不同浓度外源褪黑素对NaHCO_(3)胁迫下番茄幼苗生长和生理指标的影响

以‘里格尔87-5’加工番茄幼苗为试材,采用水培番茄方式,模拟60mmol·L^(-1)NaHCO_(3)环境条件,研究喷施不同浓度褪黑素(MT)(50~500μmol·L^(-1))对 NaHCO_(3)胁迫下番茄幼苗生长和生理指标的影响,以期为利用 MT 解决番茄生产中碱胁迫提供参考依据。结果表明:与 CK 相比,MT_(0)显著降低了幼苗株高、地上部和地下部鲜干质量,MT_(200)对植物生长发育形态指标缓解效果显著,提高了幼苗株高、地上部鲜质量和地下部鲜干质量的31.57%、73.86%、1.71倍、1.94倍。与 CK 相比,MT_(0)处理下的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间 CO_(3)浓度(Ci)、蒸腾速率(Tr)均显著下降,MT_(0)处理下的光合特性缓解效果最为显著;在渗透胁迫方面,与 CK 相比,MT_(0)导致幼苗叶片相对电导率(REC)、丙二醛(MDA)、过氧化氢(H_(2)O_(2))、超氧阴离子O_(2)产生速率均显著升高且显著降低了番茄叶片中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性,刺激了过氧化氢酶(CAT)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性的增加。MT 处理中,尤以 MT_(0)可显著增加 SOD、POD 活性,降低REC、MDA、H_(2)O_(2)、O_(2)。综上所述,一定浓度范围的 MT 可改善碱胁迫(60mmol·L^(-1))下番茄幼苗的生长形态,增强光合作用、提高抗氧化酶活性,降低细胞膜脂过氧化,最终提高幼苗的耐碱力。

富士和嘎啦苹果叶片面积估算模型构建

【目的】建立准确、无损的适宜于苹果不同品种和枝梢类型的叶面积估算模型。【方法】以富士及嘎啦不同长度的营养枝梢和果台枝梢叶片为试材,采用数字扫描仪获取叶片长度(LL)、宽度(LW)和叶面积(LA)等叶片形态参数,并采用决定系数(R^(2))、均方根误差(RMSE)、赤池信息准则(AIC)对建立的17个有常数项和无常数项叶面积模型精度进行筛选和适宜性评价。【结果】共获得5207枚叶片形态参数,其中叶面积变异系数最大,达51.59%。叶片形态受品种及枝梢类型的显著影响,其中长枝梢叶片长、宽和叶面积显著大于同类型短枝梢叶片,而营养枝梢叶片长、宽和叶面积显著大于同长度果台枝梢,嘎啦叶片相比富士更为细长。以LL和LW复合变量为自变量的模型5:LA=a(LL×LW)、模型6:LA=a(LL+LW)^(2)、模型9:LA=aLL 2+bLW^(2)、模型16:LA=a(LL×LW)^(b)、模型17:LA=(LL×LW)^(b)的精度可满足富士和嘎啦各类枝梢叶面积的估算,但需针对各品种和枝梢类型单独建模。同时包含LL和LW双变量的叶面积模型精度高于单一LL或LW变量的模型。无论富士还是嘎啦,对于不同类型枝梢,果台叶面积模型精度最高,短枝梢均比长枝梢精度高,营养长枝梢拟合精度最低。模型5和17可适用于富士和嘎啦各类枝梢叶面积的估算。模型5和17的R 2分别为97.72%和97.37%,RMSE分别为1.7566和1.8319 cm^(2),模型系数分别为0.7123和0.9108。满足模型5和17精度所需的最低样品数量为241与3939枚叶片。【结论】筛选的叶面积模型可用于各品种和各个类型枝梢叶片面积估算,无需针对单个品种及枝梢独立建模,且模型无需添加常数项。叶片数量影响叶面积模型精度,需满足最低临界值。

