基于开放染色质的全基因组水平转录调控元件的研究方法与进展

真核生物转录调控过程是大量的顺式调控元件与反式作用因子相互作用的结果.研究发现,这一调控过程与染色质核小体的动态定位相关,调控因子的结合需要裸露的无核小体的DNA区域,即开放的染色质位点.因此,高效精确地定位基因组上的开放染色质位点为成功地发掘基因组调控元件,乃至揭示基因表达调控机制提供了重要线索和有效手段.本文对开放染色质位点的定义、主要研究方法以及功能注释进行概述,希望对在基因组水平上调控元件的发掘,尤其是在植物中的应用提供借鉴.

利用流式细胞技术测定和评估金线莲基因组大小

利用流式细胞技术对金线莲基因组大小进行测定,选取金线莲新鲜嫩叶为待测材料,选用3种不同的缓冲液进行解离,制备细胞核悬浮液.以鸡红细胞核为内标,使用碘化丙啶(PI)染色,通过流式细胞仪对其荧光强度进行测定;通过比较换算,建立了以流式细胞技术测定金线莲基因组大小的参考方法.研究发现使用Galbraith′s解离液对金线莲样品的解离效果较好,测得金线莲基因组DNA的2C含量为6.83±0.067 pg.结果表明,基于流式细胞技术,优化解离和测定方法可准确测定金线莲的基因组大小.

基于流式细胞技术两种兰属植物基因组大小的测定

基于流式细胞技术对兰属中莲瓣兰和墨兰的基因组大小进行测定,采用Galbraith′s缓冲液解离并制备莲瓣兰和墨兰嫩叶材料的细胞核悬浮液,利用鸡红细胞核(chicken erythocyte nuclei,CEN)作为内标,建立和优化了基于流式细胞技术的两种兰属植物基因组大小的测定方法。研究发现Galbraith’s解离液对莲瓣兰和墨兰样品解离效果最好,测得莲瓣兰的2 C值为(8.15±0.34)pg,墨兰基因组DNA的2 C值为(8.34±0.36)pg。研究结果表明,基于流式细胞技术,优化解离和测定方法可精确测定莲瓣兰和墨兰的基因组大小。本研究丰富了兰科植物的基因库,为揭示该属植物C值大小和物种进化关系提供重要依据,也为其基因组学、分子细胞遗传学等研究奠定基础。

大晶帽石斛再生体系建立研究

本文以成熟度70%原生大晶帽石斛荚果内种子为外植体,探究采用不同消毒时间、培养基成分构成及浓度配比对大晶帽石斛无菌萌发的影响。结果表明,大晶帽石斛荚果用5%次氯酸钠消毒15 min,可有效降低污染率;将消毒后荚果种子接入MS+蛋白胨2 g/L+NAA 0.5 mg/L+花宝1号2 g/L+0.1%活性炭+0.58%琼脂+2%蔗糖培养基中,种子萌发率达88%,是适宜大晶帽石斛无菌萌发的培养基配方。

串珠石斛组培快繁技术

[目的]探讨串珠石斛再生体系及快繁技术,为其规模化生产提供技术支持。[方法]以成熟度为80%的未开裂串珠石斛蒴果种子为外植体,对诱导种子萌发、原球茎增殖和分化、生根壮苗及组培苗移栽等步骤进行优化。[结果]串珠石斛种子萌发及诱导原球茎最适培养基为:1/2MS+6.5 g·L^-1琼脂+25 g·L^-1蔗糖+1.0 g·L^-1活性炭+1.0 g·L^-1蛋白胨+1.5 mg·L^-16-BA+0.5 mg·L^-1 NAA;接种30~40 d对比发现,对原球茎增殖和分化有明显促进作用的继代培养基为:MS+6.5 g·L^-1琼脂+25 g·L^-1蔗糖+1.0 g·L^-1活性炭+2.0 mg·L^-16-BA+40 g·L^-1马铃薯;最佳生根壮苗培养基为:MS+6.5 g·L^-1琼脂+25 g·L^-1蔗糖+1.0 g·L^-1活性炭+45 g·L^-1香蕉,生根率可达93.2%。[结论]以蒴果种子为外植体,可以建立串珠石斛高效快繁技术体系。

番木瓜环斑病相关基因表达分析

番木瓜环斑病毒(PRSV)对全球的番木瓜产业造成了严重的损害,PRSV如何在基因层面影响番木瓜目前还不是十分清楚。本研究对未感染和感染PRSV的番木瓜叶片中与植物病毒相关基因进行Q-PCR分析与比较,以探究PRSV影响番木瓜的生长发育的原因。结果表明,PRSV通过抑制MYB、WRKY、ERF等转录因子和CA2、PDR等转运蛋白的表达,进而影响番木瓜的生长发育。

不同果肉颜色蜜柚番茄红素环化酶基因的表达分析

以福建平和县不同颜色果肉的蜜柚为材料,利用实时荧光定量PCR技术,测定红色、橙黄色和蜡白色成熟果果肉中番茄红素环化酶-b1基因(Cm LCY-b1),番茄红素环化酶-b2基因(Cm LCY-b2)和番茄红素环化酶-e基因(Cm LCY-e)的相对表达量。结果表明,Cm LCY-b1,Cm LCY-b2,Cm LCY-e在果肉中表达量不同;同1个基因在3种不同颜色的果肉中表达量有差异。在3种颜色果肉中,Cm LCY-b2表达平稳且表达量较高;而Cm LCY-b1和Cm LCY-e表达量在不同果肉中差异明显。推测Cm LCY基因可能是柚子果肉颜色差异的原因之一。

染色体构象及其研究方法—3C技术

作为遗传物质载体的染色体在细胞中并非随机分布,而是占据一定的核空间,即染色体领域(chromosome territory,CT)。染色体领域所表现出的拓扑结构及动力学特征与基因的表达,DNA的复制,DNA的损伤修复以及基因组的稳定性密切相关。传统的细胞学方法,例如荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术,以及近些年发展起来的染色体构象捕获(chromosome conformation capture,3C)技术及其衍生技术是开展基因组构象研究的有效手段。本综述介绍了染色体空间结构的特点、不同分布模式以及3C技术的原理及其应用,希望藉此加深人们对这一领域的理解,并为植物功能基因组的研究提供借鉴。

金线莲不同栽培模式及不同组织的多糖含量

以金线莲植株为材料,采用蒽酮硫酸法测定不同种源、栽培模式、栽培时间及不同组织的多糖含量.结果表明:不同栽培模式下,金线莲多糖含量的大小为:阔叶林林下栽培苗>繁殖瓶苗>大棚栽培苗,以林下栽培3个月的多糖含量最高;不同栽培时间金线莲各组织的多糖含量不同,处于蕾期、花期的金线莲,其根部的多糖含量最高,其他时期则以茎、叶的多糖含量高;栽培3个月时,多倍体金线莲的多糖含量为6.12%,水培金线莲的多糖含量达13.26%.多倍体和水培金线莲可用于多糖的提取与开发应用.

番木瓜3个品种中不同性别植株的光合速率测定

为研究番木瓜同一品种内不同性别植株的光合差异,利用Li-6400型光合测定系统对番木瓜3个品种不同性别植株叶片的净光合速率日变化进行测定。结果表明,3个番木瓜品种植株的光合速率日变化都呈现为单峰曲线;同一品种内不同性别植株的光合作用日变化趋势大致相同,但峰值大小呈现一定的差异。此外,3个品种中雌性株净光合速率均高于雌雄同花植株。