解偶联蛋白2对皮肤黑色素瘤预后和免疫微环境的影响

目的:探讨解偶联蛋白2(UCP2)在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的预后价值,分析UCP2表达与SKCM肿瘤浸润免疫细胞(TIC)之间的相关性。方法:通过GEPIA在线数据库分析SKCM组织及正常皮肤组织中UCP的差异性表达,探讨UCP表达与SKCM预后之间的关系。HPA数据库分析UCP2在正常皮肤单细胞中的表达情况,使用TISCH分析UCP2在SKCM中单细胞水平的表达情况。TIMER分析UCP2表达与总SKCM、原发性SKCM和转移性SKCM患者肿瘤微环境(TME)中主要免疫细胞及其标志物的相关性。结果:UCP2在SKCM癌组织中高表达,UCP2高表达患者的OS和DFS均长于低表达患者(均P<0.05)。正常皮肤和SKCM单细胞分析显示,UCP2表达与免疫细胞亚群存在一定的正相关,同时与SKCM中趋化因子、受体、组织相容性复合物、免疫抑制剂和免疫激活剂五类免疫途径密切相关(均P<0.05)。亚组分析结果显示,UCP2高表达与总SKCM和转移性SKCM患者高OS密切相关(均P<0.05)。UCP2表达与总SKCM、原发性SKCM、转移性SKCM患者TME中TIC之间存在明显的正相关(均P<0.05),但是与原发性SKCM相关性相对较弱。UCP2表达水平与3组SKCM患者TME中免疫细胞标志物存在明显的正相关(均P<0.05)。结论:UCP2在SKCM组织中高表达,UCP2与SKCM中TIC呈正相关,是TME中重要的调控因子,与其预后密切相关。

整合多数据库分析NFKBIA在SKCM预后和免疫浸润中的价值

目的:探讨核因子κB抑制因子a(NFKBIA)表达与皮肤黑色素瘤(SKCM)患者预后及其与肿瘤微环境免疫浸润的相关性。方法:利用GEPIA2数据库分析正常皮肤和SKCM组织中NFKBIA的表达差异,GEPIA2和Ualcan数据库分析NFKBIA与SKCM预后关系,TIMER和TISIDB数据库分析NFKBIA与SKCM中TIL和免疫调节基因的关系。选用TISCH和CancerSEA数据库从单细胞水平分析NFKBIA与SKCM细胞亚群及其相关的功能状态关联性。选取湖北省荆门市第二人民医院保存的14例SKCM患者的石蜡组织标本,通过免疫组织化学染色法验证SKCM组织和癌旁组织中NFKBIA蛋白的表达水平。结果:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,并且低表达的SKCM患者预后差(P<0.05)。NFKBIA表达与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和DC浸润水平呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA表达与SKCM中TIL丰度和免疫调节基因呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA在SKCM单细胞免疫细胞中表达,且与肿瘤微环境中细胞分化和炎症呈正相关关系(R=0.28、0.23,均P<0.05)。免疫组织化学染色结果证实,NFKBIA蛋白在SKCM组织中阳性表达率显著低于癌旁组织(35.71%vs 85.71%,P<0.05)。结论:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,与SKCM免疫细胞浸润相关,可作为SKCM预后的标志物及治疗靶点。

构建基于自噬相关lncRNAs皮肤黑色素瘤预后模型

目的:构建预测皮肤黑色素瘤(SKCM)预后的自噬相关长链非编码RNA(lncRNAs)风险模型,寻找与SKCM预后相关的新的生物学标志物。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获得SKCM的lncRNAs的表达谱,以构建自噬基因与lncRNAs共表达网络。Lasso回归和多因素Cox回归寻找与自噬相关lncRNAs。根据自噬相关lncRNAs建立风险评分,并使用Cox回归检验其是否为独立的预后因素。利用GO和KEGG分析自噬相关lncRNAs的功能富集。结果:SKCM中鉴定出有11个自噬相关lncRNAs,其中7个(USP30⁃AS1、HCP5、WAC⁃AS1、EBLN3P、AL162171.1、LINC00339、THCAT158)是保护性因素,4个(LINC00518、AC009570.1、AC009495.2、LINC00665)是危险因素。根据风险评分Kaplan⁃Meier生存分析发现,高风险组SKCM预后明显差于低风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。Cox回归提示风险评分(HR=1.333,95%CI:1.214~1.465,P<0.001)是影响SKCM患者预后的独立危险因素。风险评分在预测SKCM患者10年生存率的ROC曲线下面积分别为0.799。功能分析显示11个自噬相关lncRNAs主要与细胞分裂以及机体细胞的免疫相关,而且肿瘤发生、发展和复发转移的相关信号通路也出现富集情况。结论:基于11个自噬相关lncRNAs构建风险评分以及预后模型对SKCM预后具有一定的预测价值,为SKCM靶向治疗提供治疗靶点和参考。