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基于生物信息学分析RPS19基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义
被引量:
3
1
作者
蔡华裕
程远航
+2 位作者
王洁
赵虎
吴卫真
《临床泌尿外科杂志》
2019年第9期689-694,共6页
目的:通过生物大数据分析核糖体蛋白S19(RPS19)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法:利用Oncomine数据库检索并筛选出RPS19的信息,得到RPS19在ccRCC的表达情况,使用GEPIA数据库分析RPS19的表达与ccRCC患者在TCGA数据中生存...
目的:通过生物大数据分析核糖体蛋白S19(RPS19)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法:利用Oncomine数据库检索并筛选出RPS19的信息,得到RPS19在ccRCC的表达情况,使用GEPIA数据库分析RPS19的表达与ccRCC患者在TCGA数据中生存率之间的关系,采用LinkedOmics数据中的LinkFinder模块分析RPS19与ccRCC临床病理特征的关系。通过LinkedOmics进行RPS19在TCGA KIRC数据中的表达相关性分析,并进一步通过Metascape网站进行基因富集分析。结果:RPS19的表达水平在ccRCC组织中较正常组织明显升高。RPS19的表达与ccRCC的病理分级、T分期、N分期呈显著正相关性。高表达RPS19的患者总体生存率显著低于低表达RPS19的患者。此外,RPS19基因与RPLP2、RPS2、RPS11、PRS15、RPS16、RPS9等基因密切相关,可能通过TNF-α/NF-κB参与ccRCC的发生发展(P<0.001)。结论:RPS19在ccRCC中显著高表达,并与ccRCC的发生发展相关,大大增加其作为潜在治疗靶点的可能性。
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关键词
肾透明细胞癌
RPS19
数据分析
预后
原文传递
题名
基于生物信息学分析RPS19基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义
被引量:
3
1
作者
蔡华裕
程远航
王洁
赵虎
吴卫真
机构
联勤保障部队第九〇〇医院福建省临床重点专科泌尿外科
厦门大学附属东方
医院
泌
尿
外科
出处
《临床泌尿外科杂志》
2019年第9期689-694,共6页
基金
福建省临床重点专科建设项目(编号[2019]739号)
文摘
目的:通过生物大数据分析核糖体蛋白S19(RPS19)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法:利用Oncomine数据库检索并筛选出RPS19的信息,得到RPS19在ccRCC的表达情况,使用GEPIA数据库分析RPS19的表达与ccRCC患者在TCGA数据中生存率之间的关系,采用LinkedOmics数据中的LinkFinder模块分析RPS19与ccRCC临床病理特征的关系。通过LinkedOmics进行RPS19在TCGA KIRC数据中的表达相关性分析,并进一步通过Metascape网站进行基因富集分析。结果:RPS19的表达水平在ccRCC组织中较正常组织明显升高。RPS19的表达与ccRCC的病理分级、T分期、N分期呈显著正相关性。高表达RPS19的患者总体生存率显著低于低表达RPS19的患者。此外,RPS19基因与RPLP2、RPS2、RPS11、PRS15、RPS16、RPS9等基因密切相关,可能通过TNF-α/NF-κB参与ccRCC的发生发展(P<0.001)。结论:RPS19在ccRCC中显著高表达,并与ccRCC的发生发展相关,大大增加其作为潜在治疗靶点的可能性。
关键词
肾透明细胞癌
RPS19
数据分析
预后
Keywords
clear cell renal cell carcinoma
ribosomal protein S19
bioinformatics analysis
prognosis
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析RPS19基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义
蔡华裕
程远航
王洁
赵虎
吴卫真
《临床泌尿外科杂志》
2019
3
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