联合多种高通量表达谱数据库挖掘胃癌S100基因的差异表达

目的:探讨利用生物信息学方法筛选胃癌组织与正常胃组织差异表达基因的可行性及具体方法,寻找胃癌相关S100基因.方法:联合SAGE分析、虚拟电子杂交和虚拟微阵列,挖掘癌基因组解剖计划和基因表达综合数据库资源中关于胃癌和正常胃组织差异表达S100基因.结果:5个S100基因在胃癌组织中上调表达,包括S100A2、S100A3、S100A4、S100A7和S100A10.S100A3是新的胃癌过表达基因.结论:首次探讨性利用生物信息学方法系统分析胃癌S100基因表达.多个S100家族成员在胃癌中上调表达.联合多数据库挖掘肿瘤相关基因是一个可靠的方法,给进一步生物学实验以大量的提示.

结直肠癌组织中Formin2蛋白的表达及意义

目的 探讨结直肠癌组织中Formin 2（FMN2）蛋白的表达及其与结直肠癌患者临床病理因素和预后的关系.方法 回顾性分析2008年1月至2011年12月第四军医大学西京消化病医院收治的335例结直肠癌患者的临床病理资料.收集患者手术切除的结直肠标本进行研究.采用免疫组织化学染色检测结直肠癌患者癌组织及癌旁组织中FMN2蛋白的表达情况,分析其与结直肠癌患者临床病理因素和预后的关系.采用电话或信件方式进行随访,随访时间截至2014年6月.率的比较以及FMN2表达与临床病理因素的关系分析采用χ^2检验.采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,Log-rank检验进行生存分析.结果 FMN2蛋白的表达位于结直肠癌组织细胞的细胞质.结直肠癌组织中FMN2蛋白的阳性表达率为53.73％ （180/335）,癌旁组织中为80.90％（271/335）,两者比较,差异有统计学意义（χ^2=46.792,P＜0.05）.结直肠癌组织中FMN2蛋白的表达在结直肠癌患者的肿瘤分化程度、TNM分期及淋巴结转移方面比较,差异有统计学意义（χ^2=7.707,36.472,40.635,P＜0.05）.322例患者获得术后随访,随访率为96.12％（322/335）.随访时间为3～36个月,中位随访时间为26个月.其中173例FMN2蛋白阴性表达的结直肠癌患者中位生存时间为30个月,3年累积生存率为48.6％;149例FMN2蛋白阳性表达的结直肠癌患者中位生存时间为36个月,3年累积生存率为68.5％,两者生存情况比较,差异有统计学意义（χ^2=16.283,P＜0.05）.结论 FMN2蛋白在结直肠癌组织中表达下调,与结直肠癌的发生、发展密切相关,可作为判断患者预后的指标.