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桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析
被引量:
1
1
作者
张清华
陆芝
+4 位作者
张晓阳
刘宏毅
丁奕
叶小真
冯丽贞
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2019年第1期88-96,共9页
通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与...
通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与二级结构预测均显示桉树焦枯病菌MDR具有典型的MDR蛋白结构,说明该蛋白家族的进化比较保守;CpABCB10基因参与调控分生孢子稳定性和萌发,CpABCB4和CpABCB9基因参与调控金属离子的转运,CpABCB7和CpABCB8基因参与调控桉树焦枯病菌的抗药机制.此外,CpABCB7基因还能参与调控桉树焦枯病菌的整个致病过程.
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关键词
桉树焦枯病菌
MDR基因
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析
被引量:
1
1
作者
张清华
陆芝
张晓阳
刘宏毅
丁奕
叶小真
冯丽贞
机构
福建农林大学林学院/福建农林大学森林保护研究所
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2019年第1期88-96,共9页
基金
福建省财政厅项目(Scz10039)
福建农林大学科技创新专项(KFA17054A)
文摘
通过生物信息软件及qPCR对桉树焦枯病菌MDR蛋白的序列特征、蛋白结构、理化性质及MDR基因在不同条件下的表达情况进行分析.结果表明,MDR转运蛋白均由α-折叠、无规则卷曲、β-转角,所占百分比α-折叠>β-转角>无规则卷曲.三级与二级结构预测均显示桉树焦枯病菌MDR具有典型的MDR蛋白结构,说明该蛋白家族的进化比较保守;CpABCB10基因参与调控分生孢子稳定性和萌发,CpABCB4和CpABCB9基因参与调控金属离子的转运,CpABCB7和CpABCB8基因参与调控桉树焦枯病菌的抗药机制.此外,CpABCB7基因还能参与调控桉树焦枯病菌的整个致病过程.
关键词
桉树焦枯病菌
MDR基因
生物信息学
表达分析
Keywords
Calonectria pseudoreteaudii
MDR gene
bioinformatics
expression analysis
分类号
S763.15 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桉树焦枯病菌MDR基因生物信息学分析及功能解析
张清华
陆芝
张晓阳
刘宏毅
丁奕
叶小真
冯丽贞
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2019
1
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