2015—2023年龙岩市常见鼠传疾病流行特征分析

目的了解龙岩市鼠传疾病的种类和流行特征,为鼠传疾病的防控及疫情处置提供依据。方法描述中国疾病预防控制信息系统中2015—2023年龙岩市鼠传疾病疫情报告资料的“三间分布”,使用χ^(2)检验或Fisher确切概率法进行比较分析。结果2015—2023年龙岩市共报告鼠传疾病病例670例,肾综合征出血热(HFRS)8例、钩体病18例、斑疹伤寒8例、恙虫病636例,无死亡病例和暴发疫情。各年度发病率先上升后下降(χ^(2)_(线性)=13.582,P<0.001),2021年达最高,恙虫病(χ^(2)_(线性)=11.590,P=0.001)的发病月份以6—10月为主(占65.4%);地区分布(χ^(2)=611.734,P<0.001)发病率最高分别为HFRS漳平市(0.18/10万)、钩体病武平县(0.52/10万)、斑疹伤寒永定区(0.10/10万)、恙虫病武平县(8.72/10万)。结论2015—2023年龙岩市常见鼠传疾病呈散发状态,发病水平相对平稳,呈下降趋势,但发病风险仍然存在,特别是武平县恙虫病和钩体病,需继续加强监测及预防控制。

龙岩市肺炎克雷伯菌分子分型与耐药性分析

目的了解龙岩地区人感染肺炎克雷伯菌的分子分型特征、耐药特性及部分耐药机制,为肺炎克雷伯菌感染的防治提供参考。方法收集2017-2020年龙岩市辖区综合医院分离的人感染肺炎克雷伯菌,采用PFGE技术进行分子分型检测,运用BioNumerics软件进行聚类分析,采用MIC法及K-B法进行耐药性检测。结果66.67%的肺炎克雷伯菌分离自痰液标本,129株肺炎克雷伯菌分子分型与聚类分析显示龙岩市人感染肺炎克雷伯菌菌株间相似度为54.3%~100%,可分为118个PFGE型别,不存在优势流行型别。对110株肺炎克雷伯菌进行药敏试验,有92株耐药,耐药率为0.90%~22.73%,其中产AmpC酶菌3株,占3.26%(3/92),该菌对左氧氟沙星敏感;产ESBLs酶菌株占21.82%(24/110),对多粘菌素B和亚胺培南均敏感。产AmpC或ESBLs菌株对抗菌药物的耐药率显著高于不产AmpC和ESBLs的菌株(χ^(2)AmpC=60.682,P<0.01;χ^(2)ESBLs=122.038,P<0.01)。3株菌对美罗培南耐药,其中1株同时对亚胺培南耐药,1株同时对多粘菌素耐药。多重耐药肺炎克雷伯菌检出率为15.45%,最多达八重耐药。结论龙岩市人感染肺炎克雷伯菌呈分子多态性分布,对抗菌药物总体耐药相对较低,产AmpC酶较低,但产ESBLs酶及多重耐药率较高,存在产碳青酶烯酶且同时耐多粘菌素的强耐药株,因此需要加强对肺炎克雷伯菌的耐药性监测。

2011～2014年中国福建龙岩市Echo 30型病毒分子流行病学特征分析

了解中国福建省龙岩市2011-2014年病毒性脑炎散发病例中Echo 30分子流行病学特征。收集病毒性脑炎或中枢神经系统感染脑脊液标本,细胞培养分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因序列全长以鉴定Echo 30血清型及遗传特征分析。2011-2014年共从608例监测病例中分离到168株肠道病毒,其中60株为Echo 30;60例Echo 30相关病例分析显示,Echo 30流行高峰为6-8月;波及年龄范围广,以小于10岁高发（65%）;临床症状以发热、头痛和呕吐为主,脑脊液清,细胞和蛋白含量检测多增加。VP1区分析显示,2011-2014年龙岩流行株均属于h基因型,但有两个传播链共同循环;与2011年导致福建省病毒性脑炎暴发毒株高度同源,但2014年龙岩株均在VP1蛋白I 120V出现新氨基酸变异。福建省2011年暴发流行株仍流行于龙岩市,且两个传播链病毒仍共同循环,但2014年病毒株出现了新的变异,持续监测将有利于早期发现病毒变异积累和评估疾病流行的风险。

