目的:比较尘螨变应原Der f 3、Der p 3和Eur m 3的结构及功能异同。方法:用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较Der f 3、Der p 3和Eur m 3的一级、二级、三级结构及抗原表位。结果:Der f 3...目的:比较尘螨变应原Der f 3、Der p 3和Eur m 3的结构及功能异同。方法:用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较Der f 3、Der p 3和Eur m 3的一级、二级、三级结构及抗原表位。结果:Der f 3、Der p 3和Eur m 3氨基酸序列一致性为88.51%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域都为5个,并在第79-81aa、129-135aa和172-174aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。结论:应用生物信息方法预测和比较了Der f 3、Der p 3和Eur m 3结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础。展开更多
使用多种生物信息学工具来预测、比较尘螨变应原Der f 9、Der p 9和Blo t 9的一级、二级、三级结构及抗原表位,找出3种蛋白结构及功能的异同。Der f 9、Der p 9和Blo t 9氨基酸序列一致性为82.07%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2...使用多种生物信息学工具来预测、比较尘螨变应原Der f 9、Der p 9和Blo t 9的一级、二级、三级结构及抗原表位,找出3种蛋白结构及功能的异同。Der f 9、Der p 9和Blo t 9氨基酸序列一致性为82.07%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域都为5个,并在第47-49aa和200-203aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。应用生物信息方法预测和比较了Der f 9、Der p 9和Blo t 9结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原第9组分的生物学功能、疫苗研制奠定了基础。展开更多
文摘目的:比较尘螨变应原Der f 3、Der p 3和Eur m 3的结构及功能异同。方法:用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较Der f 3、Der p 3和Eur m 3的一级、二级、三级结构及抗原表位。结果:Der f 3、Der p 3和Eur m 3氨基酸序列一致性为88.51%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域都为5个,并在第79-81aa、129-135aa和172-174aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。结论:应用生物信息方法预测和比较了Der f 3、Der p 3和Eur m 3结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础。
文摘使用多种生物信息学工具来预测、比较尘螨变应原Der f 9、Der p 9和Blo t 9的一级、二级、三级结构及抗原表位,找出3种蛋白结构及功能的异同。Der f 9、Der p 9和Blo t 9氨基酸序列一致性为82.07%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域都为5个,并在第47-49aa和200-203aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。应用生物信息方法预测和比较了Der f 9、Der p 9和Blo t 9结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原第9组分的生物学功能、疫苗研制奠定了基础。