甘肃省2起传染源不明人间鼠疫疫情分离菌株分子流行病学分析

目的对甘肃省2起传染源不明的人间鼠疫疫情分离菌株进行溯源分析,为针对鼠疫传染源隔离防控提供依据。方法采用差异区段(DFR)和规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)对2017年12月12日和2019年9月27日发生的2起人间鼠疫疫情分离的鼠疫菌进行基因分型。采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法确定待测鼠疫菌VNTR位点的重复数,应用BioNumerics 6.6软件中最小生成树法聚类分析确定待测菌株在甘肃省鼠疫疫源地分离鼠疫菌的系统发育树位置。结果菌株20171212缺失DFR01、DFR02、DFR03、DFR04、DFR13、DFR23,DFR分型为8型;CRISPR间区序列YPa为a1'-a2-a3-a4-a5-a6-a7-a35,YPb为b1-b2-b3-b4,YPc为c1-c2-c3,基因簇为Ca35',基因型为26';MLVA聚类分析显示菌株聚在肃北县鱼儿红牧场簇内,并成为独立分支;菌株20190927缺失DFR01、DFR13、DFR23,DFR分型为1b型;CRISPR间区序列YPa为a1-a2-a3-a4-a5-a6-a7,YPb为b1-b2-b3-b4,YPc为c1-c2-c3,基因簇为Ca7,基因型为22型;MLVA聚类分析在最小生成树的位置靠近阿克塞县当金山簇,与肃北县鱼儿红牧场簇较远。结论菌株20171212的DFR和CRISPR基因型与肃北县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫菌的主基因型一致,证实人间疫情病例由本地自然发生,但最小生成树中聚在肃北县鱼儿红牧场簇内,表明病例最初接触传染源地方不是盐池湾乡,而是肃北县鱼儿红牧场周边范围内。菌株20190927的DFR和CRISPR基因型与阿克塞县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫菌的主基因型一致,且最小生成树位置上更靠近阿克塞县当金山簇,与肃北县鱼儿红牧场簇较远,证实2019年人间疫情病例是放牧地方接触传染源。

现阶段甘肃省鼠疫疫情形势与防控策略探讨

甘肃省鼠疫自然疫源地面积大、分布广,各疫源地鼠疫流行状态不尽相同。有些鼠疫自然疫源地已静息多年,处于稳定控制状态;有些鼠疫自然疫源地动物间鼠疫流行比较活跃,每年都能分离到几十株鼠疫耶尔森菌,动物间鼠疫不时波及人间,且发生的人间鼠疫病例中重症多,病程短,病死率高。近年来,随着进入鼠疫自然疫源地从事放牧、工程建设等外来务工人员剧增,主动接触旱獭、野兔、牧羊犬等染疫动物的机会增加,由此导致人间鼠疫病例增多。除此之外,非法猎捕、贩运、销售旱獭的行为屡禁不止,导致一年四季均可发生人间鼠疫。为此,甘肃省各级党委政府及卫生行政部门,根据动物间及人间鼠疫流行特征制定了适合本地区的鼠疫防控策略。本文通过探讨现阶段甘肃省鼠疫疫情特征和采取的防控策略,为今后优化鼠疫防控策略提供科学依据和理论指导。

2011-2018年甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫流行特征分析

目的掌握甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫流行特征,为结合当地实际,创新开展鼠疫防控工作提供科学依据。方法采用回顾性研究,收集2011-2018年甘肃省鼠疫自然疫源地监测数据(来源于甘肃省疾病预防控制中心疫情监测档案、网络直报信息)。采用描述性流行病学方法,分析2011-2018年甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地的鼠疫流行特征,包括宿主动物分布情况、鼠疫菌的病原学及血清学检测结果、人间鼠疫流行特征等。结果2011-2018年,甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地总平均獭密度为0.21只/hm_(2),其中天祝县平均獭密度最高,为0.58只/hm_(2);嘉峪关市平均獭密度最低,为0.01只/hm_(2)。疫源地内共分离鼠疫菌381株,其中分离自人尸4株、宿主动物298株、染疫媒介79株;分离菌株前3位的县(市)依次为阿克塞县(38.85%,148株)、肃北县(31.50%,120株)、玉门市(16.27%,62株)。共检测旱獭血清6860份、犬血清1769份,F1抗体阳性率分别为2.70%(185/6860)、8.42%(149/1769);动物材料814份,F1抗原阳性率为4.30%(35/814)。共发生人间鼠疫4起,发病4人,死亡4人;其中3起发生在肃北县、1起在玉门市;发病月份分别为7、9、11、12月,主动接触牧羊犬等染疫动物是主要感染途径,外来放牧雇工为重点职业人群。结论甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地动物间疫情活跃,且各地区鼠疫疫情呈现不同流行状态;应采取因地制宜、分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。