福建省龙岩市2011年病毒性脑炎病例埃可病毒30型分析

目的分析龙岩市2011年病毒性脑炎病例埃可病毒[人肠道致细胞病变孤儿病毒,Enteric Cytopathogenic Human Orphan（ECHO）Virus]30型（ECHO30型）特征。方法对龙岩市2011年某医院病毒性脑炎住院病例采集脑脊液（Cerebrospinal Fluid,CSF）进行病毒分离、血清中和试验定型;选取4株ECHO30型分离株,测定VP1编码区序列,与国内外其他病毒株进行比较。结果从142份患者CSF标本中分离到ECHO30型20株、ECHO11型7株、ECHO6型10株。4株ECHO30型VP1编码区序列长度为606个核苷酸,编码202个氨基酸。4株的核苷酸和氨基酸同源性分别为97%~100%和88%~100%。与2000年Bastianni原型株的核苷酸和氨基酸同源性分别为81%~82%和81%~93%。与2010年山东省、2011和2012年福州市流行毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为96%~100%和87%~100%。系统进化树分析显示,4株龙岩分离株同属基因型（Genotype）Ⅱ。结论龙岩市2011年病毒性脑炎病例的ECHO_（30）型为GenotypeⅡ。

龙岩市2022年肉禽屠宰配送环节及市售食品单核细胞增生李斯特菌检测分析

目的 了解龙岩市肉禽屠宰与配送环节中环境与禽肉以及市售调理肉制品、水产品、生禽肉中单核细胞增生李斯特菌(L.m)的污染状况,为预防L.m致食源性疾病提供依据。方法 采用GB 4789.30—2016《食品安全国家标准食品微生物学检验单核细胞增生李斯特氏菌检验》方法,并参照《2022年国家食品污染物和有害因素风险监测工作手册》,采集某屠宰场禽肉及其环境样本,以及海鲜市场、集贸市场的调理肉制品、水产品、生禽肉等食品样本,进行L.m分离鉴定和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型与聚类分析。结果 136份样本中L.m检出率为6.6%(9/136)。屠宰与配送环节样本的L.m检出率为4.2%(3/71),分离自屠宰场分割刀具案板、分割后鸡肉以及工人手等样本。市售食品样本的L.m检出率为9.2%(6/65),其中调理肉制品和水产品及其制品的检出率分别为25.0%(3/12)和9.1%(3/33)。9株L.m经PFGE检测并聚类分析,得到8种条带,菌株F22041和F22043的相似性为100.0%,菌株F22200与这两株菌的相似性为88.0%,其余菌株间相似性<80%。结论 龙岩市禽肉生产流通过程中屠宰与配送环节的环境与禽肉样本,以及市售调理肉制品、水产品及其制品中存在L.m污染,且有不同的污染来源,应加强对污染食品和场所及人员监管,预防食品安全事件发生。

2012-2014年龙岩市手足口病病原学监测结果分析

目的了解2012-2014年龙岩市手足口病病原学特征和流行病学特征,为龙岩市手足口病的防控提供病原学依据。方法用荧光RT-PCR方法对龙岩市各监测哨点医院送检的1 644例手足口病病例样本,进行肠道病毒核酸检测,并对检测结果进行统计描述和分析。结果 1 644例手足口病病例中,检出肠道病毒核酸阳性1 290例,阳性率为78.47%,其中EV71阳性290例,阳性率为17.64%;CoxA16阳性286例,阳性率为17.40%;未分型肠道病毒711例,阳性率为43.25%;EV71+CoxA16混合感染3例,阳性率为0.18%。重症病例以EV71为主;患者年龄11d^47岁,平均(2.37±1.92岁),患者主要为≤3岁幼儿,共1 115例,占86.43%,不同性别患者阳性率差异无统计学意义(χ2=2.29,P>0.05)。手足口病全年各月均可发病,具有明显的季节性,病例数主要集中在4~7月,占病例总数的44.40%。2012-2014年共报告重症病例26例,死亡1例,死亡病例病原体为EV71型。EV71为重症病例和死亡病例的主要病原体。结论 2012-2014年引起龙岩市手足口病的流行有明显的季节性,≤3岁幼儿为手足口病防控的重点人群,2012年手足口病病原构成以EV71为主,2013年和2014年手足口病病原构成发生变化,由其他肠道病毒占主导地位,因此应加强未分型样本的监测工作。

