德尔菲法构建模块化教学对医学本科生临床免疫学教学效果的影响

目的探讨德尔菲法构建的模块化教学模式对医学本科生临床免疫学理论考试和综合素质的影响。方法选取2017年9月至2018年6月空军军医大学(原第四军医大学)2017级五年制临床医学Ⅰ班学生130名,采用随机数字表法分为教改班(64名)和对照班(66名),教改班采用基于德尔菲法构建的模块化教学法,对照班采用传统教学法,对两班学生的理论考试成绩和综合素质(包括智育素质、思想品德、人文素质、身心素质和社会实践5部分)进行分析。结果教改班在理论考试成绩和综合素质得分上均高于对照班[(97.28±2.49)分比(89.54±5.56)分,(88.16±5.53)分比(83.12±4.58)分],差异有统计学意义(P<0.001)。结论基于德尔菲法构建的模块化教学法应用于临床免疫学教学中,可显著提高学生的综合素质,值得推广应用。

微信辅助PBL联合LBL教学法在八年制医学生《临床免疫学》教学中的应用评价

《临床免疫学》是《医学免疫学》的重要组成部分,是基础免疫学与临床医学的桥梁学科。2004年后空军军医大学开展了临床医学八年制医学生的培养工作,既往五年制和七年制医学生的传统课堂讲授方式(lecture based learning, LBL)已不再适合培养八年制医学生。为提高八年制医学生《临床免疫学》教学质量,教学方式进行了改进,LBL逐渐改进为LBL联合探讨问题式教学模式(problem-based learning,PBL)。但免疫学知识进展快、信息量大,传统教材更新慢,这一教学模式仍无法满足八年制医学生的培养要求。

不同HBsAg水平的慢性乙型肝炎患者血清HIF-1α、ApoE和TGF-β1水平变化及其临床意义探讨

目的探讨不同血清HBsAg水平的慢性乙型肝炎(CHB)患者血清缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)、载脂蛋白E(ApoE)和转化生长因子-β1(TGF-β1)水平变化及其临床意义.方法2019年10月~2021年10月我院诊治的CHB患者196例,定量检测血清HBsAg水平.采用ELISA法检测血清HIF-1α、ApoE和TGF-β1水平.结果在196例CHB患者中,血清HBsAg<6000 IU/mL(A组)100例,6000 IU/mL<血清HBsAg<8000 IU/mL B组54例,和血清HBsAg>8000 IU/mL(C组)42例;三组性别分布、年龄、体质指数和病程无显著性差异(P>0.05);C组血清谷氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶、总胆红素和HBV DNA水平分别为(112.3±6.2)U/L、(125.1±6.8)U/L、(49.3±10.1)μmol/L和(6.4±0.2)lg copies/ml,显著高于B组[分别为(76.2±7.1)U/L、(93.5±4.4)U/L、(41.4±7.8)μmol/L和(6.4±0.3)lg copies/ml,P<0.05]或A组[分别为(55.5±5.3)U/L、(67.2±3.4)U/L、(23.5±4.5)μmol/L和(6.4±0.1)lg copies/ml,P<0.05];C组血清ApoE、HIF-1α和TGF-β1水平分别为(0.8±0.1)g/L、(4.5±0.2)pg/ml和(286.1±16.0)mg/L,均显著高于B组[分别为(0.6±0.1)g/L、(3.1±0.3)pg/ml和(256.6±19.5)mg/L,P<0.05]或A组[分别为(0.4±0.1)g/L、(1.5±0.2)pg/ml和(231.1±21.6)mg/L,P<0.05].结论血清HBsAg高水平的CHB患者血清HIF-1α、ApoE和TGF-β1水平也升高,并可能与病情严重程度相关,值得进一步研究.

