痰细胞p53和ras基因突变检测诊断价值的研究

肺癌是严重危害人类健康的常见恶性肿瘤，其发病率逐年增加，临床上所诊断的肺癌的８０％属晚期，失去了手术治疗的机会，５年生存率很低。寻找能诊断尤其是早期诊断肺癌的方法十分必要。分子生物学技术的发展为肺癌的基因诊断提供了可能。作者应用聚合酶链反应－单链构象...

人GLUT4基因的克隆及原核表达的初步实验研究

目的 通过反转录聚合酶链方法 ,从人新鲜手术肌肉组织获得人葡萄糖转运子 4 (GLUT4 )cDNA基因 ,并分别克隆入测序载体、表达载体 ,获得具有正确序列的目的基因及其原核表达产物 ,为其进一步的抗体制备、活性鉴定及研究应用奠定物质基础。方法 经GenBank在线检索 ,设计、确定人GLUT4cDNA基因特异引物 ,采用反转录聚合酶链 (RT PCR)方法从一例手术的人新鲜腹部肌肉组织总RNA模板中 ,获得人GLUT4表达片段cDNA的基因 ,经克隆入测序载体pGEM 3zf(- )测序 ,验证cDNA大小、完整性及序列。再克隆入表达载体 pBV2 2 0 ,经温度诱导 ,在E .coli获得表达。结果 以设计的特异引物 ,从人肌肉组织模板中能得到预期大小完整的人GLUT4cDNA基因 ,并能插入预定的克隆载体中测序 ,所得基因的序列与目的基因的序列相符。所获GLUT4cDNA基因插入原核非融合表达载体pBV2 2 0 ,获得预期大小的重组表达产物。结论 从人肌肉组织中能获得具有正确序列、含完整起始及终止密码的人GLUT4cDNA基因。

MBL基因突变检测新方法及RRTI患者的突变研究

目的:建立一种新的MBL基因突变检测方法,并分析反复呼吸道感染儿童中突变频率及发病相关性。方法:PCR扩增MBL基因第一外显子区段,核酸外切酶和碱性磷酸酶降解,清除PCR产物中残余引物和dNTPs,经引物延伸反应荧光素(R110或TAMRA)标记终止碱基特异性掺入引物的3′-末端,测定荧光偏振值判断掺入碱基及突变类型。用所建立方法检测46例反复呼吸道感染(RRTI)患儿和50例健康对照的MBL突变。结果:所建立方法检测MBL突变经测序验证完全正确。在临床RRTI患儿及对照组中发现54位密码子G>A突变,健康儿童中野生纯合型(G/G)39例(78.00%)、杂合型(G/A)8例(16.00%)、纯合突变(A/A)3例(6.00%);RRTI患儿中野生纯合型(G/G)18例(39.13%)、杂合型(G/A)22例(47.83%)、纯合突变(A/A)6例(13.04%);RRTI患儿组A等位基因频率显著高于对照组。患儿和对照组均未检测到52和57位密码子突变。结论:MBL 54G>A突变与RRTI发病风险相关,所建立的MBL基因多态性快速检测方法可用于小儿反复呼吸道感染辅助诊断和高风险人群的筛查。

仙鹿壮骨方对骨质疏松大鼠I型胶原基因表达的影响

目的研究补肾中药仙鹿壮骨方对骨质疏松症大鼠骨组织I型胶原基因mRNA表达的影响。方法用地塞米松制造骨质疏松症大鼠模型,给予不同剂量的仙鹿壮骨方药,并与西药补钙剂对照观察。测定大鼠骨密度,以荧光定量PCR检测I型胶原基因表达水平。结果模型组骨密度明显下降,治疗各组骨密度均有提高。模型组I型胶原基因表达显著下降,治疗各组I型胶原基因表达明显上升,上升幅度以中药大剂量组最高,西药组次之,中药小剂量较差。结论补肾中药仙鹿壮骨方能促进地塞米松型骨质疏松症大鼠I型胶原的合成,其防治骨质疏松症可能是通过促进骨组织中I型胶原基因的表达,提高骨密度而实现的。