一起儿童病毒性脑炎暴发肠道病毒ECHO6型分离株VP1基因特征分析

目的对埃可病毒6型(ECHO6)福建龙岩分离株进行分子生物学分析,阐明ECHO6病毒福建龙岩分离株的分子生学特征及其与世界其它分离株的基因关系。方法采集暴发病例脑脊液标本,用RD细胞进行分离病毒,阳性分离物采用中和试验及PCR序列分析确定其血清型别;RT-PCR扩增VP1基因全长,测定序列进行同源性及亲缘进化树分析。结果 13例细胞培养阳性分离物经中和试验及序列分析结果均为ECHO6。随机选取4株病毒株进行VP1全基因序列分析显示:4个病毒株之间同源性>99%;与山东病毒株E6/SD/sewage/081226/2-2同源性高于其他参考株。在遗传进化树上,4株分离病毒株同属一个分支,为C2亚型。结论 ECHO6是引起本次福建省龙岩市长汀县儿童病毒性脑炎暴发的病原体,其基因型为C2亚型。

龙岩市鼠伤寒沙门菌分子分型、毒力基因及耐药性测定

目的分析龙岩市鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特点、耐药特征和毒力基因的携带情况,为制定防治措施提供参考。方法收集自2010—2017年散发腹泻病例、食物中毒和生禽肉中分离的鼠伤寒沙门菌79株。进行PFGE分析并测定对15种常用药物的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC),同时对其中55株用PCR方法检测沙门菌9个毒力基因(sopB、invA、sifA、sscA、sseE、spvB、pefA、spvR、spvC)片段。结果79株鼠伤寒沙门菌分为61个PFGE型别,其中P1、P3和P21型分别包含10、3和4株。P1带型中的7株来源于1起食物中毒事件。按照85%的分类标准,79株鼠伤寒沙门菌可分为5个优势基因簇(G1~G5)。79株鼠伤寒沙门菌药敏结果以氨苄西林耐药率最高(88.61%),其次是四环素(87.34%)和链霉素(73.41%)。耐3种或3种以上抗菌药物的多重耐药菌占84.81%(67/79)。进行毒力基因检测的全部55株菌均检出invA、sopB、sseE、sscA,其中54株检出sifA,31株(56.4%)检出spvC,分别有10、11、12株检出spvB、spvR、pefA(18%~22%)。检出5种或6种毒力基因的菌株占76.4%(42/55),均为invA、sopB、sseE、sscA、sifA阳性,spvB、spvR、pefA阴性,检出全部9种毒力基因的菌株占18.2%(10/55)。结论龙岩市鼠伤寒沙门菌PFGE型别呈现多态性,存在3个优势PFGE型别簇。在食物中毒事件中,PFGE分子分型检测能快速预警鼠伤寒沙门菌散在暴发和溯源。鼠伤寒沙门菌多重耐药现象应引起重视,需加强对多重耐药株的监控及抗菌药物使用的监管。鼠伤寒沙门菌携带毒力基因数量较多,毒力较强。

