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亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFD基因的组织表达分析
被引量:
1
1
作者
张彦楠
蔡大润
黄先忠
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期832-843,共12页
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物中数量最多并且最具多样性的转录因子之一,参与植物生长发育及响应生物和非生物胁迫。本研究利用亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组数据库,通过生物信息学分析分布在13条染色体上...
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物中数量最多并且最具多样性的转录因子之一,参与植物生长发育及响应生物和非生物胁迫。本研究利用亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组数据库,通过生物信息学分析分布在13条染色体上的159个bZIP家族基因的全序列。系统进化、基因结构和保守基序分析表明这些基因分成13个亚家族。其中,A亚家族有3个GaFD基因GaFD1、GaFD2和GaFD3,通过实时荧光定量PCR分析3个GaFD基因在不同组织中的表达,结果表明GaFD1和GaFD2在SAM中的表达量最高,GaFD3在茎中表达量最高。研究表明棉花基因组中具有数量众多的bZIP家族成员,不同基因结构及FD基因不同的表达特征表明bZIP基因在棉花生长发育中可能具有不同的功能,这些结果为进一步解析棉花bZIP家族基因的功能和作用机理积累了有价值的资料。
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关键词
碱性亮氨酸拉链
亚洲棉
FD
进化分析
基因表达
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职称材料
题名
亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFD基因的组织表达分析
被引量:
1
1
作者
张彦楠
蔡大润
黄先忠
机构
石河子大学生命科学学院/植物基因组学实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期832-843,共12页
基金
教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-12-1072)
国家自然科学基金项目(31360366)
新疆生产建设兵团博士基金项目(2012BB007)资助~~
文摘
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物中数量最多并且最具多样性的转录因子之一,参与植物生长发育及响应生物和非生物胁迫。本研究利用亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组数据库,通过生物信息学分析分布在13条染色体上的159个bZIP家族基因的全序列。系统进化、基因结构和保守基序分析表明这些基因分成13个亚家族。其中,A亚家族有3个GaFD基因GaFD1、GaFD2和GaFD3,通过实时荧光定量PCR分析3个GaFD基因在不同组织中的表达,结果表明GaFD1和GaFD2在SAM中的表达量最高,GaFD3在茎中表达量最高。研究表明棉花基因组中具有数量众多的bZIP家族成员,不同基因结构及FD基因不同的表达特征表明bZIP基因在棉花生长发育中可能具有不同的功能,这些结果为进一步解析棉花bZIP家族基因的功能和作用机理积累了有价值的资料。
关键词
碱性亮氨酸拉链
亚洲棉
FD
进化分析
基因表达
Keywords
Basic leucine zipper
Gossypium arboreum
FD
Phylogenetic analysis
Gene expression
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
亚洲棉bZIP蛋白家族的鉴定及GaFD基因的组织表达分析
张彦楠
蔡大润
黄先忠
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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