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α-葡萄糖苷酶与米格列醇相互作用及其进化关系
被引量:
2
1
作者
齐燕姣
陆会宁
+1 位作者
金能智
赵娅敏
《生物信息学》
2015年第3期141-149,共9页
用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭...
用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭窄的结合口袋中,其间的相互作用主要以静电相互作用、氢键和范德华力为主。由于米格列醇的强水溶性和多羟基的特点,与酸性的天冬氨酸之间形成多个Ο-Η氢键,对甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制作用。通过TMHMM预测甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶的序列,结果未发现跨膜区。通过多序列比对发现,在米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶相互作用位点处的氨基酸中,在与其亲缘关系较近的5个物种茶(Camellia sinensis),黄瓜(Cucumis sativus),木本棉(Gossypium arboretum),甘庶属割手密(Spontaneum)和蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)中有81.82%的氨基酸都是保守的,且主要是极性的氨基酸,如色氨酸和天冬氨酸。这为进一步研究降血糖药物在其他物种中的表现及相互作用提供了重要的科学依据。
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关键词
Α-葡萄糖苷酶
相互作用
序列比对
系统发育关系
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职称材料
血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系
被引量:
2
2
作者
齐燕姣
陆会宁
金能智
《生物信息学》
2017年第1期59-68,共10页
莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位...
莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明,莪术醇与人血清白蛋白相互作用的结合位点II和III处周围几乎都是疏水性的氨基酸,分子间的疏水作用起着很重要的作用,其最低结合能分别是-7.22 Kcal/mol和-8.34 Kcal/mol。莪术醇与人血清白蛋白之间的作用位点在其他亲缘关系较近的狼(Canis lupus)、绵羊(Ovine)、牦牛(Bos mutus)、家牛(Bos Taurus)物种中都较为保守,少数有变化的氨基酸基本是在极性相同的氨基酸之间发生的。与分子相互作用前的结构相比,莪术醇中的羟基的结构在活性位点处发生了最明显的变化。
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关键词
莪术醇
血清白蛋白
相互作用
序列比对
亲缘关系
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职称材料
森林病虫害可持续控灾与治理
被引量:
12
3
作者
李占虎
《农家之友》
2010年第8期50-,54,共2页
近年来林业发展势头迅猛,危险性病虫害的多发,致使中国林科院、农大及林业部门森林病虫害防治方面的专家日前共同建议,应未雨绸缪,在全面考虑生态平衡、社会安全、防治效果以及经济效益的前提下,科学防治林业森林病虫害,确保绿色发展战...
近年来林业发展势头迅猛,危险性病虫害的多发,致使中国林科院、农大及林业部门森林病虫害防治方面的专家日前共同建议,应未雨绸缪,在全面考虑生态平衡、社会安全、防治效果以及经济效益的前提下,科学防治林业森林病虫害,确保绿色发展战略顺利推进。
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关键词
病虫害
森林
林业
措施
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职称材料
A型流感病毒H7N9株PB1和PB2基因的克隆和真核表达
被引量:
1
4
作者
薛宇佳
杜江龙
+6 位作者
王晨
万雪梅
杨学财
王峰
贾骁晔
冉乾东
曹欣
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1448-1451,共4页
【目的】本试验旨在构建A型H7N9流感病毒RNA聚合酶类蛋白PB1和PB2真核表达载体,并在293T细胞中表达其编码的蛋白。【方法】首先提取苏州分离株A型H7N9流感病毒的总RNA,通过RT-PCR技术获得了A型H7N9流感病毒PB1和PB2的全长基因,然后将其...
