中国汉族人与美国高加索人乳腺癌患者线粒体基因细胞突变的比较

目的:探讨不同种族乳腺癌患者线粒体DNA体细胞性突变的差异。方法:利用时相温度梯度凝胶电泳方法对2000/2003所保存的肿瘤样本中,随机抽取的54例中国汉族人和19例美国高加索人乳腺癌患者乳腺组织和距肿瘤边缘5cm以上的正常乳腺组织进行前瞻性突变分析研究。采用32对重叠引物扩增了来自所有患者的肿瘤组织和配对正常组织的线粒体全长基因,对肿瘤和正常组织中不同的电泳条带类型的DNA片段进行测序以辩明其突变类型。结果:747%(14/19)高加索人乳腺癌具有体细胞性线粒体基因突变,汉族人中乳腺癌体细胞性突变的发生率仅37%(24/54),但后者未记录于MitoMap数据库的新突变数明显多于前者。两组均以D环区突变密度最高,汉族人rRNA区突变密度高于高加索人,而D环区则较之为低(χ2=9.27,P=0.026)。结论:中国汉族人与美国高加索人乳腺癌患者线粒体基因体细胞性突变频率、各基因区域的突变分布和突变密度具有一定的差异。在中国汉族人群乳腺癌患者出现较多的未记录于MitoMap数据库的新突变,显示出汉族人具有与高加索人不同的线粒体基因体细胞性突变特征。本研究为肿瘤预防性干预提供理论依据。

人类线粒体基因控制区序列的变异频率与碱基构成特点分析

目的 探讨人类线粒体基因控制区的多态频率和变异类型。方法 搜集基因文库记录的 86个人类线粒体基因D环控制区序列 ,并与标准剑桥序列进行比对分析。结果 86个序列中共在 181个位点发现 12 5 3个碱基变异 ,主要变异形式为碱基转换 (占 71.75 % ) ,其次为碱基插入 (16 .0 4 % )和缺失 (8.6 2 % ) ,碱基颠换较少 ,仅占3.5 9%。核酸位点 16 189、30 3～ 315、5 14～ 5 2 3是变异频率较高 ,且具有基因长度不稳定的区域。结论 线粒体基因D环区为高度多态变异区 ,其变异频率的确定可为针对线粒体基因多态性与疾病发生风险评估的其他研究提供参考。

646个人类线粒体rRNA基因序列的多态频率和变异特征对糖尿病、痴呆、心肌病发生风险评估的意义

目的:探讨人类线粒体tRNA基因序列的多态频率和变异类型。方法:搜集基因文库记录的646个人类线粒体tRNA基因序列,并与修正的剑桥序列进行比对分析。结果:在22个线粒体tRNA基因序列中共发现107个位点共具有513个碱基变异,平均变异密度约为每人每100碱基0.052个变异。可变碱基的主要变异形式为碱基转换(94.17%),其次为颠换(2.53%),最常见的碱基转换类型为A→G和T→C。位于np15888～15953的tRNA苏氨酸基因变异位点数最多,在该基因中66个核苷酸中有15个位点具有多态性碱基替换变异,约占该基因22.72%,明显高于其他21个tR-NA基因。结论:线粒体tRNA基因具有高频多态变异,其变异频率的确定可为针对线粒体基因多态性与糖尿病、痴呆、心肌病相关疾病发生风险评估的其他研究提供参考。

食管癌线粒体DNA体细胞性突变与种系性变异

目的:探讨线粒体DNA体细胞性突变和种系性变异在食管癌的发生情况及其可能的作用. 方法:利用时相温度梯度电泳方法分析了食管癌的线粒体基因体细胞性突变.采用32对重叠引物扩增了来自20例食管癌患者的肿瘤组织和配对正常组织的线粒体全长基因,在肿瘤和正常组织中不同的电泳条带类型的DNA片段被测序以辩明其突变类型. 结果:在20例肿瘤中11例(55%)至少发现一个体细胞性突变,总共发现14个体细胞性突变,其中1个位于rRNA (7.1%),4个位于mRNA(28.5%),另外9个位于高变D环区(64.3%).4个新的体细胞性突变中2个为错义突变.在测序片段中共发现187个种系性变异,其中14个为新发现的变异,173个为已被报道并记录在线粒体基因数据库中. 结论:食管癌患者线粒体DNA存在高发生频率的体细胞性突变提示线粒体DNA的变异可能与食管癌的发生发展有关.