儿童系统性红斑狼疮合并噬血细胞综合征1例

噬血细胞综合征(hemophagocytic syndrome,HPS)又称为噬血细胞性淋巴组织细胞增多症(hemophagocytic lymphohistiocytosis,HLH),是一类由原发或继发性免疫异常导致的过度炎症反应综合征,临床以持续发热、肝脾肿大、全血细胞减少以及骨髓、肝、脾、淋巴结组织发现噬血现象为主要特征[1]。其中继发于风湿性疾病的HLH亦称为巨噬细胞活化综合征(macrophage activation syndrome,MAS),是一种严重且具有潜在威胁生命的疾病。

痛风性关节炎患者血清白细胞介素-1β、肿瘤坏死因子-α和环氧化酶-2水平变化及临床意义

目的观察不同严重程度痛风性关节炎患者血清白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及环氧化酶-2(COX-2)水平的变化及临床意义。方法选择2015年6月至2018年6月中国人民解放军空军军医大学第一附属医院收治的150例痛风性关节炎患者为研究对象,其中急性发作期患者100例,缓解期患者50例(Ⅰ组);100例急性发作期患者根据主诉疼痛程度评分法分为Ⅱ组(轻度患者50例)和Ⅲ组(中、重度患者50例);另选择同期体检健康者150例作为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测4组受试者血清IL-1β、TNF-α和COX-2水平。结果Ⅰ组与对照组受试者血清IL-1β、TNF-α及COX-2水平比较差异均无统计学意义(P>0.05)。急性期第1、3、7天,Ⅱ组患者血清IL-1β水平显著高于Ⅰ组(P<0.05);急性期第10、14天,Ⅱ组与Ⅰ组患者血清IL-1β水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。急性期第1、3天,Ⅱ组患者血清TNF-α、COX-2水平显著高于Ⅰ组(P<0.05);急性期第7、10、14天,Ⅱ组与Ⅰ组患者血清TNF-α、COX-2水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。急性期第1、3、7、10天,Ⅲ组患者血清IL-1β、TNF-α水平显著高于Ⅱ组(P<0.05);急性期第14天,Ⅲ组与Ⅱ组患者血清IL-1β、TNF-α水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。急性期第1、3、7天,Ⅲ组患者血清COX-2水平显著高于Ⅱ组(P<0.05);急性期第10、14天,Ⅲ组与Ⅱ组患者血清COX-2水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论痛风性关节炎患者血清炎性因子水平升高,炎性因子可能参与了痛风性关节炎的发病机制,炎性因子水平检测有助于痛风性关节炎的早期诊断、病情及预后评估。

系统性红斑狼疮患者血清IgG水平正常及升高与相关免疫学实验室指标的相关分析

目的探讨系统性红斑狼疮患者(systemic lupus erythematosus,SLE)中免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)正常与IgG升高的患者,其抗核抗体(antinuclear antibody,ANA)滴度、抗双链DNA(double-strand DNA,ds-DNA)抗体及抗可溶性抗原抗体谱(extractable nuclear antigen,ENA),以便深入对SLE的认识。方法选择2019年6~12月在空军军医大学第一附属医院就诊的初诊SLE患者150例,其中狼疮性肾炎患者62例,采用速率散射比浊法分别检测SLE患者血清中免疫球蛋白IgA,IgG,IgM及补体C3,C4的水平。采用间接免疫荧光法和欧蒙印迹法检测抗核抗体ANA,抗ds-DNA抗体及ENA。比较IgG正常组与IgG升高组患者间实验室指标的差异。结果IgG正常组SLE患者血清中免疫球蛋白IgA,IgM水平低于IgG升高组,补体C3,C4水平高于IgG升高组,其中IgA差异具有统计学意义(z=-3.64,P<0.05)。IgG正常组SLE患者抗ds-DNA抗体、抗舍格伦综合征A(SSA)抗体、抗Ro-52抗体、抗核小体抗体(AnuA)阳性率均低于IgG升高组(χ^2=4.985,7.479,8.974和5.637,均P<0.05);而抗核糖核蛋白/史密斯(nRNP/Sm)抗体、抗Sm抗体、抗舍格伦综合征B(SSB)抗体、抗组蛋白抗体(AHA)、抗核糖体P蛋白抗体(ARPA)在两组之间差异无统计学意义(χ^2=0.005~2.050,均P>0.05)。两组患者的狼疮性肾炎患病率相似,差异无统计学意义(χ^2=1.129,P>0.05)。结论IgG正常SLE患者与IgG升高患者相比,其自身抗体阳性率降低,而狼疮肾炎发病率与IgG升高组无差异,提示临床IgG正常和IgG升高的SLE患者实验室指标之间存在差异,以便加深对SLE的认识。