血管紧张素Ⅱ诱导心肌成纤维细胞表达上调基因的分离和鉴定

为了对成年大鼠心肌成纤维细胞(cardiac fibroblasts,CF)受血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ,Ang Ⅱ)刺激后上调基因表达 谱进行筛选及分析,以受Ang Ⅱ刺激CF为实验方,未刺激CF为驱动方,进行抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH),建立消减cDNA文库。经斑点杂交筛选文库后将表达变化显著的部分阳性克隆测序及同源性分析,共 获得19个上调表达的基因,分别与细胞外基质、细胞周期、胞内信号转导、细胞骨架及细胞代谢等功能相关,并克隆 到7个新的基因表达序列标签(expressed sequence tags,EST)。我们的数据证实了SSH可以有效地克隆成年大鼠CF受Ang Ⅱ 刺激后上调表达基因,对这些基因的研究将有助于阐明心肌重塑的分子机制。

人胃癌细胞一种高表达基因的克隆及序列测定

采用DDRT PCR法 ,以人胃上皮细胞GES 1为对照 ,从人胃癌细胞SGC 790 1中克隆高表达基因 ,并对所克隆的基因进行斑点杂交分析 ,序列测定 ,序列相似性分析及开放读框分析 .斑点杂交分析结果表明所获克隆YA6 1为人胃癌细胞SGC 790 1中高表达基因 .序列相似性分析结果表明该基因序列为一新基因序列 .GenBank收录号为AF2 2 0 415 .开放读框分析结果表明该基因序列有一完全开放读框 .

解脲支原体Ⅰ型MB抗原主蛋白氮端基因的克隆及原核表达

目的 从新鲜培养的解脲支原体 ( URA) 型培养液获得其 MB抗原主蛋白 N端 1 /3保守区的基因 ,并体外表达 ,获得具有抗原活性的原核表达蛋白 ,为研制广谱、低廉及方便准确的 URA感染的诊断及治疗方法提供物质基础。方法 从新鲜培养的 URA标准株 型培养液提取 DNA模板 ,采用特异引物及聚合酶链方法获得其 MB抗原主蛋白 N端 1 /3保守区的基因 ,经克隆入测序载体验证 DNA大小及序列后 ,将 MB抗原主蛋白 N端 1 /3保守区的基因克隆入高效原核表达载体 ,并在大肠杆菌中表达 ,初步以Western- blot测定表达产物的抗原性即与感染者阳性血清的反应活性。结果 以笔者设计的特异引物 ,能得到预期大小的 PCR产物 ,并能插入预定的克隆载体中测序 ,所得基因的序列符合目的基因的序列 ,其插入原核表达载体能获得表达 ,且表达产物具有抗原活性 ,能与感染患者的血清发生抗原抗体反应。结论 所得到的 MB抗原主蛋白 N端 1 /3保守区片段的基因 ,与 GENE BANK检索序列一致。在大肠杆菌中表达此片段所获得的表达产物 ,有抗原活性 ,有望用于

淋球菌基因诊断新进展

淋球菌是一类寄生于人体尿道黏膜,导致人类泌尿生殖系感染的的细菌。及时、准确地诊断淋球菌感染是控制淋病传染的关键。基因检测技术在淋球菌临床诊断中的应用将使淋球菌的检测更加灵敏、准确。本文就近年来应用于淋球菌临床诊断的目的基因和新的检测技术以及它们在临床诊断中的特异性和敏感性综述如下。

大鼠血管组织血管紧张素原基因表达的实时PCR定量分析

目的:探讨大鼠血管组织血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)低丰度mRNA表达的实时PCR定量分析方法,并将其用于检测模拟失重大鼠基底和股动脉血管组织AGTmRNA的表达。方法:提取8周模拟失重(SUS)与对照组(CON)大鼠血管组织的总RNA,进行反转录后,对目的基因AGT与内参照基因GAPDH的mRNA进行实时PCR分析。应用TaqMan MGB探针,测出上述mRNA实时PCR反应的放大效率(E)及阈循环数Ct,再依据一定数学模型由E与Ct得出经GAPDH归一化的AGTmRNA表达变化。结果:与CON相比,SUS大鼠基底动脉组织AGTmRNA表达增加240%,而股动脉组织则降低66%。结论:本工作为定量检测大鼠血管组织低丰度mRNA表达提示了一种特异、灵敏、精确、重复性好的简便方法。