加工番茄早熟突变体农艺性状相关性及通径分析

【目的】研究加工番茄早熟突变体主要农艺性状对前期产量性状的直接作用、间接作用和决定系数,为加工番茄优良早熟品种的选育提供理论依据。【方法】对4份加工番茄早熟突变体的11个主要农艺性状进行相关性、回归及通径分析。【结果】株高、始花节位、果实横径、果实纵径、单果重和一二穗结果数的变异系数较大,分别为18.1%、12.1%、12.9%、13.9%、29.1%和22.7%,其可选择性较强,易于通过育种、栽培等方式得到较大程度的提高和改善。对照组单果重与前期产量呈极显著正相关,相关系数为0.892^(**);一二穗结果数与前期产量呈显著性正相关,相关系数为0.822^(*);处理组单果重和一二穗结果数与前期产量均呈极显著性正相关,相关系数为0.770^(**)和0.958^(**);单果重越大、一二穗结果数越多、前期产量越高;现蕾期、始花期越早、开花至成熟天数越短,早熟性指数越高。单果重、一二穗结果数对前期产量的直接作用为正向,且相关系数为极显著正相关,在加工番茄早熟品种选育时,应结合单果重和一二穗果数2因素直接、间接作用进行选择,其中一二穗结果数起决定性因素。【结论】在加工番茄早熟品种选育过程中,要提高早熟性指数和前期产量,考虑单果重、一二穗结果数、现蕾期、始花期、开花至成熟天数等农艺性状,着重考虑一二穗结果数和单果重等农艺性状。

外源水杨酸对高温胁迫下葡萄幼苗膜脂过氧化及抗氧化酶活性的影响

为探讨外源水杨酸(SA)对高温胁迫下葡萄幼苗耐热性的影响,本试验以2年生克瑞森无核葡萄扦插苗为试验材料,对清洗干净的葡萄叶片喷施浓度为150μmol/L的水杨酸(SA)溶液,之后置于45℃高温胁迫0 min、10min、30 min、1 h、2 h、4 h、8 h,以喷施蒸馏水后置于45℃高温胁迫0 min、10 min、30 min、1 h、2 h、4 h、8 h为对照,研究外源水杨酸对电解质渗透率、丙二醛含量以及抗氧化酶SOD、POD、CAT、APX、GR活性的影响。结果表明:高温胁迫下随着胁迫时间的延长(>1 h),外源水杨酸显著降低了丙二醛的含量和相对电导率的增加量;并且随着胁迫时间的延长(>2 h)外源SA可以显著提高SOD、POD、CAT、APX、GR的活性,能够维持较高的SOD、POD、CAT、APX、GR活性。外源水杨酸随着高温胁迫时间的延长可以显著降低丙二醛含量和电解质渗透率,显著降低了细胞膜质过氧化伤害;促进抗氧化物酶SOD、POD、CAT、APX、GR的活性,降低了高温胁迫对葡萄植株的氧化伤害,从而缓解了高温胁迫对葡萄幼苗的伤害作用,提高葡萄的耐热性。

抗性砧木对赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇合成过程及含量的影响

为了明确不同抗性砧木对赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇含量及其合成过程中前体物质和相关代谢酶活性的影响,分析不同抗性砧木与白藜芦醇合成的关系,以获得提高接穗品种赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇含量的抗性砧木。该研究选择弗卡(Fercal)、5C、140R、3309M、3309C、SO4、抗砧3号(Kangzhen3)、5BB为砧木与赤霞珠(CS)葡萄进行嫁接,以赤霞珠自根苗为对照(CK),采用高效液相色谱技术,测定成熟葡萄叶片白藜芦醇以及合成白藜芦醇前体物质苯丙氨酸、肉桂酸、香豆酸含量,并对合成白藜芦醇相关代谢酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸-4-羟化酶(C4H)、4-香豆-辅酶A连接酶(4CL)、过氧化物酶(POD)以及多酚氧化酶(PPO)的活性进行测定。结果表明:(1)不同砧木均能提高接穗赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇含量11%~46%。(2)在各砧穗组合中,CS/140R嫁接苗叶片的白藜芦醇含量最高达到18.24μg/g,其合成白藜芦醇前体物质苯丙氨酸和香豆酸含量也最高,分别达到38.61和1.06μg/g。(3)在各砧穗组合中,白藜芦醇相关代谢酶PAL活性以CS/3309C嫁接苗叶片最高;嫁接苗叶片代谢酶C4H和4CL活性均高于赤霞珠自根苗;POD和PPO活性均以CS/Fercal的接穗赤霞珠叶片最强。研究发现,不同抗性砧木能显著提高赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇含量,相关代谢酶C4H活性对葡萄白藜芦醇的合成至关重要,PPO活性与葡萄叶片白藜芦醇合成也密切相关,CS/140R是8个砧穗组合中提高赤霞珠葡萄叶片白藜芦醇含量最具优势的砧穗组合。

