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题名DCC和GALNT5基因多态性与大骨节病关联研究
被引量:1
- 1
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作者
郭兴
郭雄
张峰
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机构
西安交通大学环境与疾病相关基因教育部重点实验室与卫生部微量元素与地方病重点实验室
西安市雁塔区疾病预防控制中心慢病科
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出处
《国外医学(医学地理分册)》
CAS
2015年第4期252-254,共3页
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基金
国家自然科学基金资助项目(No.81102086)
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文摘
目的探讨DCC基因和GALNT5基因6个单核苷酸多态性(SNP)位点与大骨节病的关系。方法采集KBD患者559例,正常对照467例,抽取外周血并提取DNA。采用Sequenom MassARRAY平台对DCC基因的rs12965947、rs11877840、rs12958987、rs17748898和GALNT5基因的rs16841428和rs6659923位点进行分型,采用PLINK软件进行哈迪-温伯格平衡检验,分析6个SNP与大骨节病的关系。结果 6个SNP位点均符合哈迪-温伯格平衡(P>0.05)。校正年龄后,6个SNP位点在KBD组与对照组的基因型分布无统计学差异(P>0.05)。结论DCC基因的rs12965947、rs11877840、rs12958987、rs17748898和GALNT5基因的rs16841428和rs6659923与大骨节病无关联。
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关键词
大骨节病
单核苷酸多态性
关联分析
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Keywords
Kashin-Beck disease
single nucleotide polymorphism
association analysis
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分类号
R684
[医药卫生—骨科学]
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题名骨质疏松症全基因组多组学整合分析
被引量:1
- 2
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作者
肖筱
张峰
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机构
西安交通大学环境与疾病相关基因教育部重点实验室与卫生部微量元素与地方病重点实验室
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出处
《国外医学(医学地理分册)》
CAS
2015年第4期255-256,262,共3页
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基金
国家自然科学基金资助项目(No.81102086)
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文摘
目的当前在骨关节疾病研究领域缺乏系统的跨组学研究,现就骨质疏松症全基因组多组学整合分析作一介评。方法该研究利用两个Meta分析的全基因组关联研究(GWAS)数据集,通过DMS算法在人类蛋白质互作网络(PPI)搜索得到影响骨密度的基因模块,然后使用基因表达谱数据对基因模块与疾病相关性进行评价。结果研究发现42个与股骨颈骨密度相关的基因模块和129个与腰椎骨密度相关的基因模块。利用基因表达谱评价候选基因模块与骨密度的相关性,最终得到两个显著相关的基因模块,功能涉及Wnt受体信号转导和成骨细胞分化。结论该研究发现的基因模块在骨量的调节中发挥着重要作用,为阐明骨质疏松症的发病机制提供了重要线索。
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关键词
骨密度
网络辅助的全基因组关联研究
蛋白质-蛋白质交互作用
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Keywords
bone mineral density
network-assisted genome-wide association analysis
protein-protein interactions
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分类号
R684
[医药卫生—骨科学]
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