心肌成纤维细胞在血管紧张素Ⅱ刺激下表达下调基因的分离和鉴定

目的:对成年大鼠心肌成纤维细胞(CF)受血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)刺激后下调基因表达谱进行筛选及分析。方法:以受AngⅡ刺激CF为驱动方,未刺激CF为实验方,进行抑制消减杂交(SSH)建立消减cDNA文库。经斑点杂交筛选文库后将部分阳性克隆测序及进行同源性分析。结果:共获得17条下调表达基因,分别与胞内信号转导、转录抑制、纤维沉积和细胞骨架重构相关,并克隆到4条新基因表达序列标签(EST)。结论:SSH有效地克隆了成年大鼠CF受AngⅡ刺激后下调表达基因,对这些基因的研究将有助于阐明心肌改建的分子机制。

A组轮状病毒一步法RT-PCR检测技术的建立和应用研究

目的设计A组轮状病毒RV特异性引物,应用Tth酶,建立一步法RT-PCR扩增方案,检测西安地区腹泻幼儿196份粪便标本,并与本室研制建立的反向间接血凝法RPHA,聚丙烯酰胺凝胶电泳,市售ELISA试剂盒平行检测对比分析。方法设计并合成第九基因序列保守区互补的特异性引物,在经典法RT-PCR试验成功的基础上,建立合理的一步法RT-PCR。结果四种检测结果阳性率分别为33.16%,23.47%,21.94%和25%,X2检验表明,RT-PCR最为敏感。结论反转录和PCR由Tth酶一步完成,克服了经典法中AMV、RNasin等试剂昂贵,操作繁锁等缺点,很适合临检需要。

HPV6晚期表达基因L1的克隆并在杆状病毒表达系统的表达及其抗血清制备

目的 获得具有正确序列的人乳头瘤病毒 HPV6型晚期表达基因 L1 ,并获得其高活性表达 L1基因特异性抗血清 ,为进一步研究及临床检验应用奠定物质基础。方法 用 PCR法从感染人乳头瘤病毒患者尖锐湿疣组织中获得 HPV6晚期表达基因 L1 ,测序验证后 ,将正确的 HPV6晚期表达基因 L1序列 ,插入 Bac- to- Bac杆状病毒表达系统 ,转染昆虫细胞 Sf9,表达外壳蛋白 L 1 ,并以之作为抗原免疫兔 ,获得特异性抗血清。结果 获得了正确序列 HPV6晚期表达基因 L1 ,在 Bac- to- Bac杆状病毒系统活性表达并获得其特异性抗血清。结论 获得 HPV6晚期表达基因 L1 ,及有抗原活性的表达和相应抗血清。

幽门螺杆菌尿素酶C基因的克隆及测序

目的用PCR方法扩增幽门螺杆菌(Hp)尿素酶C基因,以构建Hp UreC基因的重组克隆,为进一步表达Hp UreC基因的重组蛋白质并研究其功能奠定基础。方法以Hp临床菌株总DNA为模板,根据已发表的HpUreC基因序列设计引物(位于588bp～605bp和1737bp～1754bp),采用PCR方法扩增出一个1173bp的Hp尿素酶C基因片段,用BamHⅠ及EcoRⅠ双酶切后将其克隆入测序质粒pGEM-3Zf(-)中,以全自动测序仪双向测定目的片段序列,借助于DNA TOOL 5.1拼接成完整序列,与已知的Hp UreC基因序列做比较。结果所得核酸序列与报道的Hp国际标准菌株M60398的UreC基因同源性为95％,根据测序结果推断其编码的氨基酸序列,并行BLAST分析,发现它与标准菌株M60398的氨基酸序列同源性为97％。结论成功构建了Hp UreC基因的重组克隆,为进一步研究表达Hp UreC基因的重组蛋白质并研究其功能奠定了基础。