SAPHO综合征患者临床特征分析

背景 SAPHO综合征作为临床少见病之一,近年来对其认知不断深入,但多样化的临床表现及规范的诊疗措施仍需不断总结、摸索及进一步研究.目的 分析总结SAPHO综合征的临床特征、诊断与治疗.方法 回顾性选择2012年2月-2018年5月空军军医大学(原第四军医大学)西京医院收治的12例SAPHO综合征患者,分析其发病特点、临床表现、影像学表现、血清学检查、皮肤组织活检、治疗及随访.结果 12例患者中男8例、女4例;发病年龄为17~53岁,平均(37.8±11.8)岁;病程为2个月 ~25年.12例患者均有皮肤及骨与关节病变,其中掌跖脓疱疹、胸锁关节肿痛、肩锁关节疼痛为主要临床表现,全身骨扫描为重要检查手段,典型"牛头征"有重要诊断价值.血清学检查无特异性,急性期患者可有红细胞沉降率、C反应蛋白升高,皮肤组织活检可见典型"脓疱疹"改变.目前治疗仍以经验性治疗为主,免疫抑制剂联合非甾体抗炎药治疗效果良好,多数患者在规律药物治疗基础上病情控制较平稳.结论 SAPHO综合征男女均可发病,早期症状不典型,首发症状多为皮肤或关节病变,全身骨扫描"牛头征"为该病特征性表现,而皮肤组织活检可见炎症性改变,对于疾病诊断及鉴别具有重要价值.该病在早诊断、早治疗的情况下多数预后良好.

195例干燥综合征患者临床特点及唇腺病理特征分析

背景干燥综合征(Sjogren’s syndrome,SS)以淋巴细胞增殖和进行性外分泌腺体损伤为特征,可伴有多系统损伤,现阶段缺乏针对门诊SS患者临床表现、自身抗体和唇腺病理特点相结合的研究。目的分析干燥综合征患者的临床表现、自身抗体及唇腺病理特点,为了解门诊SS患者的疾病特点提供临床资料。方法收集2020年6月-2021年4月在空军军医大学第一附属医院门诊行唇腺活检的195例原发性干燥综合征(primary Sjogren’s syndrome,pSS)和继发性干燥综合征(secondary Sjogren’s syndrome,sSS)患者的临床及唇腺病理资料并进行分析。结果195例中女183例,男12例,年龄20~85(49.7±14.0)岁。1)166例pSS患者,血常规示白细胞减低和(或)血小板减低占30.3%,肺、皮肤、神经系统和肾受累分别占23%、16.3%、7.8%和6.6%。抗核抗体、抗SSA抗体、抗Ro-52抗体、抗SSB抗体阳性分别为98.2%、83.1%、83.1%和34.9%,所有抗SSB抗体阳性的患者抗SSA抗体均阳性。抗AMA-M2、抗nRNP/Sm、抗CENP-B和抗甲状腺相关抗体阳性分别为11.4%、10.2%、8.4%和39.5%。唇腺病理,灶性指数(focus score,FS)≥1占44%,正常占13.9%,SSⅠ度/Ⅰ~Ⅱ度占29.5%,12.7%为慢性涎腺炎。2)sSS患者29例,合并类风湿关节炎22例(75.9%),合并系统性红斑狼疮、系统性硬化症、混合性结缔组织病和大动脉炎分别为2例、2例、2例和1例。抗SSA抗体阳性占58.6%。3)pSS与sSS比较,口干、眼干、猖獗齿、腮腺肿大、Schirmer试验和未刺激唾液流率阳性无统计学差异(P均>0.05)。pSS患者抗SSA抗体阳性率高于sSS患者(83.1%vs 58.6%,P=0.002),唇腺病理,pSS患者FS≥1较sSS患者增多(44.0%vs 24.1%,P=0.045),而SSⅠ度/Ⅰ~Ⅱ度较sSS减少(29.5%vs 51.7%,P=0.019),正常与慢性涎腺炎在两组间的差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论抗SSA抗体阳性和FS≥1在pSS组中占比较高,抗SSB抗体阳性一般伴有抗SSA抗体阳性。在SS患者中抗AMA-M2、抗nRNP/Sm和抗CENP-B抗体阳性常见。

