人卵巢癌相关候选基因HE4(WFDC2)的转录调控主要由Sp1与位于-71和-48的Egr-1位点结合所介导

目的 阐明HE4基因转录调控机制的细节。方法 1.用半定量RT PCR的方法评估HE4基因在肿瘤细胞株中的表达情况 ;2 .以荧光素酶报告基因载体为基础 ,对HE4基因的上游顺序构建了 3′、5′缺失突变和一系列连接体扫描突变 ;3.通过瞬时转染 /体外双荧光素酶报告系统对这些重组质粒中插入片段进行启动子活性的分析 ;4 .针对蛋白和关键顺式区域的结合的特异性和能力 ,开展泳动滞后和抗体介导的超迁移分析。结果 通过对 ( 186 0 /+ 2 9)的HE4基因上游片段及其剪切体的分析 ,将HE4基因最小启动子确定为 10 7/+ 15的DNA片段。通过对连接体扫描突变体的分析 ,将关键的顺式作用元件确定在W4 5 ( 71/ 4 8)片段 ,生物信息学提示该区存在两个Egr 1位点。通过用已知的反式作用因子与报告基因质粒分别进行共转染 ,提示Sp1是最为有效的反式作用因子 ,而不是Egr 1。通过泳动滞后和抗体介导的超迁移实验 ,证实Sp1确实是参与作用的转录因子。结论 HE4基因的转录活性主要是由转录因子Sp1与位于 ( 71/ 4 8)区域的两个Egr 1位点结合所介导的。

肝癌相关基因HCAP1的定位克隆和初步功能研究

目的 克隆和筛选位于染色体 17p13.3缺失区内的肝癌相关基因。方法 采用定位克隆的策略 ,通过PAC筛库和RACE(rapidamplificationofcDNAends)方法克隆新基因 ;通过多组织膜片Northern杂交分析其组织表达谱 ,Southern杂交分析其在肝癌组织DNA水平上的变化 ,然后通过克隆集落形成实验与MTS法测定细胞生长速度 ,初步筛选其作为肿瘤相关基因的可能性。结果 克隆到一个基因HCAP1(HCC associatedprotein 1,先前又称HC5 6 ) ,GenBank登录号为AF177341。多组织膜片杂交显示该基因在多种组织中表达 ,其中胎盘、肝脏和肌肉中表达较高。Southern杂交结果显示HCAP1基因在肝癌组织中存在缺失 ,比例为 2 5 .3% ;克隆集落形成实验与生长抑制率测定实验初步表明该基因能抑制肝癌细胞株Hep3B细胞的生长 ,抑制率为 31.8%。结论 HCAP1可能与肝癌的发生发展相关 ,是一个新的肝癌相关基因的侯选者。

ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A基因启动子的甲基化状态可能与3种乳腺癌细胞株对5-FU的敏感性相关

目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞宾、5-氟尿嘧啶(5-FU)、双氟去氧胞苷、表阿霉素、丝裂霉素、依立替康和顺铂)的敏感性;同时用甲基化特异性PCR检测23个基因在3种乳腺癌细胞株中的甲基化状态。结果:受试的3种乳腺癌细胞株仅对5-FU的敏感性有明显差异。其中Bcap-37(IC50:317.386μg/mL)对5-FU相对耐药,而ZR-75-30(IC50:6.676μg/mL)和T47D(IC50:73.076μg/mL)对5-FU相对敏感。23个基因中,有6个基因:ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A在敏感和耐药细胞株中的甲基化状态有差异。其中ABCC8、CHFR和BMP3B在5-FU耐药细胞株中呈相对高甲基化状态,而LOX、PRSS21和RASSF1A则在对5-FU敏感的细胞株中呈相对高甲基化状态。结论:本研究所发现的6个基因的甲基化状态可能与乳腺癌细胞株对5-FU化疗敏感性相关,为下一步进行临床评估和机制探讨提供了依据。

