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基于网络药理学探究骆驼刺治疗脓毒症的作用机制及实验验证
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作者 邹炙臻 邓喜玲 +10 位作者 王云来 张杰 董江涛 柳小玲 梁粟 王菊 张辉 吴江东 章乐 吴芳 张万江 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2023年第9期3024-3036,共13页
目的采用网络药理学和分子对接技术及分子动力学技术,研究骆驼刺治疗脓毒症作用机制,并进行动物实验验证。方法首先筛选骆驼刺有效成分及其作用靶点,同时筛选治疗脓毒症的相关作用靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行拓扑学分析,... 目的采用网络药理学和分子对接技术及分子动力学技术,研究骆驼刺治疗脓毒症作用机制,并进行动物实验验证。方法首先筛选骆驼刺有效成分及其作用靶点,同时筛选治疗脓毒症的相关作用靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行拓扑学分析,绘制中药-疾病-靶点网络图。其次对网络图中核心靶点进行京都基因与基因组百科全书富集分析,同时进行基因本体功能富集分析;接着对核心靶点进行分子对接和分子动力学模拟实验验证。最后采用小鼠进行动物实验验证。结果筛选出骆驼刺活性成分30个,度值排名前5为(-)-儿茶素酸酯、金雀异黄酮、山奈酚、槲皮素、表没食子儿茶素,作用靶点196个;脓毒症疾病相关靶点2144个,骆驼刺-脓毒症交集靶点105个,核心靶点为TNF、IL-6、AKT1、VEGFA、CASP3、IL-1β等。涉及PI3K-Akt、TNF、HIF-1、AGE-RAGE、IL-17等信号通路,介导炎症反应、细胞凋亡等生物过程,发挥对脓毒症的治疗作用。分子对接结果显示,骆驼刺黄酮类化合物与各关键靶点结合性能均良好,其中结合能最低最稳定的构象为(-)-epigallocatechin gallate-IL-6和quercetin-IL-6,对两对复合物进行分子动力学模拟,结果表明,通过静电、范德华势能和氢键的共同作用,可以达到稳定结合的效果。动物实验证实骆驼刺可抑制脓毒症小鼠肺组织内PI3K/Akt信号通路的激活,降低Caspase-3、VEGF蛋白表达,减少外周血炎症因子TNF-α、IL-1β、IL-6的分泌,减轻组织及脏器炎性损伤。结论骆驼刺对脓毒症的治疗作用是通过多生物过程、多靶点、多通路来实现的。本研究为骆驼刺的临床应用以及脓毒症治疗提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 骆驼刺 脓毒症 网络药理学 分子对接 分子动力学 作用机制
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结核杆菌PhoPR双组分系统与广泛流行的耐药结核杆菌耐药性的相关性研究
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作者 李文娟 宝音 +11 位作者 王霞 张峰 梁晨 庄睿 樊超 庹清章 张春军 张辉 吴芳 吴江东 章乐 张万江 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期773-779,共7页
目的:通过比较分析不同耐药的结核杆菌临床分离株PhoP基因和PhoR基因的表达水平差异,探讨研究结核杆菌PhoPR双组分系统与新疆地区广泛流行的耐药结核杆菌耐药性是否具有相关性。方法以新疆地区广泛流行的耐药结核杆菌临床分离株为研... 目的:通过比较分析不同耐药的结核杆菌临床分离株PhoP基因和PhoR基因的表达水平差异,探讨研究结核杆菌PhoPR双组分系统与新疆地区广泛流行的耐药结核杆菌耐药性是否具有相关性。方法以新疆地区广泛流行的耐药结核杆菌临床分离株为研究对象,分别提取结核分枝杆菌临床分离药物敏感菌株、单纯耐异烟肼的结核杆菌临床分离株( INH-MTB)、单纯耐利福平的结核杆菌临床分离株( RFP-MTB)、单纯耐链霉素的结核杆菌临床分离株( SM-MTB)、单纯耐乙胺丁醇的结核杆菌临床分离株( EB-MTB)、耐多药结核杆菌临床分离株( MDR)总RNA,并进行纯度鉴定,运用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR的方法,分别检测各组结核杆菌菌株的PhoP基因和PhoR基因的表达,比较分析不同耐药的结核杆菌临床分离株PhoP基因和PhoR基因的表达水平的差异。结果与结核分枝杆菌临床分离药物敏感菌株相比,PhoP基因在RFP-MTB中的表达上调1.48倍,在MDR中的表达上调2.74倍,差异有统计学意义(P<0.05);与MDR相比,PhoP基因在INH-MTB、RFP-MTB、SM-MTB和EB-MTB中的表达下调0.70、0.50、0.25和0.21倍,差异有统计学意义(P<0.05)。与结核分枝杆菌临床分离药物敏感菌株相比,PhoR基因在INH-MTB、RFP-MTB、SM-MTB和EB-MTB中的表达分别上调6.33、4.56、2.34和1.85倍,在MDR中的表达上调9.06倍,差异有统计学意义( P<0.05);与 MDR相比,PhoR基因在INH-MTB、RFP-MTB、SM-MTB 和EB-MTB 中的表达下调0.36、0.54、0.35和0.19倍,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在结核分枝杆菌临床分离药物敏感菌株、INH-MTB、RFP-MTB、SM-MTB、EB-MTB和MDR中,结核杆菌PhoP和PhoR基因的表达有差异,结核杆菌PhoPR双组分系统与新疆地区广泛流行的耐药结核杆菌的耐药性具有相关性。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药性 PhoPR双组分系统
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