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题名西藏地区紫堇属植物DNA条形码鉴定
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作者
杨冬璠
赵丽萍
汪圣
旦增顿珠
徐福春
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机构
西藏大学医学院
西藏职业技术学院
西藏大学/藏药现代化研发与藏药质量检测实验中心
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出处
《中药材》
CAS
北大核心
2023年第4期852-856,共5页
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基金
西藏自治区科技厅重点研发与转化计划项目(XZ201901-GB-11)
西藏自治区自然科学基金项目(XZ2018 ZR G-134)。
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文摘
目的:以ITS2序列和psbA-trnH序列作为DNA条形码,对西藏地区紫堇属植物进行分子鉴定。方法:通过比较两条序列的扩增成功率和测序成功率,分析序列特征,计算种内和种间的遗传距离,构建Neighbor-joining进化树,评价两条序列的鉴定效率。结果:两条序列的扩增成功率和测序成功率均为100%。psbA-trnH序列的最大种内遗传距离均小于最小种间遗传距离,符合DNA条形码对遗传距离的要求。系统进化树分析中,psbA-trnH序列能够有效地区分不同来源的紫堇属植物,而ITS2序列聚类效果较差。结论:psbA-trnH序列具有较高的鉴定效率,可作为西藏地区紫堇属植物物种鉴定的DNA条形码。该研究为西藏地区紫堇属植物的基因组学的深入研究夯实了基础,也为西藏紫堇属藏药的质量监控提供了新的方法。
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关键词
紫堇属植物
DNA条形码
ITS2
PSBA-TRNH
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Keywords
Corydalisplants
DNA barcode
ITS2
psbA⁃trnH
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分类号
R282.71
[医药卫生—中药学]
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