甘肃省肃北、肃南县鼠疫疫源地气象因素对鼠疫流行影响的非线性效应

目的分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地内气象因素对鼠疫流行的影响。方法收集1973-2016年肃北、肃南2个县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫监测资料(来源于甘肃省疾病预防控制中心)和当年及领先1、2、3年(相对于当年作为参照的前1、2、3个年份)的气象因素(年均降雨量、气温、相对湿度)资料(来源于中国气象数据共享服务网)。采用R2.3.2软件,以年鼠疫检菌阳性率为因变量,气象因素为自变量建立时间序列半参数广义相加模型(generalized additive model,GAM),采用非线性效应关系定量研究气象因素对鼠疫的影响。结果2006-2016年与1974-1983年相比,年均气温、相对湿度、降雨量的平均值肃北县分别上升了0.99℃、3.55%RH、12.16 mm;肃南县分别上升了1.00℃、2.01%RH、14.60 mm。1973-2016年共发生11起人间鼠疫,发病12例,死亡7例。肃北县鼠疫疫源地内领先3年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm,动物鼠疫发生增加0.40%;领先2年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH,动物鼠疫发生增加11.66%。肃南县鼠疫疫源地内领先1年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm,动物鼠疫发生增加1.32%;领先3年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH,动物鼠疫发生增加11.96%。另外,肃北、肃南县领先2年年均气温在一定范围内每升高1.00℃,动物鼠疫发生分别增加73.17%、70.18%。结论甘肃省肃北、肃南县鼠疫的发生流行与气象因素关系密切,一定范围内的年均气温上升对鼠疫的流行不仅有明显的促进作用,而且存在滞后效应。另外,同一疫源地内不同类型气候对动物鼠疫流行的影响存在一定差异。

甘肃省鼠疫疫源地啮齿动物DNA条形码分析

目的探讨DNA条形码技术在甘肃省鼠疫疫源地啮齿动物分类和鉴定中的可行性。方法 2017年在甘肃省鼠疫疫源地及非疫源地采集啮齿动物肝脏标本,并保存整只,制作标本,提取基因组DNA,采用通用引物PCR法扩增细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因并测序。将测序结果与GenBank中物种的DNA条形码进行BLAST比对,并构建分子进化树。结果在甘肃省9个市(区、县)的4类不同生境中共采集啮齿动物164只,其中鼠科3种,跳鼠科2种,仓鼠科4种,松鼠科3种,沙鼠科、鼢鼠科和兔形目的鼠兔科各1种。通过164个样本所构建的分子进化树形成15个高度支持的分支,与形态鉴定结果一致。结论 DNA条形码可用于啮齿动物标本的准确鉴定,能更好地研究啮齿类的分类及进化关系。