不同制干辣椒品种种子萌发期抗逆性评价

以22份制干辣椒品种种子为试材,分别以18℃低温和150 mmol·L^-1的NaCl溶液为胁迫条件,研究种子发芽势、发芽率、发芽指数及各指标相对值的隶属函数值,以期对参试品种种子萌发期的耐冷性和耐盐性进行评价。结果表明:不同辣椒品种在胁迫条件下发芽势、发芽率、发芽指数的差异性显著,能够利用这些指标鉴别出品种间的耐冷性及耐盐性,并用隶属函数对22份制干辣椒品种进行综合评价,再进行聚类分析,筛选出了"砻丰源9号""陕早红""砻丰源红冠"3份耐冷性及耐盐性均较好的制干辣椒品种。

辣椒PPO基因家族密码子偏好性分析

以辣椒多酚氧化酶家族(PPOs)为研究对象,利用CUSP、CHIPS及CodonW 1.4.4等软件对辣椒PPO基因9个密码子进行分析,研究了辣椒PPOs密码子偏好性特征,以期为辣椒PPO基因家族密码使用模式和分子进化及功能提供参考依据。结果表明:辣椒PPO家族基因偏好性较弱,偏好以A或U(T)结尾的密码子,其中存在28个高频密码子(RSCU>1),4个偏好性较强密码子(RSCU>1.6)和1个偏好性最强密码子(RSCU>2)。聚类结果显示,基于CDS序列聚类效果更好;CaPPO1单独聚为一类,其余8个基因较为接近。相关性分析表明PPO家族基因密码子的偏好性主要影响因素是密码子第3位碱基GC含量(GC3s)。此外,GC、C3s也存在一定的影响。ENC图、中性绘图结果表明自然选择对PPO家族基因密码子偏好性的影响更大。

不同pH的ALA处理对葡萄叶片光合及叶绿素荧光特性的影响

以日光温室栽培的"克瑞森"无核葡萄为试材,在其果实膨大期(6月18日)、转色期前(7月2日)、转色期(7月12日)对叶片进行清水和不同pH(5.5、6.0、6.5、7.0)的ALA喷施处理,研究不同pH的ALA处理对葡萄叶片光合及叶绿素荧光特性的影响。结果表明:不同pH的ALA处理均会不同程度地提高光合参数包括净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、蒸腾速率(Tr)和荧光参数包括最大荧光(Fm)、潜在光化学活性(Fv/Fo)、最大光化学效率(Fv/Fm)、实际光化学效率(Y(Ⅱ))、光化学猝灭系数(qP),非光化学猝灭系数(NPQ),降低最小荧光(Fo),其中以pH 5.5的ALA处理作用效果最为显著。

核桃ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析

生长素响应因子(auxin response factor,ARF)是一类在植物生长发育过程中起着关键作用的转录调控因子。基于核桃(Juglans reiga)基因组数据库,本研究利用生物信息学方法,在全基因组水平上利用HMMER 3.0和BLAST软件对核桃ARF基因家族成员进行鉴定,共鉴定到了30个核桃ARF基因,其编码蛋白的长度在596~1124 aa之间,蛋白分子量介于65447.51~125471.08 Da之间,等电点在5.27~8.31之间,均定位于细胞核。系统进化树分析,将其分为4个亚组(ClassⅠ~ClassⅣ),同一亚组成员通常表现出相似的基因结构和保守结构域。保守结构域分析显示,30个JrARF蛋白均具有保守的B3、Aux_resp结构域,大部分蛋白含有Aux/IAA结构域。这些基因不均匀地分布于核桃的15个染色体上。启动子顺式作用元件表明,该家族成员与众多光响应元件及逆境响应、激素应答等响应元件相关。利用转录组数据分析了ARF家族成员在核桃雌雄花芽分化过程中的表达模式,结果表明JrARF1、JrARF5、JrARF17等在雌花芽形态分化始期(FB-2)时期高表达,JrARF6、JrARF20在雄花芽(MB-3)中高表达。研究结果为深入研究核桃ARF基因家族的作用提供了重要的理论依据。

