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题名生物信息学分析筛选骨关节炎关键基因的研究
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作者
蒋捷
黄林科
韦林华
徐家科
陈蔚蔚
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机构
广西医科大学第一附属医院创伤骨科手外科
广西医科大学再生医学研究中心
西澳大利亚大学生物医学与科学学院
广西医科大学第二附属医院骨科
广西医科大学附属南宁市传染病医院外科
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出处
《微创医学》
2021年第2期162-168,180,共8页
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基金
中国博士后科学基金第62批面上项目(编号:2017M623296XB)。
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文摘
目的通过生物信息学研究骨关节炎(OA)和健康对照者的差异表达基因(DEGs),为诊断和治疗OA提供新的靶点。方法从GEO数据库下载基因芯片数据集GSE55457、GSE55235、GSE12021,采用GEO2R在线分析工具筛选出各数据集的DEGs并找到交集。采用DAVID在线分析工具进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。基于STRING数据库的信息分析DEGs蛋白相互作用(PPI),使用Cytoscape软件构建PPI网络并找出hub基因。结果共筛选得到126个DEGs,GO分析发现其主要参与细胞对促肾上腺皮质激素释放激素刺激的反应、通过mRNA剪接体对mRNA的剪接、负向调控基因表达、正向调控单核细胞聚集、正向调控成纤维细胞增殖等生物学过程,KEGG主要富集在MAPK、EB病毒感染、Ⅰ型人类T细胞白血病病毒分子感染、癌症中蛋白聚糖分子、恶性肿瘤分子、破骨细胞分化、PI3K/Akt、胰岛素信号转导、肿瘤中miRNAs、ErbB、HIF-1、膀胱癌信号通路。通过STRING和Cytoscape分析构建了4个核心子网络,并发现了JUN、BTG2、ATF3、DUSP1、HNRNPA1、SF1、SRSF7、TRA2B、TRA2A、PPP1R15A 10个度值最高的hub基因。结论JUN、BTG2、ATF3、DUSP1、HNRNPA1、SF1、SRSF7、TRA2B、TRA2A、PPP1R15A基因均可能是OA发病过程中新的生物标记物。
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关键词
生物信息学
骨关节炎
差异表达基因
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Keywords
Bioinformatics
Osteoarthritis
Differentially expressed genes
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分类号
R684.3
[医药卫生—骨科学]
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题名EGFL6对骨血管生成的调控机制研究进展
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作者
廖世杰
宋方茗
陈凯
唐生平
徐家科
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机构
广西医科大学第一附属医院广西再生医学研究中心
广西医科大学广西再生医学重点实验室
西澳大利亚大学生物医学与科学学院
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出处
《广西医科大学学报》
CAS
2022年第3期345-350,共6页
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基金
国家自然科学基金资助项目(No.82160809,No.82002279)
广西自然科学基金资助项目(No.2018GXNSFBA281090)。
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文摘
骨骼的生长和修复重塑过程中血管因素至关重要。表皮生长因子样结构域6(epidermal growth factor-like domain 6,EGFL6)作为成骨细胞特异性分泌的促血管生成因子,可经由MAPK/ERK、Wnt/β-catenin、BMP/Smad信号通路及其他相关分子调控骨血管的生成。本文就EGFL6调控骨血管生成的机制进行综述,以期为骨愈合受损、骨坏死等骨科临床难题提供新的治疗思路。
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关键词
EGFL6
血管生成
血管内皮细胞
骨
成骨
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Keywords
EGFL6
angiogenesis
vascular endothelial cell
bone
osteogenesis
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分类号
R816.8
[医药卫生—放射医学]
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题名骨重建在细胞水平上的研究进展
被引量:13
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作者
宋方茗
刘倩
徐家科
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机构
广西医科大学第一附属医院广西再生医学研究中心
广西医科大学广西再生医学重点实验室
西澳大利亚大学生物医学与科学学院
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出处
《广西医科大学学报》
CAS
2019年第12期1867-1881,共15页
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基金
国家自然科学基金资助项目(No.81702186)
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文摘
骨是一种不断变化的器官,需要不断的重建,维持结构的完整性,满足运动系统及体内矿物稳定的需要。骨重建过程主要由破骨细胞的骨吸收活动与成骨细胞的骨形成活动达到偶联平衡。一旦偶联失衡,容易导致各种骨代谢疾病,如骨质疏松症等。目前骨重建致病机制尚不明确,因此,在细胞水平上了解骨重建过程,为骨代谢疾病的治疗提供潜在的药物靶点。
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关键词
骨重建
细胞水平
骨代谢疾病
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Keywords
bone remodeling
cellular level
bone metabolic diseases
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分类号
R580
[医药卫生—内分泌]
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