甘肃省肃北、肃南县旱獭鼠疫疫源地旱獭及其寄生蚤数量与气象因素的关系

目的分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地旱獭及其寄生蚤数量与气象因素的关系。方法收集甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭疫源地1982-2016年鼠疫监测资料(来自甘肃省疾病预防控制中心),以及同期年均温度、降雨量、相对湿度等气象因素资料(来自中国气象数据共享服务网)。采用SAS 9.3软件进行旱獭密度、体蚤指数与气象因素的相关性分析;采用R2.3.2软件,分别以当年及领先1、2、3年(相对于当年作为参照的前1、2、3个年份)气象数据为自变量,旱獭密度为因变量,建立时间序列半参数广义相加模型(GAM),定量研究气象因素对鼠疫宿主(旱獭)密度影响的非线性效应关系。结果1982-2016年,甘肃省肃北县旱獭密度为0.29~6.63只/hm^2,体蚤指数范围为0.04~4.56;肃南县旱獭密度为1.22~7.92只/hm^2,体蚤指数范围为0.06~0.42。肃北县旱獭密度分别与领先1年年均降雨量、相对湿度呈正相关(r=0.43、0.36,P均<0.05),与当年及领先1、3年年均温度呈负相关(r=-0.58、-0.55、-0.41,P均<0.05);肃南县旱獭密度分别与当年相对湿度,领先1年年均降雨量、相对湿度呈正相关(r=0.36、0.57、0.43,P均<0.05)。肃北县体蚤指数与当年及领先1、2、3年年均温度呈负相关(r=-0.57、-0.43、-0.31、-0.37,P均<0.05);肃南县体蚤指数与当年及领先1、2、3年年均温度呈负相关(r=-0.71、-0.46、-0.38、-0.40,P均<0.05)。GAM结果显示,在控制其他因素的影响后,肃北县当年年均降雨量每升高1 mm,该地区旱獭密度增加0.93%;领先3年年均相对湿度每升高1%,该地区旱獭密度增加25.34%。肃南县领先3年年均降雨量每升高1 mm,该地区旱獭密度增加1.69%。结论甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地内旱獭密度变动与降雨量和相对湿度关系密切,且影响存在不同的滞后效应;地表温度是影响寄生蚤数量变动的重要因子。

1962-2018年甘肃省黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫流行病学特征动态变化分析

目的分析1962-2018年甘肃省黄鼠疫源地鼠鼠疫自然疫流行病学特征,为鼠疫防控提供依据。方法整理1962-2018年甘肃省黄鼠鼠疫自然疫源地疫情监测资料和疫情总结资料,采用描述性统计方法对鼠疫流行病学特征进行分析,包括人群地区分布、时间分布和动物地理分布、染疫动物及媒介等。结果1962-2018年,甘肃省黄鼠疫源地内仅1962年发生1起人间鼠疫,本次疫情共发病26例,死亡11例,发病率为29.89%(26/87),病死率为42.31%(11/26)。病例主要分布在会宁县刘寨乡、新塬乡,发病时间为7-8月份。1962-2018年,甘肃黄鼠疫源地共出现2次动物间鼠疫流行高峰,检菌地区分布于会宁县刘寨乡北部地区及接壤的平川区种田、复兴2个乡镇,判定动物疫点5处。染疫动物种类为黄鼠和沙狐,染疫媒介种类为方形黄鼠蚤蒙古亚种和阿巴盖新蚤,动物鼠疫流行时间为4-8月份;黄鼠血清F1抗体阳性115份,其中会宁县检出阳性血清92份、平川区检出阳性血清23份,分布于2个县(区)5个乡镇的11个村;疫源地内共发现动物30种,隶属5目11科5亚科21属,黄鼠占绝对优势,占历年调查啮齿类动物总数的69.1%(2464/3567);共调查疫源地12482.9 hm^2,捕黄鼠9709只,平均密度为0.78只/hm^2。结论甘肃黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫呈间歇性流行状态,应根据变化情况及时调整防控策略,在居民区应主动加强鼠情监测和人间鼠疫防护知识的宣传教育。

