马铃薯Y病毒多基因系统发育分析及其在株系鉴定中的应用

为实现马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)常见株系的快速鉴定,本文以PVY的P1、HC-pro、VPg和CP 4个基因为研究对象建立了快速准确的多基因联合体系。根据基因的不同组合建立5个不同数据集,分别进行系统发育分析,并通过贝叶斯标签关联显著性(Bayesian tip-association significance,Ba TS)分析各数据集中代表分离物与株系的关联性,以确定实现PVY快速鉴定的最佳组合。不同数据集的系统发育及Ba TS分析结果显示,除了联合P1、VPg和CP 3个基因数据集外,其他4个数据集均无法实现PVY常见株系的准确鉴定。采用不同建树方法对联合P1、VPg和CP 3个基因数据集比较分析显示,基于ML法和NJ法的系统发育树在拓扑结构上基本一致,均优于基于贝叶斯算法的最大分支置信(maximum clade credibility,MCC)树。同时,以HLJ26分离物为研究对象,对建立的多基因联合体系进行实际应用,结果显示该分离物与PVY^(NTN-NW)株系的3个分离物SYR-Ⅱ-2-8、SYR-Ⅱ-Be1和SYR-Ⅱ-Dr H以高置信值聚为一亚簇,表明该分离物可能属于PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)。重组分析显示,HLJ26基因组存在4个潜在的重组信号,分别位于P1、HC-pro/P3、VPg和CP的5￠-末端,与PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)的重组位点相一致,表明其属于PVYNTN-NW株系(SYR-Ⅱ型)。同时,应用多重RT-PCR成功扩增出约为1000 bp和400 bp的2个特异性片段,与PVY^(NTN-NW)株系(SYR-Ⅱ型)的特异条带大小相一致。这些结果进一步支持了多基因联合体系的鉴定结果。联合P1、VPg和CP 3个基因数据集系统发育分析,可以实现PVY常见株系的准确鉴定。

细菌冷激蛋白研究进展

冷激蛋白(cold shock protein,CSPs)是微生物受到冷刺激所诱导合成的分子量为7 k Da左右的蛋白质,它们与细胞在低温环境下的应激反应密切相关。冷激蛋白的功能是作为RNA的分子伴侣与mRNA结合,阻止mRNA二级结构的形成,从而使翻译顺利进行。主要介绍了细菌冷激蛋白的功能、应用以及调控机制的研究进展,以期为更深入的生产应用和功能等的科学研究提供参考。

福建省大豆疫霉菌对甲霜灵和嘧菌酯的敏感性测定

[目的]明确甲霜灵和嘧菌酯对福建省大豆疫霉菌的毒力。[方法]采用菌丝生长速率法测定了2013—2015年采自福建省大豆主产区180个大豆疫霉菌株对甲霜灵和嘧菌酯的敏感性。[结果]甲霜灵对180个菌株的平均EC50值为(0.2044±0.0243)mg/L,其中厦门云洋的菌株较漳州榜山和罗坑的菌株敏感。嘧菌酯对180个菌株的平均EC50值为(1.0952±0.0924)mg/L,其敏感性呈连续单峰曲线分布,可作为大豆疫霉菌对嘧菌酯抗药性监测的敏感性基线。[结论]福建省大豆疫霉菌对甲霜灵和嘧菌酯均敏感,但甲霜灵的抗性呈上升趋势,具有较大的抗性风险。