【目的】本试验旨在构建A型H7N9流感病毒RNA聚合酶类蛋白PB1和PB2真核表达载体,并在293T细胞中表达其编码的蛋白。【方法】首先提取苏州分离株A型H7N9流感病毒的总RNA,通过RT-PCR技术获得了A型H7N9流感病毒PB1和PB2的全长基因,然后将其克隆至真核表达载体pRK中构建pRK-Flag-PB1/PB2真核重组表达载体,经酶切及测序鉴定正确后将质粒转染到293T细胞中,通过Western blot鉴定PB1/PB2蛋白的表达。【结果】成功克隆了PB1和PB2全长基因,构建了A型H7N9流感病毒PB1和PB2蛋白真核表达载体pRK-Flag-PB1/PB2,并在293T细胞中转染表达,Western blot确定了PB1/PB2蛋白的成功表达。【结论】该表达载体的成功构建及在293T细胞中成功表达PB1和PB2蛋白,为后期开展流感病毒蛋白功能及与真核细胞中的蛋白相互作用的研究奠定了基础。
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关键词
A型流感病毒
PB1基因
PB2基因
克隆
真核表达
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职称材料
犬类感染细小病毒后的治疗
5
作者
李占虎
《今日财富》
2010年第4期203-203,共1页
结合实践,论述了犬类感染细小病毒后如何治疗.
关键词
病毒
治疗
病犬
原文传递
互花米草盐碱地种植基因适应试验
6
作者
傅力腾
《才智》
2008年第2期144-144,共1页
采用互花米草根中克隆了受盐胁迫诱导的DNA片段,进行盐碱地种植适应试验,培育成功耐盐碱的农作物,并分析了基因表达的差异。
关键词
互花米草
盐碱地
基因
原文传递
题名
α-葡萄糖苷酶与米格列醇相互作用及其进化关系
被引量:
2
1
作者
齐燕姣
陆会宁
金能智
赵娅敏
机构
西北民族大学
榆
中校
区
化工
学院
西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院
甘肃省计算中心
出处
《生物信息学》
2015年第3期141-149,共9页
基金
国家民委科研项目(14XBZ021)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(NO.31920130035)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(zyz2011064)
文摘
用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭窄的结合口袋中,其间的相互作用主要以静电相互作用、氢键和范德华力为主。由于米格列醇的强水溶性和多羟基的特点,与酸性的天冬氨酸之间形成多个Ο-Η氢键,对甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制作用。通过TMHMM预测甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶的序列,结果未发现跨膜区。通过多序列比对发现,在米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶相互作用位点处的氨基酸中,在与其亲缘关系较近的5个物种茶(Camellia sinensis),黄瓜(Cucumis sativus),木本棉(Gossypium arboretum),甘庶属割手密(Spontaneum)和蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)中有81.82%的氨基酸都是保守的,且主要是极性的氨基酸,如色氨酸和天冬氨酸。这为进一步研究降血糖药物在其他物种中的表现及相互作用提供了重要的科学依据。
关键词
Α-葡萄糖苷酶
相互作用
序列比对
系统发育关系
Keywords
α-glucosidase
Interaction
Sequence alignment
Phylogenetic relationships
分类号
TP925.4 [自动化与计算机技术]
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职称材料
题名
血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系
被引量:
2
2
作者
齐燕姣
陆会宁
金能智
机构
西北民族大学
榆
中校
区
化工
学院
西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院
甘肃省计算中心
出处
《生物信息学》
2017年第1期59-68,共10页
基金
国家民委科研项目(No.14XBZ021)
文摘
莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明,莪术醇与人血清白蛋白相互作用的结合位点II和III处周围几乎都是疏水性的氨基酸,分子间的疏水作用起着很重要的作用,其最低结合能分别是-7.22 Kcal/mol和-8.34 Kcal/mol。莪术醇与人血清白蛋白之间的作用位点在其他亲缘关系较近的狼(Canis lupus)、绵羊(Ovine)、牦牛(Bos mutus)、家牛(Bos Taurus)物种中都较为保守,少数有变化的氨基酸基本是在极性相同的氨基酸之间发生的。与分子相互作用前的结构相比,莪术醇中的羟基的结构在活性位点处发生了最明显的变化。