甘肃省鼠疫耶尔森菌规律成簇间隔短回文重复序列位点多态性分析及地区分布

目的研究甘肃省鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)的规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)位点多态性及地区分布。方法选取1962-2014年分离的203株鼠疫菌,培养并提取DNA。采用3对CRISPR引物对菌株DNA进行PCR扩增,对PCR产物进行测序。根据菌株CRISPR位点的间区序列种类和排列情况,确定菌株的基因型(类群),采用BioNumerics 5.10软件进行聚类分析。结果203株鼠疫菌发现有16种间区序列,包括YPa位点9种、YPb位点4种、YPc位点3种,发现新的间区序列a1′。共发现5个CRISPR基因簇,分别为Cb2、Ca7、Ca7′、CaΔ5′、Ca35′。不同的基因簇呈现区域性特征:Cb2主要分布在会宁县、平川区,Ca7主要分布阿克塞哈萨克族自治县;Ca7′主要分布在夏河县;Ca35′主要分布肃北蒙古族自治县、玉门市;CaΔ5′主要集中在肃南裕固族自治县。结论CRISPR分子分型方法能够较好地区分甘肃省不同疫源地的菌株,且各基因簇呈现一定的区域性特征。对研究甘肃省鼠疫菌进化规律和人间疫情分子生物学溯源有一定意义。

甘肃省肃北县旱獭鼠疫流行与气象因素关联性分析

目的分析甘肃省肃北县喜马拉雅旱獭疫源地内旱獭鼠疫流行与气象因素的关联性。方法收集肃北县喜马拉雅旱獭疫源地1973-2014年鼠疫监测资料(来源于甘肃省疾病预防控制中心),当年和领先1、2、3年(相对于当年作为参照的前1、2、3个年份),当月和领先1、2、3月气象因素(平均降雨量、温度、相对湿度)资料(来自于中国气象数据共享服务网)。采用SAS9.3软件进行鼠疫细菌学检测阳性率与气象因素的相关性分析;采用logistic回归分析气象因素对旱獭鼠疫流行的影响。结果1973-2014年,肃北县共发生6起人间鼠疫,死亡5例。鼠疫细菌学检测阳性率与当年平均相对湿度、领先1年平均温度呈正相关(r=0.366、0.385,P均<0.05),与领先3年平均相对湿度呈负相关(r=-0.304,P<0.05);鼠疫细菌学检测阳性率与领先1月平均降雨量呈正相关(r=0.212,P<0.05),与领先2、3月平均相对湿度呈负相关(r=-0.196、-0.201,P均<0.05)。肃北县旱獭疫源地动物鼠疫流行的危险因子为当月平均温度[比值比(OR)=1.304,95%置信区间(CI):1.195~1.422],保护因子为领先3月平均相对湿度(OR=0.960,95%CI:0.932~0.988)。结论肃北县喜马拉雅旱獭鼠疫流行与气象因素关系密切,气温对鼠疫的流行不仅有促进作用,而且存在滞后效应。气象因素可作为喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫风险评估的参考。

基于单核苷酸多态性的甘肃省鼠疫耶尔森菌基因分型研究

目的探讨基于单核苷酸多态性(SNP)的甘肃省鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)的基因分型及其地区分布特征。方法选取1962 - 2017年甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地和阿拉善黄鼠鼠疫疫源地分离的52株鼠疫菌, 培养并提取基因组DNA, 进行Illumina PE150二代测序, 鉴定鼠疫菌SNP位点。基于SNP位点, 采用Mega 10.0软件中邻接法的Kimura-2-parameter模型确定甘肃省鼠疫菌种群特征, 并对群内菌株采用最大似然法的Hasegawa-Kishino-Yano模型构建分子进化树。结果甘肃省52株鼠疫菌共鉴定出103个SNP位点, 其中, 基因间区位点28个, 非同义突变位点43个, 同义突变位点31个, 无义突变位点1个。52株鼠疫菌划分为2个生物型3个群, 分别为古典型(1.IN2、3.ANT), 中世纪型(2.MED)。其中, 35株属于1.IN2群, 13株属于3.ANT群, 4株属于2.MED群。1.IN2群内菌株进一步划分为肃北县鱼儿红乡、党城湾镇, 肃南县马蹄乡、大河乡, 夏河县5个亚群。3.ANT群内菌株进一步划分为阿克塞县红柳湾镇和肃北县党城湾镇马场2个亚群。结论 SNP方法能够对甘肃省不同鼠疫疫源地的鼠疫菌进行基因分型, 且具有一定的区域性特征。

