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槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪转录组分析
1
作者
叶鼎承
杨建敏
+1 位作者
甘乾福
刘景
《安徽农业科学》
CAS
2020年第24期99-101,共3页
[目的]了解槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织脂肪沉积的分子机制差异。[方法]对槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织进行转录组测序,并进行生物信息学分析。[结果]槐猪和杜洛克猪分别获得37858968和37545394条干净读段(clean reads)。槐猪和...
[目的]了解槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织脂肪沉积的分子机制差异。[方法]对槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织进行转录组测序,并进行生物信息学分析。[结果]槐猪和杜洛克猪分别获得37858968和37545394条干净读段(clean reads)。槐猪和杜洛克猪分别预测到9612和9457可变剪接事件;两猪种间共有709个差异表达基因,与杜洛克猪相比,槐猪有395个上调基因和314个下调基因。差异表达基因共归类到46个GO条目中,其中细胞组分11个、分子功能12个及生物学过程23个;显著富集的KEGG通路共计9个,其中含有与调节脂类代谢显著相关通路,如胰岛素信号通路和PPAR信号通路等。[结论]该研究可为今后研究脂肪沉积的遗传机理提供科学依据。
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关键词
槐猪
杜洛克猪
背部皮下脂肪组织
差异表达
转录组测序
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题名
槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪转录组分析
1
作者
叶鼎承
杨建敏
甘乾福
刘景
机构
福建省
农业科学院
畜牧
兽医
研究所
福建省福州市长乐区猴屿乡畜牧兽医站
福建
农林大学动物科学学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2020年第24期99-101,共3页
基金
福建省自然科学基金项目:(2012J01111)
福建省公益类科研院所专项(2014R1023-12)。
文摘
[目的]了解槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织脂肪沉积的分子机制差异。[方法]对槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织进行转录组测序,并进行生物信息学分析。[结果]槐猪和杜洛克猪分别获得37858968和37545394条干净读段(clean reads)。槐猪和杜洛克猪分别预测到9612和9457可变剪接事件;两猪种间共有709个差异表达基因,与杜洛克猪相比,槐猪有395个上调基因和314个下调基因。差异表达基因共归类到46个GO条目中,其中细胞组分11个、分子功能12个及生物学过程23个;显著富集的KEGG通路共计9个,其中含有与调节脂类代谢显著相关通路,如胰岛素信号通路和PPAR信号通路等。[结论]该研究可为今后研究脂肪沉积的遗传机理提供科学依据。
关键词
槐猪
杜洛克猪
背部皮下脂肪组织
差异表达
转录组测序
Keywords
Huai Pig
Duroc Pig
Back subcutaneous adipose tissue
Differential expression
Transcriptome sequencing
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
S813 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪转录组分析
叶鼎承
杨建敏
甘乾福
刘景
《安徽农业科学》
CAS
2020
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