关键词
莪术醇
血清白蛋白
相互作用
序列比对
亲缘关系
Keywords
Curcumol
Serum albumin
Interaction
Sequence alignment
Phylogenetic relationships
分类号
R730.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
森林病虫害可持续控灾与治理
被引量:
12
3
作者
李占虎
机构
甘肃省兰州市
西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院
出处
《农家之友》
2010年第8期50-,54,共2页
文摘
近年来林业发展势头迅猛,危险性病虫害的多发,致使中国林科院、农大及林业部门森林病虫害防治方面的专家日前共同建议,应未雨绸缪,在全面考虑生态平衡、社会安全、防治效果以及经济效益的前提下,科学防治林业森林病虫害,确保绿色发展战略顺利推进。
关键词
病虫害
森林
林业
措施
分类号
S763 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
A型流感病毒H7N9株PB1和PB2基因的克隆和真核表达
被引量:
1
4
作者
薛宇佳
杜江龙
王晨
万雪梅
杨学财
王峰
贾骁晔
冉乾东
曹欣
机构
西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1448-1451,共4页
基金
西北民族大学研究生科研(实践)创新项目(Yxm201 8136)
Zbtb1基因调控小鼠造血干细胞向淋巴细胞分化的机制研究(17JR5RA277)
+1 种基金
PLZF基因影响先天样T淋巴细胞胸腺滞留的功能和机制研究(31700763)
Zbtb1基因在T细胞发育过程中调控IL-7Rα表达的功能和机制研究(81760287)
文摘
【目的】本试验旨在构建A型H7N9流感病毒RNA聚合酶类蛋白PB1和PB2真核表达载体,并在293T细胞中表达其编码的蛋白。【方法】首先提取苏州分离株A型H7N9流感病毒的总RNA,通过RT-PCR技术获得了A型H7N9流感病毒PB1和PB2的全长基因,然后将其克隆至真核表达载体pRK中构建pRK-Flag-PB1/PB2真核重组表达载体,经酶切及测序鉴定正确后将质粒转染到293T细胞中,通过Western blot鉴定PB1/PB2蛋白的表达。【结果】成功克隆了PB1和PB2全长基因,构建了A型H7N9流感病毒PB1和PB2蛋白真核表达载体pRK-Flag-PB1/PB2,并在293T细胞中转染表达,Western blot确定了PB1/PB2蛋白的成功表达。【结论】该表达载体的成功构建及在293T细胞中成功表达PB1和PB2蛋白,为后期开展流感病毒蛋白功能及与真核细胞中的蛋白相互作用的研究奠定了基础。
关键词
A型流感病毒
PB1基因
PB2基因
克隆
真核表达
Keywords
Influenza A virus
PB1 gene
PB2 gene
Clone
Eukaryotic expression
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
犬类感染细小病毒后的治疗
5
作者
李占虎
机构
西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院
出处
《今日财富》
2010年第4期203-203,共1页
文摘
结合实践,论述了犬类感染细小病毒后如何治疗.
关键词
病毒
治疗
病犬
分类号
Q939.47 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
互花米草盐碱地种植基因适应试验
6
作者
傅力腾
机构
西北民族大学
榆
中校
区
出处
《才智》
2008年第2期144-144,共1页
文摘
采用互花米草根中克隆了受盐胁迫诱导的DNA片段,进行盐碱地种植适应试验,培育成功耐盐碱的农作物,并分析了基因表达的差异。
关键词
互花米草
盐碱地
基因
分类号
S156.4 [农业科学—土壤学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
α-葡萄糖苷酶与米格列醇相互作用及其进化关系
齐燕姣
陆会宁
金能智
赵娅敏
《生物信息学》
2015
2
下载PDF
职称材料
2
血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系
齐燕姣
陆会宁
金能智
《生物信息学》
2017
2
下载PDF
职称材料
3
森林病虫害可持续控灾与治理
李占虎
《农家之友》
2010
12
下载PDF
职称材料
4
A型流感病毒H7N9株PB1和PB2基因的克隆和真核表达
薛宇佳
杜江龙
王晨
万雪梅
杨学财
王峰
贾骁晔
冉乾东
曹欣
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2019
1
下载PDF
职称材料
5
犬类感染细小病毒后的治疗
李占虎
《今日财富》
2010
0
原文传递
6
互花米草盐碱地种植基因适应试验
傅力腾
《才智》
2008
0
原文传递
已选择
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