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采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱
被引量:
4
1
作者
张学军
杨文莉
+5 位作者
张永兵
张健
郭丽霞
杨永
李寐华
伊鸿平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1828-1838,共11页
【目的】构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F 2分离群体。构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基...
【目的】构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F 2分离群体。构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基因型分型,SAM TOOLS软件检测SNP位点,采用Joinmap 4.0软件进行排图,用perl SVG模块绘制连锁图,用win QTL cart 2.5进行QTL检验,根据复合区间作图法,使用R/qtl软件包进行QTL定位。【结果】构建了总长为4823.55 cM的遗传图谱,标记间平均遗传距离为1.43 cM。在苗期、生长中期和生长后期共检测到26个与甜瓜霜霉病性状相关的QTL。【结论】基于GBS-seq技术获得了甜瓜高密度遗传图谱,最终将抗霜霉病基因关联到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227~7,830,935 bp,约1Mb的区间范围内。
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关键词
甜瓜
GBS
遗传图谱
霜霉病
QTL
下载PDF
职称材料
甜瓜霜霉病苗期抗病性鉴定方法建立及种质资源评价
被引量:
2
2
作者
张学军
郭丽霞
+3 位作者
张健
杨永
李寐华
伊鸿平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期899-909,共11页
【目的】研究甜瓜霜霉病苗期人工接种鉴定的最佳方法,并对甜瓜资源进行苗期接种鉴定,为抗病育种提供抗源。【方法】采用不同接种方法,不同接种苗龄,不同接种浓度三因素三水平正交试验设计,建立甜瓜霜霉病苗期抗性鉴定方法,并对208份新...
【目的】研究甜瓜霜霉病苗期人工接种鉴定的最佳方法,并对甜瓜资源进行苗期接种鉴定,为抗病育种提供抗源。【方法】采用不同接种方法,不同接种苗龄,不同接种浓度三因素三水平正交试验设计,建立甜瓜霜霉病苗期抗性鉴定方法,并对208份新疆哈密瓜资源和国内引进甜瓜资源进行霜霉病抗病性评价。【结果】甜瓜苗期接种霜霉病最好的方法是喷雾法,接种苗龄为2叶期,接种的最适浓度为5×10^3孢子/mL;筛选出免疫甜瓜霜霉病资源5份,高抗资源7份,中抗资源6份。【结论】甜瓜苗期接种霜霉病方法的确立以及抗霜霉病资源筛选为抗病育种奠定了基础。
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关键词
甜瓜
种质资源
霜霉病
抗性鉴定
下载PDF
职称材料
题名
采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱
被引量:
4
1
作者
张学军
杨文莉
张永兵
张健
郭丽霞
杨永
李寐华
伊鸿平
机构
新疆农业科学院哈密瓜研究中心
衢州新农都院士工作站
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1828-1838,共11页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2015211A027)~~
文摘
【目的】构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F 2分离群体。构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基因型分型,SAM TOOLS软件检测SNP位点,采用Joinmap 4.0软件进行排图,用perl SVG模块绘制连锁图,用win QTL cart 2.5进行QTL检验,根据复合区间作图法,使用R/qtl软件包进行QTL定位。【结果】构建了总长为4823.55 cM的遗传图谱,标记间平均遗传距离为1.43 cM。在苗期、生长中期和生长后期共检测到26个与甜瓜霜霉病性状相关的QTL。【结论】基于GBS-seq技术获得了甜瓜高密度遗传图谱,最终将抗霜霉病基因关联到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227~7,830,935 bp,约1Mb的区间范围内。
关键词
甜瓜
GBS
遗传图谱
霜霉病
QTL
Keywords
Cucumis melo ssp.melo
GBS
High density genetic map
downy mildew
QTL
分类号
S65 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
甜瓜霜霉病苗期抗病性鉴定方法建立及种质资源评价
被引量:
2
2
作者
张学军
郭丽霞
张健
杨永
李寐华
伊鸿平
机构
新疆农业科学院哈密瓜研究中心
衢州新农都院士工作站
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期899-909,共11页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2015211A027)~~
文摘
【目的】研究甜瓜霜霉病苗期人工接种鉴定的最佳方法,并对甜瓜资源进行苗期接种鉴定,为抗病育种提供抗源。【方法】采用不同接种方法,不同接种苗龄,不同接种浓度三因素三水平正交试验设计,建立甜瓜霜霉病苗期抗性鉴定方法,并对208份新疆哈密瓜资源和国内引进甜瓜资源进行霜霉病抗病性评价。【结果】甜瓜苗期接种霜霉病最好的方法是喷雾法,接种苗龄为2叶期,接种的最适浓度为5×10^3孢子/mL;筛选出免疫甜瓜霜霉病资源5份,高抗资源7份,中抗资源6份。【结论】甜瓜苗期接种霜霉病方法的确立以及抗霜霉病资源筛选为抗病育种奠定了基础。
关键词
甜瓜
种质资源
霜霉病
抗性鉴定
Keywords
cucumis melo ssp.melo
germplasm resources
downy mildew
resistance identification
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱
张学军
杨文莉
张永兵
张健
郭丽霞
杨永
李寐华
伊鸿平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
2
甜瓜霜霉病苗期抗病性鉴定方法建立及种质资源评价
张学军
郭丽霞
张健
杨永
李寐华
伊鸿平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
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