血清补体C3,C4水平正常的活动性狼疮性肾炎患者的临床特征与实验室相关指标分析

目的 探讨血清补体(complement) C3和C4水平正常的活动性狼疮性肾炎(lupus nephritis,LN)患者的临床及实验室特征。方法 纳入2011年1月~2019年11月在空军军医大学第一附属医院住院的活动性LN患者210例,根据血清补体C3和C4水平分为血清补体正常组(n=30)和补体降低组(n=180),比较两组患者临床与实验室相关指标的差异。结果 血清补体C3和C4水平正常组患者的SLE疾病活动度评分(systemic lupus erythematosus disease activity index,SLEDAI)低于补体降低组(8.70±4.79 vs 13.29±4.77),差异有统计学意义(t=-4.877,P<0.001)。血清补体C3和C4水平正常组患者的血清清蛋白(32.54±7.68 g/L)、血清总蛋白(60.98±13.14g/L)、血红蛋白(111.43±24.59g/L)和红细胞计数[(3.85±0.74)×10^(12)/L]水平高于降低组[29.65±6.29 g/L,55.60±11.11g/L,95.96±19.65 g/L,(3.31±0.69)×10^(12)/L],而血尿酸低于降低组(367.49±158.91μmol/L vs 276.13±82.57μmol/L),差异均有统计学意义(t=2.257,2.394,3.844,3.875,-4.765,均P<0.05)。血清补体C3和C4正常组患者的抗核小体抗体(16.7%)、抗C1q抗体(20.0%)和抗双链DNA(dsDNA)抗体(16.7%)的阳性率低于降低组(57.2%,41.7%,55.0%),差异均有统计学意义(χ^(2)=14.272,6.815,15.116,均P<0.05)。肾脏病理结果提示血清C3和C4正常组单纯V型的LN比例(11/23,47.8%)高于降低组(13/90,14.4%),两组间病理分型分布差异有统计学意义(χ^(2)=14.774,P=0.002)。结论活动性LN中血清补体C3和C4水平正常的患者疾病活动度更低,贫血发生率更低,狼疮特异性自身抗体阳性率更低,V型LN的比例更高,可能属于一类特殊亚型。

蛋白A免疫吸附和DNA230免疫吸附治疗狼疮肾炎疗效比较

目的观察蛋白A免疫吸附、DNA230免疫吸附治疗狼疮肾炎的疗效及对免疫功能的影响。方法选取2017年1月-2018年6月空军军医大学第一附属医院临床免疫科收治的狼疮肾炎患者60例,采用随机数字表法分为2组各30例。观察组接受蛋白A免疫吸附治疗,对照组给予DNA230免疫吸附治疗。治疗8周后比较2组治疗总有效率,治疗前后肾功能、尿蛋白定量及血清免疫球蛋白IgA IgM、IgG水平、狼疮活动积分(SLEDAI),并观察不良反应。结果观察组治疗总有效率为96.7%,明显高于对照组的86.7%(χ^2=3.893,P=0.045)。治疗后观察组IgM、IgA、IgG均低于对照组(t/P=6.923/0.000、9.259/0.000、9.025/<0.001),而SLEDAI评分差异无统计学意义(t=0.262,P=0.794)。2组患者血肌酐、尿素氮以及尿蛋白定量下降显著,但2组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论蛋白A免疫吸附对狼疮肾炎疗效较传统DNA免疫吸附好,可明显改善患者免疫功能,具备临床推广使用价值。

系统性红斑狼疮患者血尿酸水平变化临床研究

目的:探究系统性红斑狼疮与血尿酸水平的关系。方法:回顾性分析110例系统性红斑狼疮患者病历资料,根据是否存在肾损害分为狼疮肾组(65例)和单纯狼疮组(45例),另外再选取30例健康人为对照组。检测空腹血尿酸水平、补体C3和免疫球蛋白(IgG、IgM、IgA)水平的变化,对两组患者的检测结果进行统计学分析。结果:系统性红斑狼疮组患者血尿酸水平明显高于非狼疮肾组,比较差异显具有统计学意义(P<0.05),狼疮肾组患者的血尿酸水平明显高于单纯狼疮组,与对照组的正常水平相比差异明显,具有统计学意义(P<0.05),狼疮肾组的C反应蛋白明显高于非狼疮肾组,狼疮肾组的补体C3以及免疫球蛋白IgG、IgA、IgM等指标均明显低于非狼疮肾组,其中系统性红斑狼疮患者在狼疮肾组的血清免疫蛋白水平均明显高于健康体验者的对照组,两组比较差异明显,具有统计学意义(P<0.05)。结论:血尿酸升高会导致系统性红斑狼疮的肾损害,血尿酸水平的高低是狼疮患者肾损害的关键因素。