气象因素对甘肃阿拉善黄鼠疫源地动物鼠疫的影响

目的探讨甘宁黄土高原阿拉善黄鼠（以下简称黄鼠）鼠疫自然疫源地气象因素变化对宿主数量和动物鼠疫流行的影响。方法收集1962—2014年甘肃黄鼠疫源地黄鼠血清阳性率资料。当年及领先1（相对于当年作为参照的前1个年份）、2、3年平均降雨量，平均温度、平均相对湿度等气象因素。采用SAS9．3软件进行气象因素对黄鼠数量和动物鼠疫发生影响的相关分析和回归分析；采用广义相加模型（GAM）定量研究气象因素对黄鼠数量的影响程度；采用logistic回归分析研究气象因素对黄鼠鼠疫流行的影响。结果黄鼠年份血清阳性率与当年及领先1年平均降雨量、当年平均相对湿度呈正相关（r=0．279、0．341、0．654，P均〈0．05），与当年及领先1、2、3年平均温度呈负相关（r=-0．360、-0．339、-0．273、-0．323，P均〈0．05）。GAM参数模型部分估计结果表明，领先2、3年平均降雨量与黄鼠密度线性关系有统计学意义（t=2．88、2．42，P均〈0．05）；GAM非参数模型部分估计结果表明，领先2、3年平均降雨量对黄鼠密度影响有统计学意义（x2=31．580、13．428，P均〈0．05），这种影响是非线性的。多因素logistic回归分析结果表明，领先1年平均降雨量[比值比（OR）=2．475，95％可信区间（CI）：1．175-5．213]是黄鼠疫源地动物鼠疫流行的危险因子。结论降雨量是鼠疫流行的危险因子，其对宿主数量和动物鼠疫流行的影响存在滞后效应。降水量（但不是持续的降雨量）达到一定量时，可为鼠疫菌的传播提供有利的条件。

敦煌至格尔木铁路甘肃段区域动物鼠疫流行现状分析

目的总结分析敦煌至格尔木铁路（简称敦格铁路）甘肃段沿线鼠疫疫源地动物鼠疫流行现状和流行规律，为敦格铁路鼠疫防控提供参考依据。方法采用回顾性分析方法，分析2010—2015年敦格铁路甘肃段区域（阿克塞、肃北县）旱獭数量、染蚤率及蚤指数、鼠疫血清学和病原学检测结果．铁路项目施工标段与动物疫点交叉情况。结果2010—2015年，敦格铁路穿越区域阿克塞和肃北县旱獭总平均密度在0．23～0．41只／hm2；阿克塞疫源地旱獭寄生蚤染蚤率为11．30％～32．65％，旱獭体蚤指数为0．74～1．84；肃北县旱獭寄生蚤染蚤率为5．34％～14．07％，蚤指数为0．25～2．04。阿克塞和肃北县鼠疫病原学共检测旱獭2049份，阳性142份，阳性率为6．93％；检测寄生媒介592组，阳性44份，阳性率为7．43％。旱獭检菌阳性率和其寄生媒介检菌阳性率比较差异无统计学意义（X2=0．014，P〉0．05）。共检测旱獭血清1719份，阳性132份，阳性率为7．68％；检测犬血清421份，阳性61份．阳性率为14．49％。旱獭血清阳性率和犬血清阳性率比较差异有统计学意义（x2=19．116，P〈0．05）。铁路施工沿线发现动物疫点，2013年最多，为17处，其中疫点距施工标段最近距离0．5km，流行范围61．02km2，直接受威胁人数1360人。结论敦格铁路甘肃段沿线阿克塞、肃北区域动物鼠疫流行高度活跃。铁路开工建设过程中应做好相关防控工作，确保敦格铁路建设的顺利进行。

