汉滩病毒西安分离株84FLi的S片段全基因序列测定及分析

目的 : 测定我国陕西西安出血热肾病综合征 (HFRS)患者流产胎儿肝分离的病毒 84FLi株的全S片段基因序列 ,了解其分子特征 ,并确定其在汉坦病毒 (HV)种系发生中的位置。 方法 :采用逆转录 聚合酶链式反应(RT PCR) ,扩增出S基因的cDNA ,直接用PCR产物或克隆入 pMD18 T载体中测序。 结果 :84FLi株的全S基因共由 16 88个核苷酸组成 ,四种核苷酸的比例分别为A 31.39%、C 19.2 5 %、G 2 3.0 4 %和T 2 6 .30 % ,GC含量为4 2 .2 9% ,AT含量为 5 7.71%。最大开放读码框为 37～ 132 6 ,共编码 4 2 9个氨基酸。核苷酸序列同源性分析表明 ,84FLi株与汉滩病毒 (HTN)型同源性高于与其他型HTV的同源性。 84FLi株与中国毒株Chen4和RG9同属于一个进化分支 ,而与HTN型国外毒株距离较远 ,属于不同的进化分支。 结论 :84FLi株属于HTN ,并与国内分离的HTN同源性较高。