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鲫鱼类志贺邻单胞菌的鉴定及其致病机制研究
被引量:
4
1
作者
傅芳
谈永萍
+1 位作者
王利
张桦
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1215-1220,1243,共7页
为了鉴定从患病鲫鱼体内分离的F01菌株并探究其致病性,本研究经形态学观察、16S rDNA基因分析鉴定F01菌株,并进行药敏试验,采用动物回归试验及病理组织学观察研究其对鲫鱼的致病性,同时检测感染鲫鱼的血清学指标及免疫因子表达。结果显...
为了鉴定从患病鲫鱼体内分离的F01菌株并探究其致病性,本研究经形态学观察、16S rDNA基因分析鉴定F01菌株,并进行药敏试验,采用动物回归试验及病理组织学观察研究其对鲫鱼的致病性,同时检测感染鲫鱼的血清学指标及免疫因子表达。结果显示:F01菌株经16S rDNA基因序列比对与类志贺邻单胞菌的同源性达99%,确定该菌株为类志贺邻单胞菌,其对鲫鱼的半数致死量LD50为2.09×107 cfu/mL,且动物回归实验结果显示从人工感染鲫鱼分离出的细菌与患病鲫鱼一致。耐药性检测结果显示,该菌株对头孢曲松、头孢呋辛、氧氟沙星等敏感,对哌拉西林、克林霉素、多西环素等耐药。病理组织学观察显示,感染鲫鱼的肝、肾等组织充血、肿胀、变性坏死。血清学检测结果显示,与对照组比较,感染组鲫鱼血清AKP、LZM均活性上升、MDA活力均下降(p<0.05);免疫因子检测结果显示,感染10 d后鲫鱼脾脏中HSP70、IL-8、TLR22基因的转录水平显著高于正常对照组(p<0.05)。本研究通过对F01菌株的致病性等研究,为深入研究类志贺邻单胞菌的疫病防治提供科学参考。
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关键词
类志贺邻单胞菌
药敏试验
病理组织学
血清学指标
免疫因子
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职称材料
藏鸡肌肉组织中3条新发现miRNA序列的克隆及靶基因预测
被引量:
3
2
作者
李志雄
徐亚欧
林亚秋
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2018年第5期450-454,共5页
旨在克隆藏鸡不同发育阶段肌肉组织中新发现的差异表达的3条miRNA(miR-13_529,miR-20_1207,miR-24_1302)序列,并对它们的靶基因进行预测,为3条miRNA序列功能的研究奠定基础.随机选择150日龄健康藏鸡,屠宰并采集藏鸡肌肉组织,提取组织总R...
旨在克隆藏鸡不同发育阶段肌肉组织中新发现的差异表达的3条miRNA(miR-13_529,miR-20_1207,miR-24_1302)序列,并对它们的靶基因进行预测,为3条miRNA序列功能的研究奠定基础.随机选择150日龄健康藏鸡,屠宰并采集藏鸡肌肉组织,提取组织总RNA,利用Stem-loop RT-PCR法克隆获得藏鸡3条新发现miRNA序列,利用4个生物信息学预测软件预测3条miRNA序列的靶基因.结果表明,克隆获得miR-13_529序列23bp,miR-20_1207序列21bp,miR-24_1302序列22bp.靶基因预测结果显示,分别能与3条miRNA序列特异性结合的2个、10个和1个靶基因均与肌肉生长发育相关.这些结果表明3条新发现的miRNA序列可能在藏鸡肌肉发育的过程中具有重要的调控作用.
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关键词
藏鸡
肌肉组织
MIRNA
克隆
靶基因
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职称材料
肌肉发育相关基因的可变剪接研究进展
被引量:
1
3
作者
袁茂
江明锋
+2 位作者
徐亚欧
林亚秋
李志雄
《中国家禽》
北大核心
2018年第20期47-51,共5页
可变剪接是生物体内的一个重要机制,它能够利用同一mRNA前体产生不同的mRNA转录本,从而丰富蛋白质组的多样性。肌肉发育是一个复杂的过程,受到多种相关基因的调控。当可变剪接出现在肌肉发育相关基因时,这些基因则会产生不同功能的蛋白...