肝癌相关新基因HC6的全长cDNA克隆及分析

目的 染色体17p13.3区域内多态性位点D17S926是肝细胞肝癌(HCC)杂合性缺失热点,PAC579克隆含有D17S926位点,本实验目的在于从PAC579克隆中寻找与肝癌相关的表达序列(ESTs),对有意义的EST片段克隆其全长cDNA。方法 根据PAC579克隆中现有的9个代表新基因的EST序列设计引物,对正常人肝cDNA文库作多聚酶链式反应(PCR)扩增检测,确定在肝组织中表达的EST,然后采用Southem杂交检测肝组织中表达的EST在27对肝癌和癌旁标本中杂合性生缺失(LOH)频率,选择缺失频率最高的EST克隆其全长cDNA,Northern杂交验证后测序并作进一步分析。结果PAC579现有9个代表新基因的DST中有3个在肝组织表达,其中EST6在肝癌中LOH频率高达54.6%(6/11),通过RACE-PCR方法,得到约l.8kb全长cDNA克隆,与Northern杂交结果一致,结构及同源性分析显示该基因是一新基因,编码一个包含134个氨基酸,分子量约为14.7kD的蛋白质,另外发现碱基序列313-592属于ALu同源序列,重新命名为肝癌相关基因6(HC6)。结论 通过定位克隆方法从肝癌杂合性缺失热点得到一个新基因HC6,该基因与肝癌的关系有待进一步研究。

ETS-2转录因子与启动子的+1^+40区结合是肝癌相关基因HCCS1的转录所必需

目的:阐明HCCS1基因启动子的转录调控机制。方法:引物延伸法确定HCCS1基因的转录起始点,通过限制性内切酶酶切介导对HCCS1基因全长启动子做进行性的5'缺失,用瞬时转染/双荧光素酶报告系统确定最小启动子,连接体扫描突变分析来确定启动子功能的关键顺式序列区,电泳迁移率实验并附以抗体介导超迁移实验来确定关键的反式因子。结果:HCCS1基因的转录起始点被定位于-177/-178处的C残基(ATG为+1)。最小启动子位于-60^+148区(转录起始点为+1)之中。在关键的调控区(+1^+40)所含的已知顺式序列中有2个ETS转录因子识别序列,而不是p53或NF-κB,识别序列与其相应的转录因子(ETS-2)的结合有着重要的功能内涵。结论:ETS-2转录因子与启动子的+1^+40区中相应的顺式序列结合,在肝癌相关基因HCCS1的转录活性中起着关键作用。

肝癌细胞系中肝癌转移相关候选基因启动子区域CpG岛甲基化和表达水平的相关性研究(英文)

背景与目的:DNA甲基化被认为是反映细胞内DNA转录状态的重要表观遗传学标记。本研究旨在对启动子区域CpG岛的甲基化与基因转录水平的相关性进行评估。方法:采用甲基化特异性PCR的方法确定7个与肝癌转移相关的候选基因的启动子区域在6个肝细胞系(包括5个肝癌源性的)中的甲基化状态,并通过半定量PCR的方法确定6个基因稳定态的mRNA水平。结果:仅有纯合和杂合去甲基化的基因状态得到发现。RT-PCR分析表明除了OXCT基因在其处于杂合去甲基化状态的HepG2和HCCLM3细胞中不表达,在其他的情况下,7个候选基因均有表达。讨论:本研究中的7个肝癌转移相关基因的甲基化状态仅在细胞系中部分的反映了基因的转录状态,提示其它转录调控机制的存在。

肝细胞肝癌相关新基因FP248的功能研究

目的 FP248基因是本实验室通过高通量基因功能筛选得到的一个与细胞生长相关的新基因,本研究旨在研究其在肝癌发生发展中的作用。方法 用Northern blot,Southern blot方法检测FP248 在肝癌及其癌旁组织中mRNA表达差异和DNA的变化。通过体外细胞转染和体内裸小鼠成瘤实验观察FP248 对肝癌细胞SMMC 7721 生长的作用,并用Atlas Hu- man cDNA Expression Array探讨FP248影响肝癌细胞SMMC 7721的作用机理。结果 FP248的mRNA在57%(4/7)的肝癌中表达高于其相应的癌旁组织,而且肝癌组织中DNA有扩增。FP248 的过表达在体内外均可明显促进SMMC- 7721 细胞的生长。Atlas结果显示FP248过量表达后可上调许多与细胞生长密切相关的基因,同时还参与调节细胞粘附分子。结论 基因FP248与肝癌的发生发展有密切关系,是一个与人肝癌发生发展相关的新基因。