番茄GAPDH基因家族的鉴定及其在GSNO调控番茄盐胁迫中的响应

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)是糖酵解过程中的关键酶,在植物的生长发育以及抗逆反应中起重要作用。为了进一步研究番茄GAPDH基因的功能。利用HMMER、NCBI-CDD和SMART在番茄全基因组水平上共鉴定了13个GAPDH基因。氨基酸数量在38~496之间;理论等电点在5.24~9.82之间;分子量在4.05~53.11之间;主结构域结果预测表明磷酸化的SIGAPDH蛋白都含有Gp-dh-N和Gp-dh-C两个保守的结构域,非磷酸化的SIGAPDH11含有Aldedh结构域。基因结构预测显示内含子数在4~13之间变化;系统发育树将SIGAPDH分为4个亚家族。13个GAPDH基因位于不同的染色体上,其中5号染色体上分布最多。motif结果表明,同一亚组的SIGAPDH成员通常有相似的基序。SIGAPDH顺式作用元件分为应激反应、激素反应性、光反应性和MYB结合位点4个主要亚组。盐胁迫情况下SIGAPDH4、SIGAPDH8、SIGAPDH11上调幅度显著。施用GSNO后,SIGAPDH3、SIGAPDH8、SIGAPDH11明显上调,施用PTIO后SIGAPDH3、SIGAPDH4、SIGAPDH7、SIGAPDH11上调表达。因此,推测GAPDH基因参与番茄体内的NO调控。这些结果可为番茄GAPDH基因结构与功能提供理论依据。

核桃JrGI基因克隆及表达分析

GI(GIGANTEA)基因是生物节律钟关键输出基因,克隆核桃JrGI基因,并分析其在不同组织及不同时间的雌花芽表达情况,旨在为研究核桃JrGI基因的功能奠定基础。采用RT-PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction)技术从‘新新2号’叶片中克隆获得JrGI基因全长序列,对其进行生物信息学分析、烟草亚细胞定位及表达分析。结果表明,JrGI基因全长为3516 bp,编码1171个氨基酸,分子量为128.60 kDa,等电点(isoelectric point)为6.13,属于亲水性蛋白;系统进化分析表明JrGI蛋白与胡杨GI蛋白亲缘关系最近。烟草亚细胞定位显示JrGI蛋白位于细胞核中。对‘新新2号’雌花芽不同时间段JrGI、JrCO和JrFT基因进行RT-qPCR(real-time quantitative PCR)分析,结果表明在形态分化临界期的雌花芽中表达量最高,推测JrGI在此时间对雌花芽的分化起到重要作用。另外,JrGI基因在‘新新2号’各组织中均有表达,且在叶片中表达量最高,推测JrGI基因在核桃叶片发育过程中也发挥重要功能。

NaCl胁迫对酸枣幼苗离子吸收与分配的影响

以酸枣水培幼苗为试验材料,研究了不同浓度NaCl胁迫对其活性氧、细胞膜透性、根系活力、不同器官Na+、K+、Ca2+和Mg2+离子含量的影响。结果表明:NaCl处理6 d,50、100 mmol·L-1处理酸枣叶片无萎蔫症状,150、200 mmol·L-1处理叶片萎蔫。在150、200 mmol·L-1 NaCl处理下叶片H2O2积累增加,50、100、150、200 mmol·L-1 NaCl处理下均有积累。随着NaCl处理浓度的升高,根、茎、叶中Na+含量均显著增加,叶片中K+、Ca2+和Mg2+含量显著下降,根和茎的K+和Mg2+含量变化不显著,Ca2+在200 mmol·L-1NaCl处理下显著下降。根、茎、叶中K+/Na+、Ca2+/Na+、Mg2+/Na+均显著下降,但是根的K+/Na+值始终大于1。总之,NaCl胁迫下,维持根和茎中相对稳定的K+、Mg2+水平、保持根部K+/Na+比值>1,是酸枣幼苗对盐胁迫的一种适应。

