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金花茶体细胞胚胎Cn-SERK基因的克隆及其生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
翁浩
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第9期1699-1707,共9页
以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,...
以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,定位于内质网的可能性最高。二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在1个蛋白激酶位点。此蛋白可能发生磷酸化的位点有25个。内含子分析结果表明,CnSERK基因由11个外显子和10个内含子组成,内含子的剪切位点符合真核生物GT-AG规则。系统进化树分析结果表明,金花茶Cn-SERK蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)的SERK亲缘关系较近。
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关键词
金花茶
体细胞胚胎
Cn—SERK
基因克隆
生物信息学
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职称材料
题名
金花茶体细胞胚胎Cn-SERK基因的克隆及其生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
翁浩
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所.福建福州
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第9期1699-1707,共9页
基金
福建省重大科技平台建设项目(No.2008N2001)
国家科技支撑计划项目(No.2007BAD07B01)
文摘
以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,定位于内质网的可能性最高。二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在1个蛋白激酶位点。此蛋白可能发生磷酸化的位点有25个。内含子分析结果表明,CnSERK基因由11个外显子和10个内含子组成,内含子的剪切位点符合真核生物GT-AG规则。系统进化树分析结果表明,金花茶Cn-SERK蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)的SERK亲缘关系较近。
关键词
金花茶
体细胞胚胎
Cn—SERK
基因克隆
生物信息学
Keywords
Camellia nitidissima
Somatic embryos
Cn-SERK
Gene cloning
Bioinformatics
分类号
S68 [农业科学—观赏园艺]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金花茶体细胞胚胎Cn-SERK基因的克隆及其生物信息学分析
翁浩
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013
1
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