龙岩市一起暴发性脑炎疫情分离的埃可病毒6型基因特征分析

对2010年福建省龙岩市长汀县埃可病毒6型（ECHO6）肠道病毒引起的暴发性脑炎,进行病原学分析,为该病的防控提供有价值的信息。对病例脑脊液标本进行荧光RT-PCR、病毒分离（RD细胞）、中和鉴定进行病原确认,再经PCR法对其中4株毒株进行VP1片段或全基因组核苷酸序列测定,用DNAStar软件中的MegAlign等软件进行同源性分析,Mega 4.0软件进行进化树分析。经病原学检测方法确认为ECHO6型肠道病毒,VP1片段核苷酸序列分析显示为C2亚型。全基因组序列共7 407个核苷酸,与其他ECHO病毒和CVB（Coxsackie virus B）病毒基因组构成相似,同源性为78.5%~87.3%。此次暴发性脑炎是由肠道病毒ECHO6C2亚型引起,病毒株全基因组序列长度与标准株（U16283）相近,同源性达80.4%。

龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒基因特征分析

目的了解龙岩市手足口病病原体柯萨奇B5病毒（Coxsackie virus B5,CVB5）VP1区基因特征及变异情况。方法对2011年采自确诊手足口病患者的Real-time RT-PCR法检测肠道病毒通用引物阳性而肠道病毒71型（enterovirus 71,EV 71）和柯萨奇病毒A 16型（Coxsackie virus A 16,CVA16）阴性未分型样品,经RD细胞分离肠道病毒。从培养上清中提取RNA核酸,经RT-PCR法初步鉴定病毒型别。应用187/222引物对扩增病毒株的VP1区,回收产物经克隆、筛选后测序。采用ClustalX、Mega5.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和进化树构建。结果 104份未分型样品中分离到3株CVB5。3株CVB5分离株VP1区长度为330-357个核苷酸,编码110-119个氨基酸。3株间的核苷酸同源性为97%-99%,氨基酸同源性为84%-99%。比较推导的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1与另外2株龙岩分离株相比有18个位点差异,核苷酸序列287-288位发生插入突变,第290、291、338、339位发生颠换,与2010年长春株JN695051的同源性最高（核苷酸同源性95%-98%,氨基酸同源性84%-99%）。结论 2011年福建省龙岩市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒与2005年法国株和国内山东、长春、昆明、浙江病毒株属同一型别。

2011年龙岩市流行株柯萨奇病毒A组16型VPl基因特征分析

目的分析2011年龙岩市流行的柯萨奇病毒A组16（CVA16）分离株的分子生物学特征。方法对从龙岩市2011年散发的手足口病（HFMD）患者标本中分离CVA16病毒,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增VPl基因片段全长,并对扩增产物测序。根据VPl基因核苷酸序列与国内外其他CVA16毒株序列构建进化树,并进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果 4株龙岩分离株CVA16核苷酸同源性为99%~100%。比较推导的氨基酸序列,VP1不存在位点差异,氨基酸序列完全相同。对分离株病毒进行VP1核苷酸序列两两差异分析,与国内其他分离株VP1基因序列的一致性为87%~100%。确定4株CVA16病毒均属于B1b基因型。结论引起2011年龙岩市HFMD流行的CVA16病毒均为B1b基因型,与目前国内其他地区流行毒株高度同源。

龙岩市764例儿童病毒性脑炎流行病学特征分析

目的分析龙岩市儿童病毒性脑炎（EV）流行病学特征,为制定防治策略提供依据。方法对2004—2011年764例患者进行流行病学、临床表现和检查分析。结果病例无聚集现象,以≤7岁为主,男性较多,5~7月为发病高峰。患儿多出现发热（86.1%）、头痛（64.8%）、呕吐（61.5%）、颅内压增高（72.4%）、脑脊液白细胞数增加（58.4%）、脑电图异常（79.0%）;脑积液病毒分离阳性率18.6%,以埃可病毒（ECV）为主（90.1%）。2004和2010年的暴发疫情分别由ECV19和ECV6引起。结论病毒性脑炎多散在发生,临床表现以无菌性脑膜炎为主,实验室检查有利于病例诊断。ECV是主要病原体,ECV30为当地持续流行的毒株。

