基于缺氧相关基因预测宫颈癌预后模型风险模型的构建

筛选缺氧相关基因,建立预测宫颈癌预后的风险模型,探索其与宫颈癌发生发展可能存在的关系。方法 获取癌症基因图谱(TCGA)数据库中,宫颈癌患者的转录组数据和临床病理资料,从 MSigDB数据库下载并通过生物信息学方法筛选缺氧相关基因,从而进一步建立宫颈癌预后预测模型。利用Kaplan-Meier 曲线、受试者操作特征性曲线(ROC)、C-index、校准曲线进行验证。基于R 语言探索风险模型与化疗药物敏感性的关系,分析风险模型与免疫功能之间的相关性,构建列线图模型。结果 构建了由TP53、P4HA2、EGLN1、PLOD2、CXCL8组成的缺氧相关的宫颈癌预后模型,在训练组与验证组都显示出较好的预测性能。宫颈癌缺氧相关风险模型与免疫细胞的浸润和对药物的敏感性表现出很强的相关性。结论 基于5个缺氧相关基因,构建的具有预后价值的宫颈癌风险模型可能是宫颈癌预后的预测工具,有望指导患者的个体化治疗。

SERPINB4在宫颈癌中的表达及其预后价值

目的探讨丝氨酸蛋白酶抑制剂B4(SERPINB4)在宫颈癌中的表达与预后相关性,分析其在宫颈癌中与肿瘤免疫浸润的关系。方法基于TCGA与GTEx数据库获取宫颈癌相关的表达数据和临床参数,分析SERPINB4在正常宫颈组织和宫颈癌组织中的表达水平与临床病理特征、肿瘤浸润免疫细胞,免疫检查点标志分子及对化疗药物敏感性之间的相关性。应用Kaplan-Meier生存分析方法与ROC曲线评估SERPINB4在宫颈癌中的预后价值,并将SERPINB4及其共同表达基因进行GO与KEGG富集分析,探讨SERPINB4在宫颈癌中可能调控的分子信号通路。结果SERPINB4在宫颈癌组织中呈高度表达(P<0.05);SERPINB4与宫颈癌患者不良预后(P=0.035)及远处转移(P=0.0092)相关;6个TIICs与SERPINB4表达呈正相关,其表达与多个免疫检查点存在统计学意义;SERPINB4在免疫细胞评分、基质细胞评分和综合评分较低组均升高,并且在宫颈癌患者中SERPINB高表达对靶向药物敏感性较差;GO分析发现SERPINB4及共表达基因多富集在免疫相关功能的调控,KEGG通路富集显示SERPINB4及共表达基因可能参与调控cAMP信号通路。结论与正常宫颈组织相比,在宫颈癌组织中SERPINB4的高表达与患者预后不良及肿瘤免疫浸润有关,SERPINB4可能是宫颈癌的预后分子标志物和潜在的免疫治疗靶点。