可变剪接是生物体内的一个重要机制,它能够利用同一mRNA前体产生不同的mRNA转录本,从而丰富蛋白质组的多样性。肌肉发育是一个复杂的过程,受到多种相关基因的调控。当可变剪接出现在肌肉发育相关基因时,这些基因则会产生不同功能的蛋白质。文章对近年来动物肌肉发育相关基因可变剪接的研究情况进行了综述,重点阐述这些基因的不同异构体之间功能的差异情况。
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关键词
肌肉发育
基因
可变剪接
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职称材料
PCR-膜芯片技术在牦牛及犏牛肉制品的真假鉴定中的应用
被引量:
3
4
作者
赵睿骁
韩斐
+4 位作者
江明锋
曾莲
韩嘉钰
黄盈
周航
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期202-208,共7页
旨在利用PCR-膜芯片技术快速高效的鉴定牦牛及犏牛肉制品的真假。采集样品(猪、山羊、黄牛、水牛、牦牛、鸡、鸭、兔、狗、真犏牛、假犏牛肉样各8个,19个肉干制品样品),提取并纯化DNA,利用11对特异性引物进行多重PCR,将扩增产物与含有1...
旨在利用PCR-膜芯片技术快速高效的鉴定牦牛及犏牛肉制品的真假。采集样品(猪、山羊、黄牛、水牛、牦牛、鸡、鸭、兔、狗、真犏牛、假犏牛肉样各8个,19个肉干制品样品),提取并纯化DNA,利用11对特异性引物进行多重PCR,将扩增产物与含有12个探针的膜芯片反向点杂交,测试膜芯片的准确度及灵敏度,并鉴定市场上销售的牦牛肉制品真假。结果表明,膜芯片准确度高,特异性强,无交叉反应,灵敏度能达到0.1 ng,检测灵敏度高。通过鉴定市场上销售的假牦牛肉干制品几乎都以黄牛和水牛肉为原料制作。应用PCR-膜芯片技术可快速准确的鉴定出牦牛肉制品的真假,有利于打击假冒产品,维护市场平衡。
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关键词
牦牛
犏牛
多重PCR
膜芯片
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职称材料
藏鸡CCL4基因克隆及组织表达谱研究
5
作者
袁茂
江明锋
+2 位作者
徐亚欧
林亚秋
李志雄
《中国家禽》
北大核心
2019年第15期12-17,共6页
为探究C-C基序趋化因子配体4(C-C motif chemokine ligand 4,CCL4)基因特点及其在藏鸡各组织中表达水平差异情况。以藏鸡作为研究对象,使用RT-PCR技术克隆藏鸡CCL4基因并进行生物信息学分析,然后利用qPCR技术检测CCL4在藏鸡不同日龄不...
为探究C-C基序趋化因子配体4(C-C motif chemokine ligand 4,CCL4)基因特点及其在藏鸡各组织中表达水平差异情况。以藏鸡作为研究对象,使用RT-PCR技术克隆藏鸡CCL4基因并进行生物信息学分析,然后利用qPCR技术检测CCL4在藏鸡不同日龄不同组织中的表达情况并构建组织表达谱。结果表明:藏鸡CCL4基因长度为633 bp,其中开放阅读框长270 bp,编码89个氨基酸;藏鸡CCL4基因的核苷酸和氨基酸序列与原鸡同源性为100%;CCL4基因在藏鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和腿肌中均有表达,在脾脏中表达量相对较高。该研究为进一步了解CCL4基因的功能和藏鸡的免疫特性提供理论依据。
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关键词
藏鸡
CCL4
免疫
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职称材料
藏鸡与白羽肉鸡垂体转录组差异表达研究
6
作者
王宏玲
王英明
+3 位作者
梁城
唐慧
李志雄
吴锦波
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第6期1939-1947,共9页
试验旨在通过对藏鸡和白羽肉鸡垂体转录组测序和生物信息学分析,筛选出与鸡生长发育相关的差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)及信号通路。本研究选用42日龄健康藏鸡和白羽肉鸡各3只,分别采集垂体组织利用Illumina HiS...
