生物信息学及其在生物医学中的应用

生物信息学(bioinformatics)是近年来发展起来的一门将分子生物学和计算机信息处理技术结合起来的交叉学科,它的基本出发点是利用数据库和软件技术对大量涌现的生物大分子序列数据和实验新测定的序列进行结构比较和统计学分析,推导出序列同源性,从而揭示生物大分子的分子结构、功能、进化等关系,是分子生物学研究的一个新领域.近年来,随着Internet网络的发展和普及,越来越多的生物信息学数据库和分析软件与Internet联结,为我们提供了巨大无比的信息资源和服务资源.

花粉抗动物脑衰老的机制研究

本实验使用花粉抗大鼠脑衰老 ,发现花粉具有预防动物海马、纹状体、下丘脑等脑区DNA的损伤作用。

人类GABARAPL1基因的染色体定位

目的 确定人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 1基因在染色体上的位置。方法 根据该基因cDNA的 3′非翻译区序列设计一对RH定位引物 ,以人 /鼠体细胞辐射杂种板Genebridge 4(GB4) panel试剂盒中的杂种细胞株基因组DNA为模板 ,进行PCR扩增 ,经琼脂糖凝胶电泳检测后 ,按Sanger网站的RH定位分析系统进行统计学分析。结果 PCR法在一些杂种细胞株中扩增出特异的目的片段 ,经测序验证了该序列的准确性。通过Sanger网站统计分析表明 ,该基因与 12号染色体上的AFM 0 2 6tb5 (D12S77) ,AFM32 0xb5 (D12S35 8) ,AFM 2 0 5xg3(D12S310 ) ,AFM2 17xa7(D12S99) ,AFM 2 34wb6 (D12S16 6 4)位标紧密连锁 ,且LOD值均大于 3。经该染色体区带的物理图、遗传图及细胞图谱整合分析 ,将该基因定位在染色体 12 p12 .3区带的D12S77和D12S35 8位标之间。 结论 放射杂交定位法是一种新颖便捷的基因定位方法 ,通过此法成功地进行了人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 1基因的染色体定位。

人类GABARAPL2基因的染色体定位

为了确定人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2基因在染色体上的位置 ,根据该基因cDNA的 3′非翻译区序列设计一对RH定位引物 ,以人 /鼠体细胞辐射杂种板Genebridge4(GB4) panel和G3 panel试剂盒中的杂种细胞株基因组DNA为模板 ,在一定的条件下进行PCR扩增 ,琼脂糖凝胶电泳结果分别输入Sanger和Stanford网站的RH定位分析系统进行统计学分析。结果PCR法在一些杂种细胞株中扩增出特异的目的片段 ,并经测序验证了其准确性。凝胶电泳结果在Sanger网站统计分析表明该基因与 16号染色体上的AFM 3 4 0 ye5 ,AFM 2 92xh5 ,AFM 3 2 0wf1,AFMa0 66xd5 ,AFM 2 49xc5位标紧密连锁 ;在Stanford网站统计分析表明该基因与 16号染色体上的SHGC— 14 5 7,SHGC— 5 3 4 15 ,SHGC— 6782 ,SHGC— 2 2 2 8,SHGC— 14 62 9位标紧密连锁 ,LOD值均大于 3。整合分析该染色体区带的物理图、遗传图及细胞图谱后 ,最终将基因定位在染色体 16q2 2 .3区带的D16s3 0 16和D16s5 15位标之间。结论放射杂交定位法是一种新颖便捷的基因定位的方法 ,通过此法成功地进行了人类GABAA 受体相关蛋白相似蛋白 2基因的定位。