CPGL的基因结构及其与肝癌相关性的研究

目的 克隆carboxypeptidaseofglutamatelike(CPGL)全长cDNA ,初步探讨它在肝癌发生发展中的作用。 方法 通过5’ RACE方法和RT -PCR验证 ,确定 (CPGL)全长序列 ,根据其全长与人类基因组的比较进而确定基因的染色体定位和其外显子、内含子 ;应用WesternBlot方法检测CPGL在肝癌组织和癌旁组织中的表达 ;细胞克隆形成及生长曲线检测CPGL对肝癌细胞生长的影响。结果 CPGL全长 2 6 16bp ,编码 4 75个氨基酸的蛋白 ,染色体定位于 18q2 2 .3,蛋白产物定位于细胞质中 ,WesternBlot结果发现CPGL在肝癌组织中的表达明显低于癌旁组织。将CPGL转染肝癌细胞系SMMC772 1发现其具有抑制生长的作用。同源比较发现CPGL含有M2 0蛋白酶家族的保守功能域。结论 上述发现表明CPGL是具有潜在抑癌作用的基因。

靶向LASS2基因的小干扰RNA对人肝癌细胞侵袭能力的影响

目的:研究靶向人源性长寿保障基因2(homosapiens longevity assurance homologue2,LASS2)的小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)对人肝癌细胞MHCC97-L体外侵袭能力的影响。方法:通过脂质体转染将靶向LASS2的siRNA转染MHCC97-L细胞,运用实时荧光定量PCR(real-time fluorogentic quantitative PCR,RFQ-PCR)检测转染后LASS2mRNA的表达,筛选有效的siRNA片段;运用BCECF氢离子敏感荧光探针检测MHCC97-L细胞跨膜运输氢离子的功能;采用Western印迹法分析MHCC97-L细胞及上清液中基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase2,MMP-2)的表达情况;应用明胶酶谱法检测MHCC97-L细胞上清液中MMP-2的活性;Transwell法检测细胞体外侵袭能力。结果:筛选得到靶向LASS2的有效siRNA-1片段。MHCC97-L细胞转染LASS2siRNA-1后,其跨膜运输氢离子的能力增强,与空白对照组比差异有统计学意义(P<0.05);MMP-2蛋白的表达及分泌无明显变化,但分泌的MMP-2活性形式增加,与空白对照组和无关序列组比明显提高,差异有统计学意义(P<0.05);且细胞的体外侵袭能力明显高于无关序列组和空白对照组(P<0.05)。结论:靶向LASS2的siRNA能有效下调其表达,并能提高MHCC97-L细胞在转染LASS2siRNA后的体外侵袭能力。

LASS2基因抑制HCCLM3肝癌细胞的转移

目的:探讨LASS2基因对HCCLM3肝癌细胞转移的影响。方法:Northern blot分析高转移潜能肝癌细胞系HCCLM3和低转移潜能肝癌细胞系MHCC97-L中LASS2基因的mRNA水平。构建包含LASS2基因编码框的真核表达载体pCMV-HA2-LASS2,通过脂质体转染HCCLM3细胞,经G418筛选,建立稳定表达LASS2基因的HCCLM3细胞株。通过分析LASS2在HCCLM3中过表达后,HCCLM3细胞在迁移、侵袭等转移能力上的改变,Western blot、明胶酶谱及原位酶谱分析MMP-2合成、分泌、激活的变化。结果:Northern blot显示,HCCLM3细胞中LASS2基因的表达水平低于MHCC97-L细胞。当LASS2基因过表达后,HCCLM3细胞的迁移及侵袭能力受到显著抑制(P<0.001),虽然细胞内MMP-2的合成未改变,但细胞MMP-2的分泌及MMP-2的激活均受抑制。结论:LASS2基因可下调MMP-2的分泌及激活,可使肝癌细胞HCCLM3的转移能力受到明显抑制,提示LASS2基因对肝癌细胞HCCLM3的转移具有抑制作用。

