基于GEO数据库的小细胞肺癌lncRNA-miRNA-mRNA网络的构建与潜在的诊治靶点分析

目的 筛选参与小细胞肺癌(SCLC)发生发展的ncRNAs,预测其诊治的潜在靶点。方法 对人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库中获得的表达谱芯片数据进行差异基因分析,构建了ceRNA网络,并进行功能富集分析、PPI网络构建。收集7例手术治疗的小细胞肺癌患者,采用实时定量PCR(qPCR)对部分差异基因(lncRNA、mRNA和miRNA)进行临床样本验证。结果 共有99个lncRNA、46个miRNA和73个mRNA分子参与调控网络的构建。GO和KEGG分析表明失调的mRNA主要参与小细胞肺癌的细胞癌变、增殖以及转移。PPI网络分析提示46个基因被认为是中心基因。qPCR结果显示,与癌旁组织比较,小细胞肺癌组织中lnc-ENST00000430027.3呈相对高表达(P<0.001),hsa-miR-143-5p呈相对低表达(P<0.01),FANCA呈相对高表达(P<0.01)。结论 构建“lncRNA-miRNA-mRNA”的ceRNA调控网络,可为小细胞肺癌诊治提供新的依据和靶点,为小细胞肺癌诊断和治疗的分子生物学研究提供新的依据。