隶属函数法对伊犁地区‘树上干’杏不同株系抗寒性的评价

研究不同品种‘树上干’杏的抗寒特性,为‘树上干’杏抗寒种质创新及抗寒品种选育提供依据。以伊犁地区杏品种‘树上干’杏6个不同株系的一年生枝条为材料,采用人工模拟低温环境的方法,以4℃为对照组,设置-15℃、-20℃、-25℃、-30℃、-35℃共5个温度梯度,分析了低温胁迫对一年生枝条相对电导率、丙二醛含量(MDA)、超氧化物歧化酶活性(SOD)、脯氨酸、可溶性蛋白含量的影响。应用隶属函数法分析和评价6个不同株系的抗寒能力。结果表明,6个不同株系的‘树上干’杏抗寒性强弱依次为S6>S3>S1>S5>S2>S4。本研究通过对‘树上干’杏抗寒性进行研究,并探讨各抗寒指标之间的关系,建立可靠的‘树上干’杏抗寒性评价方法,为‘树上干’杏抗寒性新品种选育及推广提供一定的理论依据。

中性盐胁迫和碱性盐胁迫对制干辣椒(Capsicum annuum)种子萌发的影响

新疆由于南北部地理气候差异导致土壤盐分种类、组成存在显著差异。北疆土壤盐分以氯化钠等中性盐为主,南疆土壤含有碳酸钠、碳酸氢钠等碱性盐,具有较高的pH。为了明确南北疆土壤盐分组成对辣椒生长发育的影响,本研究以制干辣椒‘红龙23号’为材料,研究了不同浓度中性盐(NaCl)、碱性盐(Na2CO3:NaHCO3=1:9)对其种子萌发的影响,探究中性盐与碱性盐对辣椒生长的影响。结果表明:40 mmol/L的中性盐处理可提高辣椒种子发芽率,中高浓度的中性盐和所有碱性盐处理对辣椒种子发芽率均有抑制作用,且盐浓度越高对发芽率的抑制作用越强;相同浓度下,碱性盐对发芽率的抑制作用更强。低浓度的中性盐、碱性盐对辣椒种子发芽势均有促进作用,且随着盐浓度的升高,发芽势逐渐受到抑制;相同浓度下,碱性盐胁迫的发芽势比中性盐低。中性盐、碱性盐对芽苗生长影响不同:相同浓度下,碱性盐胁迫的辣椒芽苗的胚轴、胚根都较短;芽苗超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)、氧化氢酶(catalase, CAT)活性随盐浓度升高呈下降趋势;过氧化物酶(peroxidase, POD)活性呈现不规律变化。隶属函数分析表明,POD、SOD、CAT三种酶活性与辣椒抗盐性关系最紧密,尤其对于碱性盐的影响更大。试验结果表明,当中性盐浓度≥40 mmol/L,碱性盐浓度≥20 mmol/L时,辣椒种子发芽即受到抑制;盐离子浓度相同时,碱性盐的抑制效应大于中性盐。

番茄type Ⅱ型MADS-box基因家族生物信息学分析

typeⅡ型MADS-box基因家族在控制植物开花和花器官形成方面起着非常重要作用。近几年对MADS-box基因家族的研究颇多,但在番茄中的相关研究鲜有报道。本研究利用生物信息学的手段,对番茄typeⅡ型MADS-box基因家族蛋白序列进行分析,预测其结构域、蛋白的二级结构、三级结构、分子量、等电点、保守基序和染色体位置等特征,并用MEGA 5.05与拟南芥蛋白进行比对分析并构建系统进化树。结果表明,番茄typeⅡ型MADS-box基因家族有32个成员,分为MIKCC(30)组和MIKC*(2)组,MIKCC组可进一步分为SEP (6)、AGL6 (1)、AP1-FUL (5)、FLC (1)、SOC1 (3)、AGL17 (3)、SVP (2)、BS (1)、AG (3)、AGL12 (1)、AP3-PI (4)等11个亚族。typeⅡ型MADS-box家族基因在染色体上的分布不均匀,大多数聚集在2号染色体上,在第9号和10号染色体上没有分布。蛋白大小在177~279 aa,分子量和等电点分别介于20 703.9~30 846.96和5.98~9.79之间;基序预测有20个保守基序,α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构。基因结构显示内含子在5~9之间。通过进化树可以看出大部分基因参与调控花器官的特异性。这为深入研究番茄typeⅡ型MADS-box基因提供参考依据。

