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SARS冠状病毒全基因组序列初步分析
被引量:
7
1
作者
陈蕴佳
高歌
+6 位作者
鲍一明
Rodrigo LOPEZ
吴健民
蔡涛
叶志强
顾孝诚
罗静初
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期493-500,共8页
对已经完成全序列测定的 12个SARS病毒基因组进行了多序列比对 ,发现序列主体部分 2 970 8b具有99 82 %的相同碱基 ,除 2个序列各有 5个和 6个碱基的缺失外 ,其余部分共有 4 2个位点核苷酸碱基的差异 ,其中2 8个位点的碱基差异可引起氨...
对已经完成全序列测定的 12个SARS病毒基因组进行了多序列比对 ,发现序列主体部分 2 970 8b具有99 82 %的相同碱基 ,除 2个序列各有 5个和 6个碱基的缺失外 ,其余部分共有 4 2个位点核苷酸碱基的差异 ,其中2 8个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变。利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具 ,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像 ,推测了可能产生的结构和功能改变 ,为进一步生物学实验提供参考。所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站 (antisars.cbi.pku .edu .cn)上发布。
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关键词
SARS冠状病毒
多序列比对
蛋白质序列分析
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
SARS冠状病毒全基因组序列初步分析
被引量:
7
1
作者
陈蕴佳
高歌
鲍一明
Rodrigo LOPEZ
吴健民
蔡涛
叶志强
顾孝诚
罗静初
机构
北京大学生命科学学院
美国国家生物技术信息中心
欧洲
生物
信息
学研究所
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期493-500,共8页
基金
863基金(2001AA231011,2002AA231061)
国家自然科学基金(30170232)资助
文摘
对已经完成全序列测定的 12个SARS病毒基因组进行了多序列比对 ,发现序列主体部分 2 970 8b具有99 82 %的相同碱基 ,除 2个序列各有 5个和 6个碱基的缺失外 ,其余部分共有 4 2个位点核苷酸碱基的差异 ,其中2 8个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变。利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具 ,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像 ,推测了可能产生的结构和功能改变 ,为进一步生物学实验提供参考。所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站 (antisars.cbi.pku .edu .cn)上发布。
关键词
SARS冠状病毒
多序列比对
蛋白质序列分析
生物信息学
Keywords
SARS coronavirus,multiple sequence alignment,sequence analysis,bioinformatics
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SARS冠状病毒全基因组序列初步分析
陈蕴佳
高歌
鲍一明
Rodrigo LOPEZ
吴健民
蔡涛
叶志强
顾孝诚
罗静初
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
7
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职称材料
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参考文献
引证文献
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