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机器学习算法确定的核心衰老基因在非远处转移性结直肠癌的预后和免疫微环境相关性分析
1
作者
李世森
余鹏飞
+3 位作者
乔一桓
王珂
李丹
李云龙
《空军军医大学学报》
CAS
2024年第7期781-787,共7页
目的建立非远处转移性结直肠癌(CRC)衰老基因模型和确定核心的衰老基因,分析其与肿瘤微环境的作用。方法下载TCGA和GEO数据库的非远处转移性CRC数据库,单因素Cox分析确定预后相关的衰老基因,多因素Cox分析建立非远处转移CRC的衰老模型。...
目的建立非远处转移性结直肠癌(CRC)衰老基因模型和确定核心的衰老基因,分析其与肿瘤微环境的作用。方法下载TCGA和GEO数据库的非远处转移性CRC数据库,单因素Cox分析确定预后相关的衰老基因,多因素Cox分析建立非远处转移CRC的衰老模型。ESTIMATE算法计算出样本的免疫微环境评分(间质评分与免疫评分),并且研究衰老模型与其关系。采用随机生存森林算法用于计算出衰老基因的重要性,确定衰老核心基因。使用CIBERSORT算法评估肿瘤免疫细胞浸润情况,相关性分析研究衰老核心基因与细胞浸润的关系。结果多因素Cox回归分析建立由6个衰老基因组成的模型,在TCGA和GEO中都表明高风险人群的预后远远差于低风险组(P<0.001)。该衰老模型与CRC微卫星状态、肿瘤免疫评分和间质评分相关。随机生存森林算法确定3个核心的衰老基因(TERT、SNAI1和CSNK1A1),且与肿瘤免疫细胞浸润相关。此外,在免疫治疗人群中,SNAI1(P=0.016)和CSNK1A1(P<0.001)低表达组生存时间更长。结论肿瘤细胞衰老的程度越大,代表其增殖能力越弱,非远处转移性CRC患者的预后可能越佳。TERT、SNAI1和CSNK1A1作为衰老的核心基因,与肿瘤微环境相关,可能作为免疫治疗的生物学标志物。
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关键词
衰老基因
非远处转移结直肠癌
肿瘤免疫微环境
免疫细胞
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职称材料
结直肠癌根治术后切口感染病原菌及影响因素
被引量:
15
2
作者
王珂
李世森
+2 位作者
闫沛
刘小娟
戴艳然
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期2995-2999,共5页
目的探究血清白细胞计数(WBC)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)及C-反应蛋白(CRP)水平,对腹腔镜下结直肠癌根治术后切口感染的预测价值。方法回顾性分析2019年1月—2019年6月于空军军医大学第一附属医院行腹腔镜根治术的结直肠癌患者20...
目的探究血清白细胞计数(WBC)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)及C-反应蛋白(CRP)水平,对腹腔镜下结直肠癌根治术后切口感染的预测价值。方法回顾性分析2019年1月—2019年6月于空军军医大学第一附属医院行腹腔镜根治术的结直肠癌患者200例的临床资料,通过分析其临床资料和随访结果,归纳患者术后切口感染的影响因素,并应用受试者工作特征曲线(ROC),评估WBC、NLR和CRP水平对患者术后并发切口感染的预测能力。结果200例患者术后有34例出现切口感染,感染率为17.00%;其中革兰阴性菌32株(78.05%),以大肠埃希菌为主(60.98%);革兰阳性菌9株(21.95%),以金黄色葡萄球菌为主(17.07%);营养不良、糖尿病及NLR水平均是患者术后切口感染的影响因素(P<0.05);WBC、NLR和CRP联合检测对结直肠癌患者术后切口感染发生的预测价值最高(P<0.05),曲线下面积(AUC)为0.951(95%CI:0.912~0.977),敏感度为91.20%,特异度为92.20%。结论结直肠癌患者术后切口感染影响因素众多,主要病原菌为革兰阴性菌,血清WBC、NLR和CRP联合检测对患者术后切口感染发生有较高的预测价值。
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关键词
白细胞计数
中性粒细胞与淋巴细胞比值
C-反应蛋白
结直肠癌
术后切口感染
原文传递
题名
机器学习算法确定的核心衰老基因在非远处转移性结直肠癌的预后和免疫微环境相关性分析
1
作者
李世森
余鹏飞
乔一桓
王珂
李丹
李云龙
机构
空军
军医大学
西京医院
消化
外科
空军军医大学西京医院消化外科手术室
出处
《空军军医大学学报》
CAS
2024年第7期781-787,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(82100680)。
