小鼠垂体瘤细胞冷暴露后蛋白质甲基化修饰分析

目的:研究小鼠垂体瘤细胞(mouse pituitary tumor cell, AtT20)冷暴露后蛋白质甲基化的变化,以及高效富集和大规模鉴定AtT20细胞的甲基化肽。方法:使用胰蛋白酶和肽N-糖苷酶F(peptide N-glycosidase F,PNGase F)消化蛋白质,利用亲水相互作用色谱(hydrophilic interaction liquid chromatography, HILIC)尖端富集甲基化肽,最后利用质谱法对甲基化肽进行整体分析;通过PhosphoSitePlus?数据库比对新的甲基化位点和蛋白,利用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后对两组细胞所得的甲基化肽和甲基化位点进行差异分析。结果:共鉴定到55个甲基化蛋白和83个甲基化位点,其中78.3%的甲基化位点是未被报道过的;鉴定到的甲基化蛋白主要分布在核染色体、核小体和细胞核中,参与了基因沉默的调控、RNA剪接和mRNA加工等生物过程;KEGG通路富集表明这些蛋白与中性粒细胞胞外陷阱形成、酒精中毒和系统性红斑狼疮等相关。甲基化肽和甲基化位点差异分析显示有7条显著变化的甲基化肽和2个显著变化的位点。结论:AtT20细胞短期冷暴露后蛋白质甲基化变化不显著,首次对AtT20细胞进行全面甲基化蛋白质鉴定,发现了多个未被报道过的甲基化蛋白质和甲基化位点,以期为AtT20细胞的研究提供理论参考。