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基于网络药理学与分子对接探讨三七治疗胃癌的作用机制及药效活性物质
1
作者
辜雅萍
何燕彬
+2 位作者
倪卓娜
黄彬
林久茂
《神经药理学报》
2023年第2期15-23,共9页
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨中药八宝丹中唯一已知植物成分三七治疗胃癌的潜在药效活性成分及其作用机制。方法:通过TCMSP等数据库筛选三七的有效活性成分及相关靶点蛋白,将GeneCards和DisGeNET等数据库挖掘的胃癌相关靶点...
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨中药八宝丹中唯一已知植物成分三七治疗胃癌的潜在药效活性成分及其作用机制。方法:通过TCMSP等数据库筛选三七的有效活性成分及相关靶点蛋白,将GeneCards和DisGeNET等数据库挖掘的胃癌相关靶点和药物靶点蛋白交集;采用Cytoscape3.7.0对药效成分进行分析,建立有效的成分靶点疾病的关系模型。运用STRING数据库构建交集靶点的PPI蛋白互作图。运用David数据库进行KEGG通路和GO分类的富集分析;利用AutoDock Tools 1.5.6软件对三七关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证,运用PyMol 2.5软件绘制对接模式图。结果:筛选出三七的有效活性成分99个,映射273个药靶基因。经GeneCards数据库搜集得到胃癌疾病基因15118个,三七与胃.癌的交集靶点234个,分析得到165条KEGG富集通路.195条GO功能富集条目,主要包括癌症的途径、PI3K-Akt通路、MAPK通路.Ras通路,以及RNA聚合酶启动子转录的正向调节、信号转导、基因表达的正调控、正调节细胞增殖、负调节细胞凋亡等生物过程;其中高Hub值的化合物成分豆甾醇、人参皂苷rh2与胃癌基因白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、TP53、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)存在较强的分子对接关系。结论:三七治疗胃癌的机制涉及多成分多靶点和多途径,三七可能是通过调节癌症的途径、PI3K/Akt通路、MAPK通路、Ras信号通路等在胃癌治疗中发挥作用,其中豆甾醇、人参皂苷rh2可能是三七药效的关键活性成分之一。
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关键词
三七
胃癌
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探讨三七治疗胃癌的作用机制及药效活性物质
1
作者
辜雅萍
何燕彬
倪卓娜
黄彬
林久茂
机构
福建
中医药大学
中西医
结合
研究院
福建省中西医结合老年性病重点疾病实验室
福建省
高校
中西医
结合
基础
重点
实验室
福州经济技术开发区医院
出处
《神经药理学报》
2023年第2期15-23,共9页
基金
福建省自然科学基金项目(No.2019J01355)。
文摘
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨中药八宝丹中唯一已知植物成分三七治疗胃癌的潜在药效活性成分及其作用机制。方法:通过TCMSP等数据库筛选三七的有效活性成分及相关靶点蛋白,将GeneCards和DisGeNET等数据库挖掘的胃癌相关靶点和药物靶点蛋白交集;采用Cytoscape3.7.0对药效成分进行分析,建立有效的成分靶点疾病的关系模型。运用STRING数据库构建交集靶点的PPI蛋白互作图。运用David数据库进行KEGG通路和GO分类的富集分析;利用AutoDock Tools 1.5.6软件对三七关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证,运用PyMol 2.5软件绘制对接模式图。结果:筛选出三七的有效活性成分99个,映射273个药靶基因。经GeneCards数据库搜集得到胃癌疾病基因15118个,三七与胃.癌的交集靶点234个,分析得到165条KEGG富集通路.195条GO功能富集条目,主要包括癌症的途径、PI3K-Akt通路、MAPK通路.Ras通路,以及RNA聚合酶启动子转录的正向调节、信号转导、基因表达的正调控、正调节细胞增殖、负调节细胞凋亡等生物过程;其中高Hub值的化合物成分豆甾醇、人参皂苷rh2与胃癌基因白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、TP53、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)存在较强的分子对接关系。结论:三七治疗胃癌的机制涉及多成分多靶点和多途径,三七可能是通过调节癌症的途径、PI3K/Akt通路、MAPK通路、Ras信号通路等在胃癌治疗中发挥作用,其中豆甾醇、人参皂苷rh2可能是三七药效的关键活性成分之一。
关键词
三七
胃癌
网络药理学
分子对接
Keywords
notoginseng
gastric cancer
network pharmacology
molecular docking
分类号
R966 [医药卫生—药理学]
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作者
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1
基于网络药理学与分子对接探讨三七治疗胃癌的作用机制及药效活性物质
辜雅萍
何燕彬
倪卓娜
黄彬
林久茂
《神经药理学报》
2023
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