辣椒TALE转录因子的生物信息学分析

TALE转录因子家族广泛存在于植物中,在植物生长发育的各个阶段发挥重要作用,但是目前关于辣椒TALE转录因子家族的研究鲜见报道。本研究借助于生物信息学手段,通过HMMER、SMART、MEGA5.05、GSDS、MEME、DNAMAN、SOPMA、SWISS-MODEL等软件和网站对辣椒TALE转录因子类型、结构域、系谱进化、蛋白理化性质及高级结构、信号肽进行分析。分析显示20个辣椒TALE转录因子家族成员均含有HOX主结构域;系统进化树分析显示,20个TALE转录因子家族成员可分为KNOX和BEL两个亚族,同一亚族含有相同的保守基序以及相似的基因结构和蛋白跨膜结构;辣椒TALE转录因子家族的内含子在3~6之间;α-螺旋和无规则卷曲是该家族基因主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋-转角-螺旋结构。本研究分析了辣椒TALE转录因子的生物信息学的特征,结果表明该基因家族在辣椒中具有稳定、保守的特点,这为今后研究该基因参与的生长发育过程及其作用奠定了一定的理论基础。

加工番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)花药愈伤组织诱导与增殖的初步探究

为了建立加工番茄花药离体培养再生体系,我们以3个基因型(C1,C2和C3)加工番茄的花药为试验材料,研究了2种诱导培养基和13种增殖培养基对加工番茄愈伤组织诱导与增殖的影响。结果表明:不同基因型加工番茄花药愈伤组织诱导培养基存在差异。加工番茄杂交组合C1花药愈伤组织诱导较适培养基是MS+0.5 mg/L 2,4-D+1.0 mg/L KT;加工番茄杂交组合C2和C3花药愈伤组织诱导较适培养基是MS+1.0 mg/LNAA+1.0 mg/L 6-BA;加工番茄花药愈伤组织增殖较适培养基为MS+1.0 mg/L 6-BA+0.2 mg/L NAA,其中C3的愈伤组织增殖率可达93.33%。本研究获得了较高的愈伤组织增殖率,为利用花药离体培养技术进行加工番茄种质资源创新提供了科学依据。

辣椒C3H转录因子家族的生物信息学分析

香豆酸-3-羟化酶(p-coumarate 3-hydroxylase, C3H)与木质素生物合成途径密切相关,是细胞色素P450中的一员。本研究利用生物信息学方法,对29条辣椒C3H蛋白序列进行分析,预测其一级结构理化特性、基序、二级结构和三级结构,并用MEGA 5.0在线软件把拟南芥与辣椒的C3H蛋白序列进行比对分析,构建系统进化树。结果表明:辣椒的C3H蛋白长度介于152~983 aa,分子量和等电点分别介于16 926.8~111 899和4.600 8~9.370 6之间。基序预测发现辣椒C3H家族的10个保守基序中最长的含50个氨基酸;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋-转角-螺旋结构。进化树分析表明CA00g62090与AT5G26749.1同源性高,CA09g17320与AT3G51120.1同源性高,推测辣椒的CA00-g62090与CA09g17320可能较高程度地参与了木质素合成代谢调控。这为下一步研究C3H基因功能提供科学数据。

基于转录组测序的核桃(Juglans regia L.)SSR标记开发

本研究通过高通量测序技术结合MISA软件分析核桃转录组中SSR的分布类型及特点。通过Primer 3设计得到426对SSR引物,以来源于新疆林业科学院的10份核桃种质对随机合成的10对引物进行多态性筛选,并对核桃转录组数据进行了SSR位点搜索和分析,继而开发SSR标记。利用MISA软件在132 154条Unigenes共检测出63 400个SSR位点,分布于47 169条Unigene中,出现频率为47.97%,平均分布距离为2.55 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占总SSR位点的55.73%,34.48%和8.63%。二核苷酸重复基元中以AG/CT为优势重复基元,占二核苷酸重复的64.77%,三核苷酸重复基元以AAG/CTT为主。10对引物进行多态性验证分析结果显示:8对有效扩增引物中,7对引物在10份不同核桃种质中表现出多态性。以上结果表明,核桃转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源。开发的大批量SSR标记可为核桃种质资源遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富可靠的标记选择。