绍兴市MSM人群HIV-1分子传播网络特征分析

目的 分析浙江省绍兴市男男性行为人群(MSM)艾滋病病毒1型(HIV-1)分子传播网络特征,为MSM人群艾滋病防治提供依据。方法 选择2021年1月—2023年9月绍兴市新报告MSM人群艾滋病病毒感染者和艾滋病患者(HIV/AIDS)为研究对象,收集抗病毒治疗前血浆样本,采用反转录PCR和巢式PCR扩增HIV-1 pol基因,构建系统进化树分析基因亚型;采用HIV-TRACE法构建1.5%基因距离的分子传播网络,分析成簇情况和分子簇内病例特征。结果纳入2021年1月—2023年9月绍兴市MSM人群HIV/AIDS病例216例,获得合格序列179例。HIV-1亚型以CRF07_BC和CRF01_AE为主,分别为95和66例。在1.5%基因距离下共形成20个分子簇,61个节点和58条边。61条序列入网,入网率为34.08%。绍兴市各县(市、区)均有MSM人群HIV/AIDS病例入网。节点数≥10个的大分子簇1个,涉及5个县(市、区) 12例病例;节点数4~5个的中分子簇3个;节点数2~3个的小分子簇16个。边数≥4条的高传播风险病例有7例,均为CRF07_BC亚型;其中2例来自大分子簇,5例来自嵊州市、新昌县病例组成的同一分子簇。结论 绍兴市MSM人群HIV/AIDS病例HIV-1基因亚型以CRF07_BC和CRF01_AE为主,存在跨地区HIV传播,嵊州市和新昌县可能存在潜在传播风险点。

绍兴市市售生畜肉沙门菌分子分型与耐药分析

目的了解浙江省绍兴市市售生畜肉中沙门菌的分子分型与耐药特征,为耐药沙门菌防控提供依据。方法于2023年3—11月采集绍兴市超市、农贸市场和餐饮店生畜肉样品检测沙门菌,进行血清分型;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)进行分子分型;采用微量肉汤稀释法和全基因组测序(WGS)进行耐药表型和耐药基因分析。结果329份生畜肉中检出沙门菌34株,检出率为10.33%;检出14种血清型,优势血清型为里森沙门菌和伦敦沙门菌,分别为9和8株,占26.47%和23.53%。PFGE分型获得31种带型图谱和23个带型簇,相似度为30.80%~100.00%,无明显优势带型。MLST共检出15种序列型别(ST),其中里森沙门菌均为ST469型,伦敦沙门菌均为ST155型。对四环素和氨苄西林的耐药率较高,分别为44.12%和35.29%。共产生13种耐药谱,其中8种为多重耐药谱,多重耐药率为29.41%。检测到8类14种耐药基因,其中氨基糖苷类耐药基因aac(6')-Iaa携带率为100.00%;苯丙醇类抗生素耐药表型与耐药基因一致率最高,为97.06%;喹诺酮类抗生素耐药表型与耐药基因无一致性。结论绍兴市市售生畜肉样品检出的沙门菌血清型以里森沙门菌和伦敦沙门菌为主;PFGE带型呈现多态性,MLST主要为ST469型和ST155型;对四环素和氨苄西林耐药率较高,存在多重耐药现象。

2020—2023年浙江省绍兴市老年急性上呼吸道感染患者病原学流行特征

【目的】监测分析2020—2023年浙江省绍兴市老年急性上呼吸道感染病例病原体流行特征,以指导老年人急性上呼吸道病原体感染的合理防治。【方法】采集2020年1月—2023年12月因急性上呼吸道感染在绍兴市传染病监测哨点医院传染病门诊就诊的老年患者的鼻咽拭子标本,采用多重核酸检测法检测甲型流感病毒(Flu A)、乙型流感病毒(Flu B)、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(HRV)、腺病毒(ADV)和肺炎支原体(MP),对以上6种病原体进行流行病学分析。统计学分析采用χ^(2)检验。【结果】共采集年龄60~89岁的老年患者急性上呼吸道感染鼻咽拭子样本3670份,检测结果显示阳性2330例,阳性检出率为63.49%。2293例为单一病原体感染(简称“单一感染”),包括Flu A阳性1255例,Flu B阳性356例,ADV阳性63例,RSV阳性76例,HRV阳性363例,MP阳性180例。Flu A、Flu B、ADV、RSV、HRV、MP的检出率分别为34.20%、9.70%、1.72%、2.07%、9.89%和4.90%。2种及以上病原体混合感染37例,阳性检出率为1.01%。混合感染重症率高于单一感染(χ^(2)=24.468,P<0.001)。单一感染病例中,重症率最高为ADV感染,达4.76%;其次是Flu A和RSV,分别为3.19%和2.63%;重症率最低的是MP感染,为0.56%。上述6种呼吸道病原体感染重症病例分布均与其流行高峰相对应。【结论】老年急性上呼吸道感染与不同呼吸道病原体感染密切相关,且多种呼吸道病原体混合感染可能提高老年患者呼吸道疾病重症率。