文摘
目的建立非远处转移性结直肠癌(CRC)衰老基因模型和确定核心的衰老基因,分析其与肿瘤微环境的作用。方法下载TCGA和GEO数据库的非远处转移性CRC数据库,单因素Cox分析确定预后相关的衰老基因,多因素Cox分析建立非远处转移CRC的衰老模型。ESTIMATE算法计算出样本的免疫微环境评分(间质评分与免疫评分),并且研究衰老模型与其关系。采用随机生存森林算法用于计算出衰老基因的重要性,确定衰老核心基因。使用CIBERSORT算法评估肿瘤免疫细胞浸润情况,相关性分析研究衰老核心基因与细胞浸润的关系。结果多因素Cox回归分析建立由6个衰老基因组成的模型,在TCGA和GEO中都表明高风险人群的预后远远差于低风险组(P<0.001)。该衰老模型与CRC微卫星状态、肿瘤免疫评分和间质评分相关。随机生存森林算法确定3个核心的衰老基因(TERT、SNAI1和CSNK1A1),且与肿瘤免疫细胞浸润相关。此外,在免疫治疗人群中,SNAI1(P=0.016)和CSNK1A1(P<0.001)低表达组生存时间更长。结论肿瘤细胞衰老的程度越大,代表其增殖能力越弱,非远处转移性CRC患者的预后可能越佳。TERT、SNAI1和CSNK1A1作为衰老的核心基因,与肿瘤微环境相关,可能作为免疫治疗的生物学标志物。
关键词
衰老基因
非远处转移结直肠癌
肿瘤免疫微环境
免疫细胞
Keywords
senescence genes
non-distant metastatic colorectal cancer
tumor immune microenvironment
immune cells
分类号
R735.34 [医药卫生—肿瘤]
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
下载PDF
职称材料
题名
结直肠癌根治术后切口感染病原菌及影响因素
被引量:
15
2
作者
王珂
李世森
闫沛
刘小娟
戴艳然
机构
空军军医大学西京医院消化外科手术室
空军
军医大学
西京医院
消化
外科
空军
军医大学
西京医院
护理部
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期2995-2999,共5页
基金
陕西省科研基金资助项目(2016BH489)。
文摘
目的探究血清白细胞计数(WBC)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)及C-反应蛋白(CRP)水平,对腹腔镜下结直肠癌根治术后切口感染的预测价值。方法回顾性分析2019年1月—2019年6月于空军军医大学第一附属医院行腹腔镜根治术的结直肠癌患者200例的临床资料,通过分析其临床资料和随访结果,归纳患者术后切口感染的影响因素,并应用受试者工作特征曲线(ROC),评估WBC、NLR和CRP水平对患者术后并发切口感染的预测能力。结果200例患者术后有34例出现切口感染,感染率为17.00%;其中革兰阴性菌32株(78.05%),以大肠埃希菌为主(60.98%);革兰阳性菌9株(21.95%),以金黄色葡萄球菌为主(17.07%);营养不良、糖尿病及NLR水平均是患者术后切口感染的影响因素(P<0.05);WBC、NLR和CRP联合检测对结直肠癌患者术后切口感染发生的预测价值最高(P<0.05),曲线下面积(AUC)为0.951(95%CI:0.912~0.977),敏感度为91.20%,特异度为92.20%。结论结直肠癌患者术后切口感染影响因素众多,主要病原菌为革兰阴性菌,血清WBC、NLR和CRP联合检测对患者术后切口感染发生有较高的预测价值。
关键词
白细胞计数
中性粒细胞与淋巴细胞比值
C-反应蛋白
结直肠癌
术后切口感染
Keywords
White blood cell count
Neutrophil-to-lymphocyte ratio
C-reactive protein
Colorectal cancer
Postoperative incision infection
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
机器学习算法确定的核心衰老基因在非远处转移性结直肠癌的预后和免疫微环境相关性分析
李世森
余鹏飞
乔一桓
王珂
李丹
李云龙
《空军军医大学学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
结直肠癌根治术后切口感染病原菌及影响因素
王珂
李世森
闫沛
刘小娟
戴艳然
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
15
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已选择
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