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患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析
被引量:
1
1
作者
闫亚楠
陈美玲
+6 位作者
吴锐琼
吴水清
罗辉玉
陈欣欣
何丽斌
郑乐云
黄镇
《福建农业科技》
2020年第12期1-8,共8页
肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA...
肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,探究患肠炎病海马的肠道细菌结构特征。结果表明,健康和肠炎病海马之间的肠道菌群多样性和结构均存在显著差异。从属水平上来看,患病海马的肠道优势菌种为弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium,健康海马的肠道优势菌种为玫瑰菌属Roseibium、拟杆菌目未分类Bacteroidales_unclassified、弧菌属Vibrio、嗜冷菌属Psychrobacter,健康海马和患病海马中的共有属包括弧菌属Vibrio、别弧菌属Aliivibrio、拟杆菌目未分类Bacteroidetes_unclassified、发光杆菌属Photobacterium。与健康海马肠道菌群相比,患病海马肠道中的弧菌属Vibrio、别弧属菌属Aliivibrio的含量明显高于健康海马。此外,肠炎病海马肠道中分枝杆菌属Mycobacterium、β变形菌纲未分类Bacteroidales_unclassified、黄杆菌属Tenacibaculum和希万氏菌属Shewanella为特有的细菌种属。研究结果解析肠炎病海马肠道可能的致病菌,对于海马养殖过程中的病害防治有重要的指导意义。
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关键词
海马
肠炎病
肠道
高通量测序
宏基因组学
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题名
患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析
被引量:
1
1
作者
闫亚楠
陈美玲
吴锐琼
吴水清
罗辉玉
陈欣欣
何丽斌
郑乐云
黄镇
机构
福建省特色海洋生物资源可持续利用重点实验室/福建师范大学生命科学学院
福建省
水产研究所
厦门小嶝水产科技有限公司
出处
《福建农业科技》
2020年第12期1-8,共8页
基金
厦门市海洋与渔业发展专项资金项目(18CZY008HJ03)
福建省海洋与渔业结构调整专项(2019年)。
文摘
肠炎病是海马人工养殖过程中常见病害,主要是细菌感染而引起的,其传染性强、危害性高。因此,解析患肠炎病海马肠道中的细菌菌群组成对于海马肠炎病的诊断以及防治有着重要意义。采集健康和患肠炎病的膨腹海马肠道组织,采用细菌16Sr DNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,探究患肠炎病海马的肠道细菌结构特征。结果表明,健康和肠炎病海马之间的肠道菌群多样性和结构均存在显著差异。从属水平上来看,患病海马的肠道优势菌种为弧菌属Vibrio、漫游球菌属Vagococcus、分枝杆菌属Mycobacterium,健康海马的肠道优势菌种为玫瑰菌属Roseibium、拟杆菌目未分类Bacteroidales_unclassified、弧菌属Vibrio、嗜冷菌属Psychrobacter,健康海马和患病海马中的共有属包括弧菌属Vibrio、别弧菌属Aliivibrio、拟杆菌目未分类Bacteroidetes_unclassified、发光杆菌属Photobacterium。与健康海马肠道菌群相比,患病海马肠道中的弧菌属Vibrio、别弧属菌属Aliivibrio的含量明显高于健康海马。此外,肠炎病海马肠道中分枝杆菌属Mycobacterium、β变形菌纲未分类Bacteroidales_unclassified、黄杆菌属Tenacibaculum和希万氏菌属Shewanella为特有的细菌种属。研究结果解析肠炎病海马肠道可能的致病菌,对于海马养殖过程中的病害防治有重要的指导意义。
关键词
海马
肠炎病
肠道
高通量测序
宏基因组学
Keywords
Hippocampus
Gastroenteritis
Intestinal
High-throughput sequencing
Metagenomics
分类号
S947.9 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
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1
患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析
闫亚楠
陈美玲
吴锐琼
吴水清
罗辉玉
陈欣欣
何丽斌
郑乐云
黄镇
《福建农业科技》
2020
1
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