试验旨在通过对藏鸡和白羽肉鸡垂体转录组测序和生物信息学分析,筛选出与鸡生长发育相关的差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)及信号通路。本研究选用42日龄健康藏鸡和白羽肉鸡各3只,分别采集垂体组织利用Illumina HiSeq 2000平台进行转录组mRNA测序,对筛选到的DEGs筛选DEGs,GO和KEGG数据库功能注释和富集分析,实时荧光定量PCR验证随机挑选的DEGs表达水平。结果显示,藏鸡和白羽肉鸡分别获得126094302和125666442条clean reads。与白羽肉鸡相比,藏鸡垂体组织中共有DEGs 392个,其中196个为上调基因,196个为下调基因(P<0.05),其中包括生长激素(GH)基因、生长激素释放激素受体(GHRHR)基因和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)基因。GO和KEGG富集分析发现,DEGs显著富集于细胞黏附分子信号通路和神经活性配体-受体相互作用信号通路等细胞通讯相关的信号通路,GH、GHRHR和IGF2BP1基因也显著富集于神经活性配体-受体相互作用信号通路。实时荧光定量PCR结果显示,转录组测序结果准确可靠。综上研究,本研究初步揭示了影响藏鸡和白羽肉鸡生长发育速度差异的关键候选基因和信号通路,为了解鸡垂体组织调节生长发育的分子机制提供了理论依据。
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关键词
藏鸡
白羽肉鸡
转录组测序
垂体
生长发育
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职称材料
题名
鲫鱼类志贺邻单胞菌的鉴定及其致病机制研究
被引量:
4
1
作者
傅芳
谈永萍
王利
张桦
机构
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
西南
民族大学
生命科学与技术学院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1215-1220,1243,共7页
基金
四川省科技支撑项目(2016NZ0044)。
文摘
为了鉴定从患病鲫鱼体内分离的F01菌株并探究其致病性,本研究经形态学观察、16S rDNA基因分析鉴定F01菌株,并进行药敏试验,采用动物回归试验及病理组织学观察研究其对鲫鱼的致病性,同时检测感染鲫鱼的血清学指标及免疫因子表达。结果显示:F01菌株经16S rDNA基因序列比对与类志贺邻单胞菌的同源性达99%,确定该菌株为类志贺邻单胞菌,其对鲫鱼的半数致死量LD50为2.09×107 cfu/mL,且动物回归实验结果显示从人工感染鲫鱼分离出的细菌与患病鲫鱼一致。耐药性检测结果显示,该菌株对头孢曲松、头孢呋辛、氧氟沙星等敏感,对哌拉西林、克林霉素、多西环素等耐药。病理组织学观察显示,感染鲫鱼的肝、肾等组织充血、肿胀、变性坏死。血清学检测结果显示,与对照组比较,感染组鲫鱼血清AKP、LZM均活性上升、MDA活力均下降(p<0.05);免疫因子检测结果显示,感染10 d后鲫鱼脾脏中HSP70、IL-8、TLR22基因的转录水平显著高于正常对照组(p<0.05)。本研究通过对F01菌株的致病性等研究,为深入研究类志贺邻单胞菌的疫病防治提供科学参考。
关键词
类志贺邻单胞菌
药敏试验
病理组织学
血清学指标
免疫因子
Keywords
Plesiomonas shigelloides
drug sensitivity test
histopathology
serological index
immune factor
分类号
S942.2 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
藏鸡肌肉组织中3条新发现miRNA序列的克隆及靶基因预测
被引量:
3
2
作者
李志雄
徐亚欧
林亚秋
机构
西南
民族大学
生命科学与技术学院
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
出处
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2018年第5期450-454,共5页
基金
四川省"十三五"畜禽育种攻关项目(2016NYZ0043)
四川省应用基础项目(2016JY0068)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2018NQN10)
文摘
旨在克隆藏鸡不同发育阶段肌肉组织中新发现的差异表达的3条miRNA(miR-13_529,miR-20_1207,miR-24_1302)序列,并对它们的靶基因进行预测,为3条miRNA序列功能的研究奠定基础.随机选择150日龄健康藏鸡,屠宰并采集藏鸡肌肉组织,提取组织总RNA,利用Stem-loop RT-PCR法克隆获得藏鸡3条新发现miRNA序列,利用4个生物信息学预测软件预测3条miRNA序列的靶基因.结果表明,克隆获得miR-13_529序列23bp,miR-20_1207序列21bp,miR-24_1302序列22bp.靶基因预测结果显示,分别能与3条miRNA序列特异性结合的2个、10个和1个靶基因均与肌肉生长发育相关.这些结果表明3条新发现的miRNA序列可能在藏鸡肌肉发育的过程中具有重要的调控作用.