复发性多软骨炎气道受累的临床特点及误诊概况

目的探讨复发性多软骨炎(RP)气道受累的临床特点及误诊概况,以提高早期诊断的准确率。方法回顾性分析2010年1月至2017年1月空军军医大学第一附属医院出院时诊断为RP的80例患者的病历资料,依据入院时诊断是否为RP,分为初诊诊断组(48例)和初诊误诊组(32例)。结果 RP患者气道临床症状居前3位者为呼吸困难或憋喘(62例,77. 5%)、声音嘶哑(48例,60. 0%)、咳嗽痰多(45例,56. 2%)。初诊误诊组耳廓软骨炎比例明显低于初诊诊断组[22. 5%(9/32)比52. 5%(21/48)],差异有统计学意义(P=0. 012)。初诊诊断组喉部、气管及主支气管同时受累比例高于初诊误诊组[41. 7%(20/48)比15. 6%(5/32)],差异有统计学意义(P=0. 002)。RP患者易被误诊为哮喘(10例)、咽喉炎及支气管炎(11例)等。初诊误诊组气管切开比例较高[81. 2%(26/32)]。结论广泛的气道累及以及耳廓软骨炎在RP的确诊中有一定价值,利于早期诊断。

系统性红斑狼疮复发的影响因素研究进展

系统性红斑狼疮(SLE)是一种累及多个组织器官的慢性自身免疫性疾病,反复发作是SLE诊治中面临的主要问题之一,疾病复发通常没有明确的原因。我们总结了SLE患者的生存现状和复发情况,并着重从遗传因素、环境因素(感染、紫外线、维生素D、化工污染物)、药物及患者依从性、系统损害及疾病状态、性激素与妊娠、社会心理方面归纳复发机制及研究进展,以期实现临床尽早预防,达到疾病长期、有效缓解,改善患者的生存质量。

血清外泌体源性microRNA对类风湿性关节炎的诊断意义

目的探讨血清外泌体源性microRNA(exomiR)-24-3p、exomiR-125a-5p和exomiR-144-3p诊断类风湿性关节炎(RA)的价值。方法提取124例RA患者(RA组)和100例健康体检者(对照组)的血清外泌体。实时荧光定量PCR法检测2组患者血清中exomiR-24-3p、exomiR-125a-5p和exomiR-144-3p表达水平。用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清外泌体exomiR诊断RA的价值;Pearson法分析exomiR与28个关节疾病活动度评分(DAS28)、红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)的相关性;比较不同活动度RA患者血清exomiR表达水平。结果与对照组比较,RA组患者血清exomiR-24-3p和exomiR-144-3p表达水平较高,而exomiR-125a-5p表达水平较低(P<0.05)。ROC曲线结果显示,血清exomiR-24-3p、exomiR-125a-5p和exomiR-144-3p诊断RA的曲线下面积(AUC)分别为0.703、0.824、0.736,灵敏度分别为94.89%、96.23%、93.01%,特异度分别为75.01%、85.88%、82.14%;三者联合检测的AUC为0.889,灵敏度为97.23%,特异度为90.12%。血清exomiR-24-3p、exomiR-144-3p与DAS28、ESR、CRP均呈正相关(P<0.05);exomiR-125a-5p与DAS28、ESR、CRP均呈负相关(P<0.05)。单因素分析结果显示,不同疾病活动度RA患者的exomiR-24-3p、exomiR-125a-5p、exomiR-144-3p表达水平比较,差异具有统计学意义(P<0.05),疾病活动度越高,exomiR-24-3p和exomiR-144-3p表达水平越高,而exomiR-125a-5p表达水平越低。结论血清exomiR-24-3p、exomiR-125a-5p和exomiR-144-3p对RA的诊断有较高价值,可以评估疾病活动度。

干燥综合征患者唾液流率与口干症状的一致性分析

目的:分析干燥综合征(Sjögren's syndrome,SS)患者口干症状与静息唾液流率下降的一致性,并探讨影响静息唾液流率的相关因素。方法:采集151例确诊SS患者的临床资料,包括口干症状、静息唾液流率、血液学指标及临床病史等,应用Kappa一致性检验和Spearman相关性检验进行统计学分析。结果:干燥综合征患者中唾液流率下降与口干症有极低的一致性,进一步分析发现,静息唾液流率下降与SS病程、ANA抗体滴度、IgM水平及自身免疫性肝病呈正相关关系。结论:SS患者唾液流率下降与口干症状缺乏一致表现,静息唾液流率虽然对SS有一定的预测及监控价值,但受到多种因素影响可能出现波动,了解其影响因素并实施定向干预,有助于SS患者的口腔健康管理。