新基因CT120在肺癌组织中的表达及其对细胞生长的影响

背景与目的:基因CT120是我们实验室从染色体17p13.3位点获得的一个细胞膜相关新基因,mRNA水平检测结果表明该基因在人正常肺组织中不表达,但在人肺癌细胞系SPC-A-1中高表达。本研究进一步从蛋白水平研究CT120在肺癌及癌旁组织中的差异表达及CT120异位表达(ectopicexpression)与过表达(overexpression)对细胞生长的影响。方法:用生物信息学方法设计15肽,合成并偶联到大分子载体KLH上制成人工免疫原,制备鸡抗CT120多肽抗体;通过Westernblotting方法检测CT120在不同肿瘤细胞系中的表达;通过免疫组织化学技术比较CT120在肺癌及癌旁组织中的差异表达;通过集落形成试验研究CT120异位表达对NIH/3T3细胞生长的影响;通过生长曲线及裸鼠成瘤试验研究CT120过表达对A549细胞生长的影响。结果:获得有效的鸡抗CT120抗体(IgY);CT120蛋白在不同肿瘤细胞系中表达程度不同,并在不同类型的肺癌组织中高表达;CT120基因异位表达显著促进NIH/3T3细胞的生长;同时CT120过表达对A549细胞在体内体外的生长有促进作用。结论:基因CT120与肺癌的发生发展有关,是一个人肺癌相关新基因。

CTHRC1基因在人肝癌中高表达并促进MHCC97L肝癌细胞的转移

目的:分析CTHRC1基因在人肝癌组织和肝癌细胞株中的表达情况及其对MHCC97L肝癌细胞转移能力的影响。方法:采用northern blot、RT-PCR和荧光定量PCR分析人肝癌组织和肝癌细胞株中CTHRC1 mRNA水平。构建包含CTHRC1基因编码框的真核表达载体pCMV-3Tag-CTHRC1,通过体外实验分析CTHRC1在MHCC97L细胞中过表达对MHCC97L细胞迁移、侵袭等转移能力的影响。结果:Northern blot、RT-PCR和荧光定量PCR结果显示,14例肝癌患者中11例存在癌组织CTHRCI mRNA表达水平高于癌旁组织,8种肝癌细胞株中5种肝癌细胞株存在着CTHRC1的高表达。当CTHRC1过表达后,MHCC97L细胞的迁移及侵袭能力显著增强(P<0.001)。结论:CTHRC1基因在人肝癌组织和人肝癌细胞株中存在着高表达,同时该基因可使肝癌细胞MHCC97L的转移能力明显增强,提示CTHRC1基因可能在肿瘤转移中起重要作用。

XRCC 1 Arg399Gln基因多态性对铂类药物化疗胃癌患者预后的影响

目的:研究DNA修复酶X射线损伤交叉互补蛋白1(X-ray repair cross-complementary protein1,XRCC1)基因Arg399Gln多态性对接受铂类药物辅助化疗的胃癌患者预后的影响。方法:选取经病理学确诊的胃癌患者84例,采用含铂类药物的联合化疗方案进行辅助化疗。化疗前采集患者外周血,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligation detection reaction,PCR-LDR)技术检测XRCC1基因Arg399Gln的多态性。结果:84例胃癌患者中,49例(58.3%)携带XRCC1的399Arg/Arg基因型,30例(35.7%)携带Arg/Gln基因型,5例(6.0%)携带Gln/Gln基因型;截止到随访结束,分别有63.1%(53/84)和55.2%(43/84)的患者出现复发和死亡,其中携带Arg/Arg基因型的胃癌患者复发率和死亡率均显著低于携带Arg/Gln或Gln/Gln基因型患者(P<0.05)。COX多因素分析显示,携带Arg/Arg基因型的患者具有较好的无复发生存期和总生存期预后(P<0.05)。结论:XRCC1Arg399Gln基因多态性与术后胃癌患者接受铂类药物化疗后的预后有关,可以在一定程度上判断术后胃癌患者接受铂类药物化疗的预后情况。