关键词
藏鸡
肌肉组织
MIRNA
克隆
靶基因
Keywords
Tibetan chicken
muscle
miRNA
cloning
target gene
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
肌肉发育相关基因的可变剪接研究进展
被引量:
1
3
作者
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
李志雄
机构
西南
民族大学
青藏高原
研究院
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
西南
民族大学
生命科学与技术学院
出处
《中国家禽》
北大核心
2018年第20期47-51,共5页
基金
四川省"十三五"畜禽育种攻关项目(2016NYZ0043)
四川省应用基础项目(2016JY0068)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2018NQN10)
文摘
可变剪接是生物体内的一个重要机制,它能够利用同一mRNA前体产生不同的mRNA转录本,从而丰富蛋白质组的多样性。肌肉发育是一个复杂的过程,受到多种相关基因的调控。当可变剪接出现在肌肉发育相关基因时,这些基因则会产生不同功能的蛋白质。文章对近年来动物肌肉发育相关基因可变剪接的研究情况进行了综述,重点阐述这些基因的不同异构体之间功能的差异情况。
关键词
肌肉发育
基因
可变剪接
Keywords
muscle development
gene
alternative splicing
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
PCR-膜芯片技术在牦牛及犏牛肉制品的真假鉴定中的应用
被引量:
3
4
作者
赵睿骁
韩斐
江明锋
曾莲
韩嘉钰
黄盈
周航
机构
西南
民族大学
青藏高原
研究院
西南
民族大学
生命科学与技术学院
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
四川华汉三创生物科技有限公司
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期202-208,共7页
基金
西南民族大学研究生创新型项目(CX2019SZ83),西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金
国家级项目后期资助项目(2019XMJXPY09)
文摘
旨在利用PCR-膜芯片技术快速高效的鉴定牦牛及犏牛肉制品的真假。采集样品(猪、山羊、黄牛、水牛、牦牛、鸡、鸭、兔、狗、真犏牛、假犏牛肉样各8个,19个肉干制品样品),提取并纯化DNA,利用11对特异性引物进行多重PCR,将扩增产物与含有12个探针的膜芯片反向点杂交,测试膜芯片的准确度及灵敏度,并鉴定市场上销售的牦牛肉制品真假。结果表明,膜芯片准确度高,特异性强,无交叉反应,灵敏度能达到0.1 ng,检测灵敏度高。通过鉴定市场上销售的假牦牛肉干制品几乎都以黄牛和水牛肉为原料制作。应用PCR-膜芯片技术可快速准确的鉴定出牦牛肉制品的真假,有利于打击假冒产品,维护市场平衡。
关键词
牦牛
犏牛
多重PCR
膜芯片
Keywords
yak
yak-cattle
multiplex PCR
membrane chip
分类号
S82 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
藏鸡CCL4基因克隆及组织表达谱研究
5
作者
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
李志雄
机构
西南
民族大学
青藏高原
研究院
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
西南
民族大学
生命科学与技术学院
出处
《中国家禽》
北大核心
2019年第15期12-17,共6页
基金
四川省“十三五”畜禽育种攻关项目(2016NYZ0043)
四川省应用基础项目(2016JY0068)
+1 种基金
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2018NQN10)
四川省教育厅重点项目(17ZA0417)
文摘
为探究C-C基序趋化因子配体4(C-C motif chemokine ligand 4,CCL4)基因特点及其在藏鸡各组织中表达水平差异情况。以藏鸡作为研究对象,使用RT-PCR技术克隆藏鸡CCL4基因并进行生物信息学分析,然后利用qPCR技术检测CCL4在藏鸡不同日龄不同组织中的表达情况并构建组织表达谱。结果表明:藏鸡CCL4基因长度为633 bp,其中开放阅读框长270 bp,编码89个氨基酸;藏鸡CCL4基因的核苷酸和氨基酸序列与原鸡同源性为100%;CCL4基因在藏鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和腿肌中均有表达,在脾脏中表达量相对较高。该研究为进一步了解CCL4基因的功能和藏鸡的免疫特性提供理论依据。
