基于生物信息学和网络药理学的千里光调控肝癌的分子机制研究

目的采用生物信息学和网络药理学的技术与方法探究中药千里光调控肝癌的分子机制。方法从中药系统药理学数据库和分析平台、中国台湾中医药数据库和中药分子机制生物信息学数据库获取千里光活性成分及作用靶点;从基因表达公共数据库下载GSE57957、GSE60502和GSE84402三个数据集,运用在线分析工具GEO2R分析差异表达基因(DEGs)并取交集,利用DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集。借助STRING数据库和Cytoscape3.7版软件构建蛋白互作和“活性成分-靶点-疾病”网络筛选关键基因,利用GEPIA数据库分析表达差异及预后,获得候选靶点并在此基础上用AutoDock4.6版软件对接验证。结果获得2-呋喃甲酸、6-羟基-2-(2-苯乙基)色酮、菊黄素、菊酸、毛茛黄质、1,4-苯二酚、4-羟基苯乙酮和千里光菲灵碱共8个活性成分,作用靶点321个。GSE57957、GSE60502和GSE84402三个数据集分析出245个共同DEGs。“活性成分-靶点-疾病”网络中参与调控肝癌的成分有6个,共同靶点有17个。GO生物学过程涉及乙醇氧化、氧化还原反应、环氧化酶P450途径和脂肪酸长链代谢等,KEGG通路涉及参与脂肪酸降解通路、化学致癌、代谢通路、视黄醇代谢通路和细胞色素P450对外来物质的代谢通路等。蛋白互作网络关键靶点分别为CYP1A1、PTGS2、ESR1和NQO1,其中ESR1和NQO1同时具备显著性差异,并与不良预后有关。分子对接验证显示,NQO1与活性成分结合较为紧密。结论千里光可能通过调控肝癌细胞物质代谢途径,发挥辅助抗肝癌作用。