PP1195一个新的与纤粘连蛋白相互作用促进肝癌细胞迁移的基因

目的:PP1195是新近获得的一个基因,酵母双杂交发现PP1195与纤粘连蛋白(Fibronectin,FN)相互作用。本文旨在说明该基因与FN间的关系及对肝癌细胞浸润和迁移能力的影响。方法:采用体外翻译表达PP1195基因和FN基因产物,体外结合实验观察两者之间的作用;采用细胞粘附实验观察PP1195基因表达对Hep3B细胞与FN结合能力的影响;采用细胞侵袭重建基底膜和划痕实验观察该基因表达对肝癌细胞浸润和迁移能力的影响。结果:表明PP1195和FN有相互结合作用;诱导PP1195基因表达可显著增加Hep3B细胞与FN的结合能力;以及SMMC7721细胞的浸润和迁移能力。结论:PP1195基因是一个新的与纤粘连蛋白相互作用并能够增加肝癌细胞浸润和迁移能力的基因。

非放射性PCR-LIS-SSCP技术快速分析肝癌患者p53基因249位密码子的突变

目的 应用非放射性PCR LIS SSCP方法快速分析肝癌患者p5 3基因第 2 4 9位密码子突变。方法 采用PCR LIS SS CP方法 ,研究了 16例来自中国广西、江苏启东和上海地区肝癌患者p5 3基因第 2 4 9位密码子的突变情况 ,并用限制性内切酶和DNA测序对PCR LIS SSCP方法所获得的结果进行了验证。结果 从 16例肝癌病人中检出 3例在该位点具有突变。其中广西地区的 4例肝癌病人有 1例发生突变 ,江苏启东地区的 4例肝癌病人有 1例发生突变 ,上海地区的 8例肝癌病人有 1例发生突变。结论 用该方法检测肝癌病人 p5 3基因第 2 4 9位密码子突变频率为 18.8% (3/ 16 ) 。

HCAP1两种基因型对肝癌细胞系Hep3B基因表达的影响

背景与目的:HCAP1(HCC-associatedprotein1)基因是我们室克隆的一个新基因,HCAP1基因有N和M两种基因型,本研究旨在探讨HCAP1N和HCAP1M基因型对肝癌细胞基因表达的影响。方法:用脂质体转染试剂,将HCAP1M与HCAP1N分别转染Hep3B-Tet-on肝细胞性肝癌细胞株;为了获得高诱导表达HCAP1N或HCAP1M的细胞株,通过Westernblot方法筛选被转染的细胞。然后,通过人cDNAarray膜片杂交技术分析HCAP1N或HCAP1M诱导表达前后的细胞基因表达谱。杂交结果用复日Smartview2001图像分析软件进行分析比较。结果:建立了HCAP1N和HCAP1M过表达前后的差异基因表达谱。结果表明HCAP1M过表达引起参与细胞增殖的基因表达上调(如c-erbB2受体和转录因子DP2),以及起凋亡作用基因(caspase9)及DNA切割修复蛋白基因(ERCC5)的表达下调;而HCAP1N过表达引起抑制细胞生长基因(如snoN和WAF1)和DNA切割修复蛋白基因(ERCC5)的表达上调,以及抗凋亡基因(HSPs)的表达下调。结论:HCAP1M基因过表达可能促进细胞过度增殖,HCAP1N过表达可能抑制细胞生长。

