甲状腺乳头状癌预后不良相关基因的生物信息学分析

目的通过甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)生物信息学分析,获取与PTC预后显著相关的基因,为PTC的发病机制提供理论依据。方法从NCBI的GEO Databases数据库检索PTC的芯片数据GSE3678、GSE33630和GSE82208,三组基因芯片共包含94例PTC及77例癌旁组织基因表达谱。使用GEO2R工具分析PTC与癌旁组织差异表达的基因;将共表达的基因导入可视化数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因富集分析(gene ontology,GO)和信号通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG);使用STRING和Cytoscape进行蛋白质互作网络分析(protein-protein interaction,PPI);使用GEPIA分析核心基因的生存信息。随后培养PTC细胞株,收集52例临床组织样本,分别验证FN1在PTC组织样本和细胞中的表达情况。结果 GSE3678、GSE33630和GSE82208共有152个共表达基因,其中24个上调表达,128个下调表达。这152个异常表达基因(different expression genes,DEGs)在PTC细胞组分、分子功能、生物学行为上主要集中于影响细胞正常分化及富集于甲状腺激素合成信号通路等。PPI显示,基因AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN、EDN、IRS1、SPP1相互之间紧密相关。进一步的生存分析显示,AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN与无病生存时间相关,但总体生存时间无差异。FN1在31例(59.61%)PTC组织中呈上调表达,平均表达倍数变化为(3.75±5.90)倍。与Nthy-ori 3-1细胞相比,BCPAP和TPC-1中FN1的表达水平分别提高了(4.75±1.12)倍、(11.89±3.53)倍(P<0.01)。结论 AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN在PTC中异常表达且预示着较差的临床预后;FN1基因在PTC组织和细胞株中表达增高。

甲状腺乳头状癌右侧喉返神经深层淋巴结转移率及影响因素

目的:探讨甲状腺乳头状癌(PTC)右侧喉返神经深层淋巴结(Ⅵb区)转移率及其影响因素。方法:收集我院2017年7月至2019年6月136例PTC患者的临床资料,分析Ⅵb区转移率及影响因素。结果:136例中,浅层淋巴结(Ⅵa区)转移96例(70.59%),Ⅵb区转移31例(22.79%)。清扫方式、病灶直径、Ⅵa区淋巴结转移、包膜侵犯与PTCⅥb区转移有关(P<0.05或P<0.01)。结论:右侧或双侧PTC患者应当行完整、彻底中央区淋巴结清扫,包括Ⅵb区清扫。