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人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征及进化分析
1
作者
杨建课
宫磊
+2 位作者
高继光
林爱琴
徐思斌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期828-832,共5页
目的检测人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征、致病机制、来源及进化。方法从Flu和GISAID两大数据库中获得人感染H6N1及近缘禽流感病毒的HA序列,通过ML、MP、BI法构建系统发育树,推测进化速率和最近共同祖先(TMRCA)时间,并分析相关...
目的检测人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征、致病机制、来源及进化。方法从Flu和GISAID两大数据库中获得人感染H6N1及近缘禽流感病毒的HA序列,通过ML、MP、BI法构建系统发育树,推测进化速率和最近共同祖先(TMRCA)时间,并分析相关变异位点、糖基化位点及裂解位点。结果人感染与台湾3株禽感染H6N1病毒聚成一支,最近共同祖先时间为2002年,目前正在流行,且进化速度很快。其氨基酸序列含有5个N-糖基化位点和2个O-糖基化位点,裂解位点上游仅1个碱性氨基酸,拥有两个特异的变异位点P186L和A287T。结论人感染H6N1禽流感病毒目前仍是一种低致病性禽流感病毒,其HA基因由家鸡的序列进化而来。由于其高的进化速率及病毒重配的可能性,应引起高度重视。
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关键词
人感染H6N1禽流感病毒
血凝素
分子特征
系统发育
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职称材料
题名
人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征及进化分析
1
作者
杨建课
宫磊
高继光
林爱琴
徐思斌
机构
皖南医学院医学细胞生物学教研室
皖南医学院
医学
遗传学研究室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期828-832,共5页
基金
皖南医学院中青年科研基金项目(No.WK201205)资助~~
文摘
目的检测人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征、致病机制、来源及进化。方法从Flu和GISAID两大数据库中获得人感染H6N1及近缘禽流感病毒的HA序列,通过ML、MP、BI法构建系统发育树,推测进化速率和最近共同祖先(TMRCA)时间,并分析相关变异位点、糖基化位点及裂解位点。结果人感染与台湾3株禽感染H6N1病毒聚成一支,最近共同祖先时间为2002年,目前正在流行,且进化速度很快。其氨基酸序列含有5个N-糖基化位点和2个O-糖基化位点,裂解位点上游仅1个碱性氨基酸,拥有两个特异的变异位点P186L和A287T。结论人感染H6N1禽流感病毒目前仍是一种低致病性禽流感病毒,其HA基因由家鸡的序列进化而来。由于其高的进化速率及病毒重配的可能性,应引起高度重视。
关键词
人感染H6N1禽流感病毒
血凝素
分子特征
系统发育
Keywords
human-infecting H6N1 avian influenza virus
hemagglutinin
molecular characterization
phylogeny
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人感染H6N1禽流感病毒HA基因的分子特征及进化分析
杨建课
宫磊
高继光
林爱琴
徐思斌
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
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