2018年至2019年浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型感染者的分子传播网络特征分析

目的分析浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征,为疫情流行趋势和防治提供依据。方法纳入2018年8月至2019年12月绍兴市新确证未经抗病毒治疗的423份HIV-1感染/艾滋病病例血液样本,获得375份样本序列,采用反转录聚合酶链反应和巢式聚合酶链反应扩增HIV-1的pol基因,采用MEGA 6.0软件构建系统进化树分析亚型,并采用HyPhy软件和Cytoscape 3.7.2。生成不同基因距离的分子网络,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点。结果375份样本序列中发现8种亚型,优势亚型为流行重组型(circulating recombinant form,CRF)07BC 215份(57.33%),CRF01AE 103份(27.47%),其他包括CRF08BC、CRF85BC、CRF5501B、B、C和CRF01AE/B亚型。在基因距离为1.50%时,共形成24个分子簇,194条序列入网,入网率为51.73%。在分子簇最多的0.75%基因距离时,共形成30个分子簇,129条序列入网,入网率为34.40%,35例以老年人为主的病例聚集成CL1簇。42份样本存在监测性耐药突变(surveillance drug resistance mutation,SDRM),耐药传播率为11.20%(42/375),其中非核苷类反转录酶抑制剂耐药突变38例,分别为K103N(32/375,8.53%)、K103S(4/375,1.07%)、Y188L(1/375,0.27%)和G190A(1/375,0.27%),蛋白酶抑制剂耐药突变4例,分别为M46I(3/375,0.80%)和V82A(1/375,0.27%)。分子簇C2序列携带高比例耐药突变(94.29%,33/35)。结论绍兴市HIV-1亚型丰富多样,CRF07BC亚型传播迅速;在0.75%基因距离仍聚集的CL1簇老年病例亟待干预,防止该耐药毒株的进一步快速传播。

绍兴市手足口病病毒型别检测结果分析

目的了解绍兴市手足口病病毒型别分布,为手足口病防治工作提供参考。方法收集2018—2020年绍兴市手足口病监测哨点医院14岁以下手足口病病例的肛拭子/咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR和BLAST序列比对测定肠道病毒型别,描述性分析肠道病毒型别构成及流行时间分布。结果2018—2020年收集肛拭子/咽拭子标本1267份,检出阳性661份,阳性率为52.17%。其中肠道病毒71型(EV71)70份,阳性率为5.52%;柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)208份,阳性率为16.42%;CoxA6型239份,阳性率为18.86%;CoxA10型23份,阳性率为1.82%;其他型别121份,成功测序84份,检出CoxA2、CoxA4和CoxA5等10种型别。2018—2020年EV71型阳性率分别为14.08%、0.72%和1.84%,2018年4—7月为检出高峰;CoxA16型阳性率分别为10.98%、26.57%和11.98%,2019年4—8月和11—12月为检出高峰;CoxA6型阳性率分别为10.50%、14.73%和30.88%,2020年5—12月为检出高峰。结论2018—2020年绍兴市手足口病的主要肠道病毒型别为EV71、CoxA16和CoxA6型,且CoxA6型检出有上升趋势。