幽门螺杆菌ureB基因表达产物的反应原性

目的 克隆幽门螺杆菌 ure B基因 ,并进行表达 ,验证表达产物的反应原性 .方法 应用 PCR技术从临床分离株中扩增出 ure B基因 ,克隆入载体 p GEM- 7zf(+)进行测序 ,进一步转到大肠杆菌表达载体 p BV2 2 0进行诱导表达 ,以Western blot实验验证重组蛋白的反应原性 .结果 测序后经同源性比较 ,证实扩增后得到的片断确为 ure B基因 ,并原核表达出可被抗 Hp抗体识别的非融合重组蛋白 .结论 获得了有反应原性的重组 Ure B蛋白 .

新型Taq Man-MGB探针在结核分枝杆菌实时PCR检测中的应用

为建立一种比现有方法敏感、准确性高、重复性好的结核分枝杆菌DNA定性定量检测方法 ,以TaqMan探针技术为基础 ,运用TaqMan MGB探针 ,实时检测临床标本中的结核分枝杆菌DNA .用来自临床标本的DNA及克隆于载体的IS6 1 1 0序列检测所建立方法的有效性 .结果显示 ,所建立方法的最低检测限度为 1个基因拷贝 反应 ,在每反应 1 0 0 ～ 1 0 8拷贝范围内 ,Ct 值同DNA量的对数呈线性关系 .同一模板不同时间或同一时间不同管内扩增 ,所得Ct 值恒定 .用该方法检测 37例结核分枝杆菌培养阳性的痰液标本 ,敏感度为 1 0 0 % ;用该方法检测 1 6例TB系列阴性参考品 ,特异性为1 0 0 % .结果表明 。

新型MGB探针在沙眼衣原体实时PCR检测中的应用

为建立基于TaqMan MGB探针的沙眼衣原体DNA荧光定量PCR检测方法 ,探讨其临床应用价值 ,用PCR法扩增沙眼衣原体隐蔽质粒pLVG44 0 2 464～ 2 980nt段 ,并克隆入 pMD18 T载体用作参比模板 ,设计一对引物和一个TaqMan MGB探针 ,优化反应条件 ,建立沙眼衣原体DNA荧光定量PCR检测系统 ,并运用该系统同时应用连接酶链式反应 (LCR)法对临床标本进行检测 .结果显示所建立的沙眼衣原体DNA荧光定量PCR检测系统 ,最低检测限度为 1DNA拷贝每反应 ;在 10 0 ～ 10 9DNA拷贝每反应范围内 ,Ct 值 (每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数 )和DNA拷贝数呈线性关系 (r >0 990 ) ;对临床标本检测结果同LCR分析结果吻合率为 10 0 % .以上结果表明 ,所建立的基于TaqMan MGB探针的沙眼衣原体DNA荧光定量PCR检测系统具有敏感性高、特异性强和线性检测范围广等特点 。

Centrobin与BRCA2蛋白间相互作用及其细胞定位

为分析乳腺癌易感基因2（breast cancer susceptibility gene2,BRCA2）蛋白与中心体BRCA2相互作用蛋白（centromal BRCA2interacting protein,centrobin）间相互作用及其细胞定位的关系,探讨二者功能上的联系,本研究采用哺乳细胞双杂交实验检测体内结合并初步判定BRCA2分子上的结合区域 免疫共沉淀实验进一步验证其体内结合活性,GST-pulldown法检测其体外结合活性,免疫组织化学染色观测BRCA2蛋白的细胞定位及在有丝分裂各期centrobin的细胞定位.结果显示,BRCA2与centrobin间存在体内和体外结合,且BRCA2分子的结合区域主要位于2393-2952氨基酸残基处 外源表达BRCA2定位于中心体,在有丝分裂各时相centrobin均定位于中心体.BRCA2与centrobin在体内形成复合物,并存在直接物理结合作用,二者存在细胞空间定位的一致性.该结果为进一步研究BRCA2在中心体复制中的调控作用提供了线索.