龙岩市2006-2010年手足口病流行特征分析

目的分析龙岩市手足口病流行病学和病原学特征,为防控工作提供依据。方法采用描述流行病学方法,对手足口病监测数据进行分析。结果 2006-2010年共报告6 804例,发病率分别为2.86/10万、3.64/10万、43.83/10万、50.60/10万和140.77/10万;2岁组最多,男性多于女性,儿童占93%以上。重症71例,死亡8例。5月和9月为高峰期。2006-2007年病原均为CoxA16,2008年5月后以EV71为主,2009年和2010年两型都有,但重症病例以EV71为主。EV71病毒均为C4基因亚型。结论龙岩市手足口病例逐年增加,应加强5岁以下儿童防控工作,散居儿童是防控重点。

龙岩市2011年病毒性脑炎131例分析

目的分析龙岩市病毒性脑炎的流行特征及肠道病毒感染情况,为防控和临床诊治积累经验。方法对2011年发生的病毒性脑炎131例开展个案调查,对其脑脊液标本进行病毒分离、中和试验和病原确认。结果病毒性脑炎发病具有明显季节性,6、7月为发病高峰。131份标本肠道病毒阳性26株(19.8%),均为埃可病毒(ECHO);型别为ECHO30、ECHO 6和ECHO 11,以ECHO 30为常见血清型。临床上,患者多有发热、头痛和呕吐等症状,且以中高热为主,部分表现为咳嗽、腹痛、腹泻及皮疹等;大部分脑脊液外观正常,压力增高,白细胞增多,糖和氯化物基本正常。有63.9%的病例脑电图异常,76.0%的病例头部MRI异常。结论病毒性脑炎肠道病毒的主要型别有一定规律,新型肠道病毒传入或病毒发生变异,可发生感染或发病。因此,必需加强对肠道病毒的进一步监测。

2009年龙岩市人肠道病毒71型VPl基因特征分析

目的分析2009年龙岩市流行的人肠道病毒71(EV71)分离株的分子生物学特征。方法从手足口病例的153份咽拭标本中分离EV71病毒株,选取其中3株,用RT-PCR扩增VP1基因片段,并进行测序和病毒种系进化等分析。结果 3株EV71均为C4基因亚型,与其他省份C4亚型分离株的同源性为94.8%～99.0%;其中EV71/FJ-LY241/09和EV71/FJLY299/09具有更高的同源性,而另1株EV71/FJLY231/09与其他2株距离稍远。氨基酸序列分析表明,3株病毒的VP1具有3个氨基酸位点差异。结论 2009年龙岩市流行的EV71为C4基因亚型,与目前国内其他省份流行的毒株无显著差别,但不同分离株有一定差异,其原因需进一步监测和研究。

龙岩市2018年流感样病例多种病原体检测结果分析

目的了解龙岩市流感样病例的病原体分布特点及流行特征,为其早期诊断治疗和预防控制提供病原学依据。方法以龙岩市流感监测哨点医院2018年采集送检的流感样病例标本为对象,用分层随机抽样法抽取标本,用荧光定量PCR技术进行多种病原体检测。结果龙岩市2018年共检测流感样病例标本167份,病原阳性率40.7%(68/167)。68例阳检病例以1种病毒感染为主(88.2%),其次为2种病原体感染(10.3%)和3种病原体感染(1.5%);累计检出病原体77珠,其中以流感病毒占32.5%、其次为鼻病毒占18.2%、腺病毒占13.0%和肺炎支原体占13.0%。不同年龄组检出的病原分布略有不同,≥5岁年龄组检出病原前4位为流感病毒、鼻病毒、腺病毒和肺炎支原体,而<5岁年龄组的为鼻病毒、流感病毒、肺炎支原体和副流感病毒。结论龙岩市流感样病例病原阳性率40.7%。流感病毒是呼吸道感染常见病原体。鼻病毒感染应引起临床重视,春季应关注人偏肺病毒感染。临床治疗效果不明显的病例应关注腺病毒合并肺炎支原体感染。

