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尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
被引量:
7
1
作者
丁兆建
吴小霞
+3 位作者
孙君梅
陈丽霞
傅琪彦
许天委
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期1090-1098,共9页
尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f. sp. cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌。丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK)FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致...
尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f. sp. cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌。丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK)FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致病性方面发挥着重要作用。为了揭示FoSlt2信号通路的致病机理和寻找农药靶标,本研究利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和FoSlt2敲除突变体菌株的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 164个,其中上调表达基因有1 184个,下调表达基因有980个。Gene Ontology(GO)功能分析结果表明,差异表达基因主要参与在结合、催化分子功能组和代谢过程、细胞过程生物学通路中。KEGG功能富集分析结果表明,差异基因主要参与戊糖和葡糖醛酸盐转换、氨基糖和核苷酸糖、氨基葡聚糖降解、磷酸肌醇和碳类物质代谢通路,说明这些通路与尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育和致病性相关。该研究为尖孢镰刀菌古巴专化型致病机制的阐明奠定了理论基础。
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关键词
香蕉枯萎病
尖孢镰刀菌古巴专化型
高通量测序
差异表达基因
原文传递
题名
尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
被引量:
7
1
作者
丁兆建
吴小霞
孙君梅
陈丽霞
傅琪彦
许天委
机构
琼台师范学院生物教研室
中国热带农业科
学院
环境与植物保护研究所
海南职业技术
学院
热带农业技术
学院
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期1090-1098,共9页
基金
国家自然科学基金(31801690)~~
文摘
尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f. sp. cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌。丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK)FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致病性方面发挥着重要作用。为了揭示FoSlt2信号通路的致病机理和寻找农药靶标,本研究利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和FoSlt2敲除突变体菌株的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 164个,其中上调表达基因有1 184个,下调表达基因有980个。Gene Ontology(GO)功能分析结果表明,差异表达基因主要参与在结合、催化分子功能组和代谢过程、细胞过程生物学通路中。KEGG功能富集分析结果表明,差异基因主要参与戊糖和葡糖醛酸盐转换、氨基糖和核苷酸糖、氨基葡聚糖降解、磷酸肌醇和碳类物质代谢通路,说明这些通路与尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育和致病性相关。该研究为尖孢镰刀菌古巴专化型致病机制的阐明奠定了理论基础。
关键词
香蕉枯萎病
尖孢镰刀菌古巴专化型
高通量测序
差异表达基因
Keywords
Fusarium wilt of banana
Fusarium oxysporum f. sp. cubense
high-throughput sequencing
differential expressed genes
分类号
S436.68 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
丁兆建
吴小霞
孙君梅
陈丽霞
傅琪彦
许天委
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
7
原文传递
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