关键词
藏鸡
CCL4
免疫
Keywords
Tibetan chicken
CCL4
immunization
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
藏鸡与白羽肉鸡垂体转录组差异表达研究
6
作者
王宏玲
王英明
梁城
唐慧
李志雄
吴锦波
机构
西南
民族大学
畜牧兽医学院
西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用重点实验室
阿坝藏族羌族自治州州畜牧科学技术研究所
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021年第6期1939-1947,共9页
基金
四川省科技计划项目(2020YFSY0048)
西南民族大学大学生创新训练项目(S201910656153)。
文摘
试验旨在通过对藏鸡和白羽肉鸡垂体转录组测序和生物信息学分析,筛选出与鸡生长发育相关的差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)及信号通路。本研究选用42日龄健康藏鸡和白羽肉鸡各3只,分别采集垂体组织利用Illumina HiSeq 2000平台进行转录组mRNA测序,对筛选到的DEGs筛选DEGs,GO和KEGG数据库功能注释和富集分析,实时荧光定量PCR验证随机挑选的DEGs表达水平。结果显示,藏鸡和白羽肉鸡分别获得126094302和125666442条clean reads。与白羽肉鸡相比,藏鸡垂体组织中共有DEGs 392个,其中196个为上调基因,196个为下调基因(P<0.05),其中包括生长激素(GH)基因、生长激素释放激素受体(GHRHR)基因和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)基因。GO和KEGG富集分析发现,DEGs显著富集于细胞黏附分子信号通路和神经活性配体-受体相互作用信号通路等细胞通讯相关的信号通路,GH、GHRHR和IGF2BP1基因也显著富集于神经活性配体-受体相互作用信号通路。实时荧光定量PCR结果显示,转录组测序结果准确可靠。综上研究,本研究初步揭示了影响藏鸡和白羽肉鸡生长发育速度差异的关键候选基因和信号通路,为了解鸡垂体组织调节生长发育的分子机制提供了理论依据。
关键词
藏鸡
白羽肉鸡
转录组测序
垂体
生长发育
Keywords
Tibetan chicken
White-feathered broiler
transcriptome sequencing
pituitary
growth and development
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲫鱼类志贺邻单胞菌的鉴定及其致病机制研究
傅芳
谈永萍
王利
张桦
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
2
藏鸡肌肉组织中3条新发现miRNA序列的克隆及靶基因预测
李志雄
徐亚欧
林亚秋
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2018
3
下载PDF
职称材料
3
肌肉发育相关基因的可变剪接研究进展
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
李志雄
《中国家禽》
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
4
PCR-膜芯片技术在牦牛及犏牛肉制品的真假鉴定中的应用
赵睿骁
韩斐
江明锋
曾莲
韩嘉钰
黄盈
周航
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
5
藏鸡CCL4基因克隆及组织表达谱研究
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
李志雄
《中国家禽》
北大核心
2019
0
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职称材料
6
藏鸡与白羽肉鸡垂体转录组差异表达研究
王宏玲
王英明
梁城
唐慧
李志雄
吴锦波
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2021
0
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职称材料
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