呼吸道感染肠道病毒D68型病例特征分析

目的了解浙江省绍兴市10例呼吸道感染肠道病毒D68(EV-D68)型病例特征,为制定EV-D68感染防制策略提供依据。方法收集2021—2022年绍兴市哨点医院就诊的急性呼吸道感染病例的基本情况和临床标本,采用实时荧光PCR和肠道病毒VP1区测序法检测EV-D68,描述性分析EV-D68阳性病例的流行病学和病原学特征。结果2021—2022年共检测急性呼吸道感染病例3009例,检出EV-D68阳性10例,阳性率为0.33%。其中,男性6例,女性4例;<18岁5例,18~60岁2例,>60岁3例;夏秋季高发,5—7月和9—10月各检出5例。临床症状以发热(10例)、咽痛(9例)和咳嗽(8例)为主;10例病例均恢复良好,无死亡报告。10份EV-D68阳性标本经序列比对均属于D3亚型。结论绍兴市EV-D68引起的呼吸道感染主要感染18岁以下儿童青少年,夏秋季高发,D3亚型为主要流行型别。

重症医学科耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌耐药基因研究

目的了解鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因型,探讨其耐药性与治疗策略。方法分离2014年-2016年重症医学科(ICU)耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌208株,用VITEK 2全自动微生物鉴定系统进行菌种鉴定及药敏检测,PCR法检测OXA-23、OXA-24、OXA-51和OXA-58基因。结果耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌对ICU常用药物除头孢哌酮/舒巴坦外耐药率均> 50%。OXA-23、OXA-24、OXA-51和OXA-58基因的检出率分别为89. 95%、0. 00%、100. 00%、67. 72%。结论 ICU耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌广泛携带OXA型耐药基因,需要调整用药,加强监测。

人轮状病毒非结构蛋白2与宿主互作蛋白的筛选及分子对接研究

目的筛选轮状病毒非结构蛋白2(nonstructural protein 2,NSP2)与宿主细胞的互作蛋白,为抗病毒靶标的发掘提供理论依据。方法NSP2-pGEX-6P-1重组质粒转化E.coli BL21(DE3),IPTG诱导表达,GST亲和层析法获得NSP2-GST纯化蛋白,Western blot进行验证。将NSP2-GST及GST纯化蛋白作为靶蛋白,通过GST pull-down捕获与MA104宿主细胞互作的差异蛋白。经银染后,将差异条带通过蛋白质胶内酶解及质谱法筛选出相应蛋白质,借助Protein Pilot平台过滤肽段,由Paragon算法获得蛋白质名称和相关的生物学功能。通过蛋白质互作网络图和GO功能注释分析,展示互作蛋白间的潜在联系。同时,利用HDOCK软件对排名前三的蛋白质进行分子对接预测,结合对接分数和置信分数加以验证,揭示蛋白质间的可视化对接模型。结果SDS-PAGE和Western blot表明NSP2重组蛋白纯化成功。经GST pull-down联合蛋白质谱鉴定,筛选出PKM2等10种可能与NSP2互作的宿主蛋白质;GO分析及互作图展示出RPS4X、EZR、SUPT16H、EIF2S3介导分子表达,PKM2、LDHA、ATP5A1参与能量代谢,HSP90、ACTB、ANXA2参与生物运动过程,并且彼此之间存在功能联系及互作网络。分子对接显示出PKM2、HSP90、RPS4X与NSP2存在互作关系,相互作用力强,能够形成稳定结构。结论成功发现宿主细胞中PKM2、HSP90、RPS4X等蛋白质与NSP2存在互作关系,为轮状病毒感染过程的探究及相关防控策略的制定提供参考。

无偿献血者人类免疫缺陷病毒感染分析

目的了解无偿献血者人类免疫缺陷病毒（HIV）感染状况,为更好的做好献血招募工作提供理论基础。方法对2009-2013年221 715名无偿献血者抗-HIV筛查结果进行分析,对确认为阳性者的资料进行回顾性研究,数据采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 2009-2013年绍兴地区221 715名无偿献血者抗-HIV初筛阳性率为1.27‰,经确认为阳性的有17人,确认后阳性率7.67/10万;确认阳性者均为抗-HIV-1阳性,以未婚、19~35岁、高中/中专以下学历、初次献血、男性为主,阳性率分别为58.82%、88.24%、70.59%、70.59%、88.24%,本地户籍人口和外地户籍人口接近,以街头和站内自愿无偿献血者（64.71%）为主,可以追溯到的9名献血者均为性传播,且男男同性传播占较大比例,占44.44%。结论无偿献血者抗-HIV筛查阳性率及确认阳性率均处于较低水平,街头无偿献血的模式并不比单位团体组织采血模式更安全,献血前征询工作还需进一步加强。