强直性脊柱炎患者血清IL-27、sTRAIL水平与BAsDAI的相关性分析

目的 探讨强直性脊柱炎(AS)患者血清白细胞介素-27(IL-27)、可溶性肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(sTRAIL)水平与AS疾病活动指数(BAsDAI)的相关性。方法 选取2020年6月—2022年9月收治的92例AS作为观察组,另选取同期进行体检的45例健康者作为对照组。对比观察组与对照组血清IL-27及sTRAIL水平,采用多因素Logistic回归分析探讨影响AS患者疾病活动度的危险因素,采用Pearson线性相关分析血清IL-27及sTRAIL水平与BAsDAI的相关性。结果 观察组血清IL-27及sTRAIL水平高于对照组(P<0.01)。血清IL-27及sTRAIL水平是影响AS患者疾病活动度的危险因素(P<0.05)。AS患者血清IL-27及sTRAIL水平与BAsDAI呈明显正相关(r=0.615、0.623,P<0.001)。结论 血清IL-27及sTRAIL水平是影响AS患者疾病活动度的危险因素,且与BAsDAI呈正相关,检测血清IL-27及sTRAIL对于评价BAsDAI具有一定的临床价值。

IL-33的免疫调控作用

IL-33是IL-1细胞因子超家族的成员,是机体病理性炎症、免疫稳态和纤维化过程中的关键调节剂。IL-33受体ST2在固有免疫细胞表面均有表达,在B细胞和T细胞的部分亚型表面也有所表达。IL-33是一种双重功能蛋白。正常情况下,IL-33的N端部分驻留在其表达细胞的细胞核中,当细胞发生损伤或坏死时作为细胞因子释放到细胞外发挥免疫调节特性。IL-33不同表达形式的细胞定位不同,可能发挥的免疫学作用也不相同。IL-33的免疫学作用具有很强的多样性,细胞因子IL-33在固有免疫应答中起放大增强的作用,而细胞核内储存的全长型(FL)IL-33通过结合抑制NF-κB发挥抑制炎症的作用。IL-33/ST2轴在先天性和获得性免疫反应中都起着关键作用。在先天免疫中,IL-33和第2组先天淋巴细胞(ILC2)为快速免疫应答和组织稳态提供了一个重要的轴。在获得性免疫中,IL-33与树突状细胞、Th2细胞、滤泡辅助性T细胞(Tfh)和调节性T细胞(Tregs)相互作用。IL-33/ST2信号传导以自分泌和旁分泌方式触发不同细胞类型的促肿瘤免疫反应或抗肿瘤免疫反应。此外IL-33和细胞代谢之间的相互作用也是影响免疫系统的潜在机制之一。

小儿扩张型心肌病血清蛋白及microRNA表达谱的生物信息学分析和发病机制

目的:对小儿扩张型心肌病(pediatric dilated cardiomyopathy,PDCM)血清蛋白及microRNA(miRNA)表达谱进行生物信息学分析,探讨其发病机制。方法:对PDCM血清蛋白芯片数据进行差异分析及基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。对PDCMmiRNA表达谱挑选部分差异表达miRNA,预测靶基因,与差异血清蛋白/基因取交集,获取共享基因,构建miRNA-mRNA关系对,并行GO和KEGG通路富集分析。结果:PDCM差异血清蛋白富集到细胞黏附调节、免疫调控、含胶原的细胞外基质等GO子集中。差异蛋白主要参与趋化因子信号通路、肾素分泌、肾素-血管紧张素系统、细胞因子-细胞因子受体相互作用、扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)、醛固酮的合成和分泌、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用等10条信号通路中。4个下调miRNA行靶基因预测后与差异血清蛋白/基因取交集,共8个共享基因,即HSPD1、LIFR、RPS7、ANXA2、PDPK1、EIF4G2、AGT和PRKCA。共享基因显著富集到心肌肥厚正调控等GO子集中;及醛固酮的合成和分泌及调节钠重吸收、心肌细胞中的肾上腺素能信号和蛋白激酶B-哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(Akt-mammalian targetofrapamycin,Akt-mTOR)通路等13条通路中。结论:通过分析PDCM血清蛋白及miRNA表达谱,有助于进一步了解该病发病机制,为临床诊疗提供思路。

