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基于mtDNA-COI基因序列分析我国中华按蚊种群的遗传结构
被引量:
10
1
作者
常雪莲
钟代斌
+6 位作者
李小聪
黄亚铭
朱国鼎
魏星
夏惠
陈晓光
方强
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期234-238,247,共6页
目的探讨我国中华按蚊种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系。方法本实验采用2010-2012年间在我国山东,安徽,江苏,贵州,广西和云南等6个不同地理环境采集的中华按蚊样品,进行线粒体COI基因扩增并测序。采用Bioedit 7.0软件对测...
目的探讨我国中华按蚊种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系。方法本实验采用2010-2012年间在我国山东,安徽,江苏,贵州,广西和云南等6个不同地理环境采集的中华按蚊样品,进行线粒体COI基因扩增并测序。采用Bioedit 7.0软件对测序结果进行比对分析;运用Dna SP 5.0软件确定种群遗传结构特点;应用Arlequin 3.1软件计算种群的遗传距离及遗传分化系数;通过IBDWS在线软件来明确遗传距离与地理距离的相关性;使用PHYLIP 3.6软件构建种群系统发育进化树。结果六个中华按蚊种群共123个雌蚊个体的PCR产物成功扩增和测序。PCR扩增中华按蚊线粒体COI基因序列大小为814 bp,平均A+T含量(71.2%)>平均G+C含量(28.8%)。线粒体COI序列分析结果显示,种群具有丰富的遗传多样性;分子变异等级分析表明中华按蚊遗传分化主要来自于种群内部;种群间存在一定的地理隔离现象。中性检验,错配分析及聚类进化树结果显示:中华按蚊种群发展经历扩张状态,而云南种群相对其他种群较独立,在系统树中为孤立一支。结论线粒体COI基因可以作为研究中华按蚊种群遗传结构和系统进化的理想分子标志。云南种群遗传发育较其他地理种群具有一定特殊性。
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关键词
中华按蚊
mtDNA-COI
种群遗传
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题名
基于mtDNA-COI基因序列分析我国中华按蚊种群的遗传结构
被引量:
10
1
作者
常雪莲
钟代斌
李小聪
黄亚铭
朱国鼎
魏星
夏惠
陈晓光
方强
机构
蚌埠医
学院
病原生物学教研室
美国加州大学欧文分校健康科学院公共卫生部
广东普通高校新发传染病防治重点实验室
广西壮族自治区疾病预防控制中心
江苏省血吸虫病防治研究所
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期234-238,247,共6页
基金
美国国立卫生研究院NIH项目(D43TW009527-01)
广东省普通高校新发传染病防治重点实验室开放基金项目(KLB09007)
+1 种基金
安徽省自然科学基金(1308085MH160)
蚌埠医学院自然科学基金重点项目(BYKY1403ZD)
文摘
目的探讨我国中华按蚊种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系。方法本实验采用2010-2012年间在我国山东,安徽,江苏,贵州,广西和云南等6个不同地理环境采集的中华按蚊样品,进行线粒体COI基因扩增并测序。采用Bioedit 7.0软件对测序结果进行比对分析;运用Dna SP 5.0软件确定种群遗传结构特点;应用Arlequin 3.1软件计算种群的遗传距离及遗传分化系数;通过IBDWS在线软件来明确遗传距离与地理距离的相关性;使用PHYLIP 3.6软件构建种群系统发育进化树。结果六个中华按蚊种群共123个雌蚊个体的PCR产物成功扩增和测序。PCR扩增中华按蚊线粒体COI基因序列大小为814 bp,平均A+T含量(71.2%)>平均G+C含量(28.8%)。线粒体COI序列分析结果显示,种群具有丰富的遗传多样性;分子变异等级分析表明中华按蚊遗传分化主要来自于种群内部;种群间存在一定的地理隔离现象。中性检验,错配分析及聚类进化树结果显示:中华按蚊种群发展经历扩张状态,而云南种群相对其他种群较独立,在系统树中为孤立一支。结论线粒体COI基因可以作为研究中华按蚊种群遗传结构和系统进化的理想分子标志。云南种群遗传发育较其他地理种群具有一定特殊性。
关键词
中华按蚊
mtDNA-COI
种群遗传
Keywords
Anopheles sinensis
mtDNA-COI
population genetic
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于mtDNA-COI基因序列分析我国中华按蚊种群的遗传结构
常雪莲
钟代斌
李小聪
黄亚铭
朱国鼎
魏星
夏惠
陈晓光
方强
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
10
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