甘肃夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物耶尔森菌感染状况调查

目的:了解甘肃喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物耶尔森菌感染状况,为探索该疫源地鼠疫流行状态提供依据。方法:2014-2018年,现场采集20世纪50-60年代鼠疫活跃疫源地甘肃夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物肠回盲部及内容物、咽拭子(或舌根部)、血液样本,分别进行耶尔森菌分离、毒力测定及鼠疫耶尔森菌F1抗体检测。结果:958份回盲部及内容物样本检出24株耶尔森菌,检菌率为2.51%,分别为13株小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitia,Y.e)、1株克氏耶尔森菌(Yersinia kristensenii,Y.k)、2株弗氏/中间耶尔森菌(Yersinia frederiksenii/intermedia,Y.f/i)、6株中间耶尔森菌(Yersinia intermedia,Y.i)、1株奥氏耶尔森菌(Yersinia aldouae,Y.a)、1株Yersinia massiliensis(Y.m)。958份咽拭子(或舌根部)样本检出19株耶尔森菌,检菌率为1.98%,分别为8株Y.e、1株假结核耶尔森菌(Yersinia pseudotuberculosis,Y.p)、4株Y.k、1株Y.f/i、4株Y.i、1株Yersinia ruckeri(Y.r)。检出的21株Y.e均没有致病性,毒力型别有ail-ystA-ystB+yadA-virF-rfbc-、ail-ystA-ystB-yadA-virF-rfbc-两种,分别占9.52%(2/21)、90.48%(19/21)。1079份血清样本F1抗体检测结果均为阴性。结论:夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物咽部及肠道内广泛存在耶尔森菌群,检出的Y.e均为非致病性菌株。本次调查结果为进一步研究该疫源地鼠疫耶尔森菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。

气象因素对喜马拉雅旱獭鼠疫影响的初步分析

目的探讨喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地气象因素变化对动物鼠疫流行影响,为下一步鼠疫防控提供科学依据。方法收集甘肃肃北县、肃南县地区喜马拉雅旱獭疫源地1972-2016年鼠疫监测资料及同期气象因子同期气象因子(降雨量、温度、相对湿度),分析采用SAS9.3软件,进行鼠疫细菌学检测阳性率与气象因子相关分析;另外以领先3年(3月)内的气象因素为自变量,鼠疫活动的状态取1(流行)和0(静息)为因变量进行logistic多元回归分析。结果气象因素近10年与上世纪70年代相比,平均气温上升1℃,平均相对湿度上升2.8个单位,降雨量上升了13.4mm;45年间,鼠疫动物病持续发生,疫点范围逐步扩大,自毙旱獭自然带菌率高,动物鼠疫多次波及人间;平均气温(r=0.339,P<0.05)、领先1年平均气温(r=0.416,P<0.01)、领先2年平均气温(r=0.484,P<0.01)、领先3年平均气温(r=0.339,P<0.05)、领先1年的平均最高气温(r=0.333,P<0.05)、领先2年的平均最高气温(r=0.398,P<0.05)、当年平均最低气温(r=0.371,P<0.05)、领先1年平均最低气温(r=0.322,P<0.05)、领先2年平均最低气温(r=0.489,P<0.01)、领先3年平均最低气温(r=0.333,P<0.05)、当年极端最低气温(r=0.344,P<0.05)与动物鼠疫流行正相关;气象因素与鼠疫流行logistics回归分析为当年相对湿度、领先3年平均最高气温(P<0.005)和领先1年极端最低气温(P<0.05)对鼠疫影响有统计学意义(P<0.05)。结论喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地动物鼠疫流行与气象因素密切,在相对气温范围内,气温升高促进鼠疫的流行,当年相对湿度的增加,鼠疫流行呈上升趋势。气象因素可以作为喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫风险评估的参考。

DNA条形码对平川区阿拉善黄鼠疫源地鼠种鉴定的效果评价

目的评价DNA条形码技术对基层鼠疫实验室鼠种鉴定的可行性。方法2016-2018年在平川区黄鼠疫源地采集鼠类样本,采用双盲法分别对每只鼠进行形态学鉴定和DNA条形码鉴定,比较两种方法的区别。结果平川区阿拉善黄鼠疫源地共采集鼠类174只,其中松鼠科2种、仓鼠科2种、鼠科1种、跳鼠科1种、沙鼠科1种、鼢鼠科1种和兔形目鼠兔科1种;174只鼠类COI序列所构建的进化树形成9个高度支持的分支,与形态学鉴定结果一致。结论DNA条形码分子鉴定方法适合在基层鼠疫实验室推广应用,提高鼠种分类能力。