心肌肥厚模型:内皮素1刺激人诱导的多能干细胞源性心肌细胞lncRNA表达谱及ceRNA网络的生物信息学分析

目的:对心肌肥厚模型——内皮素1(endothelin 1,ET1)刺激人诱导的多能干细胞源性心肌细胞(human induced pluripotent stem cell derived cardiomyocytes,hiPSC-CMs)的基因芯片数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱及竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络。方法:在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中筛选心肌肥厚相关基因芯片,对下载的原始探针矩阵信息和平台注释文件进行预处理,获取基因表达矩阵信息,利用实用报表提取语言(practical extraction and report language,Perl)赋予基因不同的生物型属性,从而区分出lncRNA与mRNA。利用R语言limma包分别分析lncRNAs和mRNAs的基因表达差异。使用在线下载的数据库预测与每个lncRNA关联的microRNA(miRNA)。在此基础上,利用基于TargetScan,miRDB和miRTarBase的预测软件对miRNA的靶基因(mRNA)进行预测。以Cytoscape3.7.1软件构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络。针对ceRNA调控网络中的靶基因,运用在线数据库DAVID6.8进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析,并通过在线工具KOBAS3.0进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:与对照组相比,ET1刺激的hiPSC-CMs中19个lncRNA和717个mRNA表达差异具有统计学意义。其中,lncRNA表达上调的有4个,下调的有15个;mRNA表达上调的有312个,下调的有405个。成功构建了ceRNA调控网络,该网络中,显著上调的lncRNA包括AC017002和MIR210HG,分别与9,10个miRNA关联密切,显著下调的有LINC00342,其与9个miRNA关联密切。该网络中靶基因共32个,其中18个上调,14个下调。对靶基因进行GO富集分析,发现被显著富集到细胞增殖、质膜和蛋白结合等13个不同的GO子集中。KEGG富集分析发现:靶基因被富集到MAPK信号通路、细胞凋亡、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路、TNF信号通路等20个信号通路上。结论:本研究构建了ceRNA网络,为探讨lncRNA参与心肌肥厚致病机制提供了一个新的视角。LncRNA可能通过ceRNA调控网络,影响心肌肥厚发生发展。在ceRNA网络中有3个lncRNA(表达上调的为AC017002、MIR210HG,表达下调的为LINC00342)可能以竞争性“海绵吸附”miRNA的方式调控下游mRNA的表达水平,使AP1,c-MYC,PIM1表达上调,ASK1(即MAP3K5),MSK1/2(即RPS6KA5)及SFRP1表达下调,并通过在MAPK信号通路、细胞凋亡、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路、TNF信号通路等途经参与心肌肥厚的病理生理过程。这些基因有可能成为潜在的治疗靶点,研发阻断上述lncRNA或下游靶基因的相关药物可能对治疗心肌肥厚有着深远的临床意义。

基于基因表达综合数据库芯片的类风湿关节炎生物标志物的筛选与生物信息学分析

目的对类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找表达特征基因谱。方法利用GEO2R对基因表达综合数据库中筛选出的RA芯片进行基因差异表达分析,采用DAVID 6.8及R语言进行基因功能注释GO富集分析和KEGG通路富集分析,String-db数据库进行蛋白互作分析,并以Cytoscape3.7.1软件获取关键靶基因。结果RA患者膝关节分离出的滑膜组织中1184个基因差异表达具有统计学意义,其中664个表达上调,520个表达下调。差异表达基因被富集到信号转导、质膜和蛋白结合等70个不同的GO子集及细胞因子-细胞因子受体相互作用、破骨细胞分化、类风湿关节炎、Th17细胞分化和IL17信号通路等62个信号通路上。蛋白互作网络分析筛选出19个关键靶基因,包括NKG7、BCL6、SEMA4D、NFIL3、RAC2、MLIP、SEL1L3、GUSBP11、IGLV1-44、IGLJ3、IGLC1、IGKV1OR2-118、IGKV1OR2-108、IGKC、IGHV4-31、IGHV3-23、IGHM、IGHD和CYAT1。结论对基因表达综合数据库中RA的芯片数据分析所筛选出的部分差异表达基因,均涉及影响RA滑膜炎症发生发展的关键环节,可为该疾病的早期诊断或靶向药物的研发提供重要的实验理论依据。