻属植物的形态分类具有重要作用。

基于MaxEnt模型的菊科植物一枝黄花在中国适生性分析

利用一枝黄花在中国分布点的285条地理分布信息及20个环境因子,采用最大熵(Max Ent)模型结合地理信息系统(GIS)对其在中国适宜性分布区进行预测。研究结果:Max Ent模型预测精度较高,10次Max Ent模拟的训练数据和测试数据的AUC平均值分别为0.976和0.978,符合预测要求。综合分析得出影响一枝黄花生长的主导因子共7个。其中,最重要的环境数据是最干季降雨量和最热季平均降雨量,二者累计贡献率达85.2%。一枝黄花的全国适宜性分布区域与中国植物志的记载稍有不同,最适宜生长地区主要分布于江西、福建、广西、广东和台湾地区等地;中国植物志未记载的东北地区以及华北地区亦有分布,主要为中低适宜生长区。该研究结果对一枝黄花扩大种植面积和提高栽培技术等实践工作具有指导意义。

基于功能群分类法的海口市红城湖浮游植物群落特征分析

比较3种浮游植物功能群分类方法,探讨各方法中生物对环境变化的有效性,为红城湖水资源管理与水质改善提供理论基础。分别于2016年11月、2017年3月、2017年7月对海口市红城湖浮游植物群落进行调查,采用CCA方法对浮游植物FG、MFG、MBFG功能群和水体环境因子进行分析。结果表明:FG、MFG、MBFG功能群具有季节演替特征,其主要影响因子为水温、p H、电导率、总可溶性氮。3种功能群对环境均具有较好的解释度和相关性,其中FG和MFG功能群对环境的解释度优于MBFG功能群。功能群生物对总磷识别的灵敏度低于以传统分类法鉴定的优势种。在水域生态学研究中,需要将功能群划分法与传统分类法相结合。

海口市美舍河丰水期浮游植物群落结构特征及其水质评价

为了解热带城区河流浮游植物群落结构特征,于2017年9月对海南省海口市美舍河及其上游沙坡水库进行采样调查。结果表明,浮游植物种类数共有89种,种类组成以绿藻、硅藻和蓝藻为主。上游以细小平裂藻为主要优势种,中游以梅尼小环藻、尖尾蓝隐藻、小球藻为主,下游以细鞘丝藻和谷皮菱形藻为主。NMDS排序分析显示,浮游植物群落结构呈现一定的空间特征。采用浮游植物群落结构特征对美舍河水质评价,显示调查水体处于中污染状态,浮游植物群落结构组成能反映水体的生境现状。该研究为热带城区河流生态系统监测评价提供基础资料,为河流生态修复提供理论依据。

海口市红城湖轮虫群落结构特征分析

于2016年11月、2017年3月及2017年7月对海口市红城湖的轮虫和水质因子进行了调查分析,明晰轮虫的群落结构特征。结果显示,3次样品中共鉴定轮虫18种,轮虫的密度呈现一定的时间和空间变化特征。疣毛轮虫(Synchaeta sp.)在3个月份中均为优势种;微齿角突臂尾轮虫(Brachionus angularis bidens)仅在2016年11月为优势种;圆筒异尾轮虫(Trichcerca cylindrica)、角突臂尾轮虫(Brachionus angularis)、裂痕龟纹轮虫(Anuraeopsis fissa)、晶囊轮虫(Asplanchna sp.)在2016年11月和2017年3月均为优势种;鼠异尾轮虫(Trichocerca rattus)在2017年3月和7月为优势种;热带龟甲轮虫(Keratella tropica)和十字龟甲轮虫(Keratella cruciformis)仅在2017年7月为优势种。轮虫优势种群落结构和环境因子CCA分析显示,pH值(P<0.001)和电导率(P<0.001)为显著解释性的环境变度。

VR技术在植物分类学课程中的应用

信息技术的不断发展有效地提升了高校课程的教学效果,尤其是虚拟现实技术(VR)与课程的深度融合产生了划时代的教育新范式。高校植物分类学课程教学中,为培养学生分类观察与分析能力,应用VR技术,构建虚拟植物标本馆、模拟植物分类环境、助力野外采集与标本制作,可提升植物分类学课程教学效果,提高学生学习兴趣与积极性,培养学生的空间想象力,丰富标本资源,拓展课程知识。

尖孢镰刀菌古巴专化型胱硫醚γ-合成酶的功能分析

甲硫氨酸在真菌、细菌和植物的生物学过程中起着重要作用。禾谷镰刀菌Fusarium graminearum的FgMETB基因编码一个胱硫醚γ-合成酶,是甲硫氨酸合成所必需的。本研究利用同源重组的方法,在尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种Fusariumoxysporumf.sp.cubenserace4(Foc4)获得了FgMETB同源基因FoMETB的敲除突变体菌株;与野生型菌株相比,突变体菌株ΔFoMETB在以SO_(4)^(2-)为唯一硫源的基本培养基(minimal medium)上不能生长。1 mmol/L甲硫氨酸的添加恢复了突变体菌株ΔFoMETB的生长,但半胱氨酸的添加不能恢复该缺失突变体的生长,说明FoMETB的敲除阻遏了Foc4半胱氨酸转化甲硫氨酸的通路。此外,ΔFoMETB的气生菌丝和菌丝干重明显减少、分枝增多、产孢量显著降低、疏水性缺失和对巴西蕉组培苗的致病性显著减弱。由此表明,FoMETB参与调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生理特性和致病性,甲硫氨酸合成途径的关键合酶FoMETB有望成为新的抗真菌药物靶标。

香蕉枯萎病菌Argonaute基因功能分析及其调控小RNA发生

尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f.sp.cubense是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌,其中4号生理小种(Foc4)能感染几乎所有的栽培品系。Argonaute蛋白(AGO)介导的RISC复合体在RNAi干扰中起到重要作用。Foc4含有两个进化上高度保守的AGO蛋白,本研究利用同源重组技术获得了Δago1、Δago2和Δago1/2基因缺失突变体,并对其突变体的生物学表型、非生物胁迫、致病力及小RNA发生进行分析。与Foc4相比,缺失突变体不影响菌丝的营养生长,但是分生孢子产量下降,对巴西蕉的致病力明显减弱。其次,在hpRNA诱导的基因沉默中,AGO1主要负责产生siRNA介导基因沉默。最后,sRNA测序显示,缺失突变体的sRNA长度分布和5'-端首位碱基出现频率都发生了改变,并且都能产生自身特异性miRNAs。另外,本研究还鉴定到不依赖AGOs形成的miRNA。这些结果说明Foc4的AGOs在调控产孢量、非生物胁迫、致病力,以及小RNA发生中发挥作用。本研究为揭示Foc4小RNA发生的分子遗传机制奠定理论基础。