龙岩市2015年布鲁氏菌病暴发疫情分析

目的调查分析龙岩市2015年布鲁氏菌病暴发疫情,为防控提供科学依据。方法采用现场流行病学调查方法,对病例发病情况及感染来源进行分析,应用血培养、血清试管凝集试验和RT-PCR对血液标本进行检测。结果共发现5例布鲁氏菌病例,血清抗体滴度均≥1∶800;对5例可疑病例进行布鲁氏菌分离培养,分离到2株羊种布鲁氏菌;对4例可疑病例血浆样本及血液增菌培养物进行RT-PCR检测,1例布鲁氏菌阳性。结论 2015年龙岩市5例布鲁氏菌病疫情,因养殖户接触病羊导致感染。

2014～2015年龙岩市手足口病流行病学及病原学特征分析

目的对龙岩市2014~2015年HFMD流行病学和病原学特征进行分析,为防控提供依据。方法运用描述流行病学方法对龙岩市2014~2015年HFMD资料进行分析。采用实时荧光RT-PCR法对龙岩市HFMD监测标本进行肠道病毒核酸检测。结果 2014~2015年共报告HFMD病例17 436例,5岁以下病例占94.24%,男性(61.95%)多于女性(38.05%)。男性年均发病率为404.27/10万,女性为266.82/10万,男女发病率差异有统计学意义(P<0.01)。发病呈双高峰分布,分别在3~5月(发病6 497例,占总病例数的37.26%)和9~11月(发病数为6 091例,占总病例数的34.93%)。1 220例HFMD标本病毒核酸检测,结果 EV核酸阳性952例(78.03%),其中CoxA6占29.18%,EV71占20.66%,CoxA16占18.85%,CoxA10占4.43%,Echo30占0.08%,未分型占4.84%。结论龙岩市HFMD发病以5岁以下儿童为主,跟往年相比2014~2015年HFMD病原学发生明显的变化,以CoxA6为主。加强病原学监测,做好5岁以下散居儿童HFMD防控,是当前防控工作的重点。

龙岩市2007-2012年细菌性痢疾流行特征分析

目的分析2007-2012年龙岩市细菌性痢疾的流行特征,为防制细菌性痢疾提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对龙岩市2007-2012年细菌性痢疾报告资料进行分析。结果 2007-2012年龙岩市细菌性痢疾发病率波动在7.53/10万～13.00/10万之间,年发病率为9.80/10万,呈逐年下降趋势。全年各月均可发病,以夏秋季节为高峰;各年龄组均可发病,以0～4岁组发病率最高（79.60/10万）;在不同职业中,发病顺位由高到低依次为散居儿童、农民、幼托儿童和学生;男性多于女性。结论龙岩市细菌性痢疾的流行具有明显的地区、季节和人群特征,在高发地区和流行季节,针对重点人群采取综合性防控措施,将是龙岩市防制细菌性痢疾的有效策略。

2013-2017年龙岩市突发公共卫生事件监测分析

目的分析龙岩市突发公共卫生事件的流行特征,为预防和控制突发公共卫生事件提供科学依据。方法运用描述流行病学方法分析2013-2017年龙岩市通过《突发公共卫生事件管理信息系统》报告的突发公共卫生事件,采用Exce2007、SPSS22.0软件进行数据处理和统计分析。结果 2013-2017年龙岩市共报告突发公共卫生事件70起,发病860例,死亡4例(均为手足口病),罹患率为2.06%,病死率为0.47%。事件级别主要为未分级事件,占90.00%(63/70),事件类型以传染病类事件为主,占94.29%(66/70),排在前3位的是水痘(19起)、流行性感冒(16起)、手足口病(15起)。5月、11月份是突发公共卫生事件的高发时期,学校是突发公共卫生事件发生的主要场所,尤其是农村的小学和幼儿园。结论龙岩市突发公共卫生事件以传染病类事件为主,做好呼吸道传染病、肠道传染病的防控,加强高峰期学校的传染病防治工作,是减少突发公共卫生事件发生的关键。