表皮生长因子受体介导的多肽载体系统对人喉鳞状细胞癌的基因导入研究

目的 检测一种新的以头颈肿瘤细胞表面受体为靶向的多肽基因导入系统对人喉鳞状细胞癌 (简称鳞癌 )的基因导入效果。方法 链霉亲和素标记生物素 (labeledstreptavidinbiotin ,LSAB)法检测喉癌组织标本和培养的Hep2喉癌细胞表皮生长因子受体 (epidermalgrowthfactorreceptor,EGFR)的表达。建立人喉癌裸鼠移植瘤模型 ,分别构建绿色荧光蛋白标记基因和多肽载体系统、半乳糖苷酶报告基因和多肽载体系统四元复合物 ,分别进行报告基因和标记基因的体内外导入实验。结果 EGFR在 6 5 % (15 / 2 3)喉癌组织标本呈阳性表达。Hep2细胞的EGFR亦呈阳性表达。EGFR主要位于细胞膜 ,部分位于细胞质内。绿色荧光蛋白基因转染Hep2后 4 8h显微镜下可见荧光 ,72h达高峰 ,导入率大于 80 % (78/ 97)。β 半乳糖苷酶报告基因荷人喉癌裸鼠移植瘤瘤内转染 12h即表达蓝染 ,2 4h蓝染程度加深 ,72h仍有表达。 结论 EGFR广泛存在于人喉癌细胞 ,新的多肽基因导入系统借助于EGFR可靶向性将报告或标记基因导入体内外人喉癌细胞 ,并得到高效表达 ,为头颈鳞癌的基因治疗提供了一个新的靶向高效的基因导入系统。

Tie2介导的基因导入系统转导p53基因对肺癌的抑制作用

目的:探讨Tie2介导的基因导入系统体内靶向转导p53基因治疗肺癌的效果。方法:应用双功能交联剂SMCC将Tie2配体寡肽GA3与PEI连接构建靶向Tie2的基因载体。体外试验将GA3-PEI/luciferase导入Tie2表达阳性的SPC-A1肺癌细胞与Tie2表达阴性的SMMC7721肝癌细胞中,24 h后检测luciferase活性。体内导入试验将GA3-PEI/β-gal复合物注射SPC-A1细胞裸鼠种植瘤周围皮下,同时设立PEI/β-gal组为对照;24 h后牺牲裸鼠,检测心、肝、脾、肺、肾和瘤体的β-gal表达。另外将另一批四周龄SPC-A1肺癌种植瘤裸鼠随机分为5组:(1)NS;(2)GA3;(3)p53;(4)PEI/p53;(5)GA3-PEI/p53;每组6只;皮下注射GA3-PEI/p53基因复合物,隔2天1次,并测量肿瘤长短径,计算瘤体积及抑瘤率。结果:GA3-PEI/luciferase组的luciferase活性在SPC-A1细胞中明显高于SMMC7721细胞(P<0.05)。在种植瘤中可见较多蓝染细胞,心、肝、脾、肾组织中几乎不见篮染,肺支气管黏膜除外。与对照组比较,GA3-PEI/p53治疗组对肿瘤生长有明显抑制作用(P<0.05),其抑瘤率为61.29%。结论:GA3基因导入系统靶向转导p53基因,显著抑制肿瘤生长。

人细胞生长相关5个新基因的染色体定位及其基因结构

基因的染色体定位对我们研究基因相互关系、基因的组织与进化及理解基因与疾病关系具有重要的意义。本文采用RH -PCR方法及生物信息学方法对PP3898、PP115 8、PP75 3、SP2 6 0、HC5 6等 5条人细胞生长相关新基因进行染色体定位 ,并分析了其基因结构。PP3898及PP115 8定位于 19p13 3,PP75 3及SP2 6 0定位于 1q2 1 1,HC5 6定位于 17p13 3。PP3898含有 19个外显子和 18个内含子 ,可读框为 2 5 6 5bp ;PP115 8含有 7个外显子和 6个内含子 ,可读框为 12 18bp ;SP2 6 0含有 10个外显子和 9个内含子 ,可读框为 6 90bp ;HC5 6为单外显子 ,可读框为3141bp。另外 。