测序技术检测流产物拷贝数目变异的应用

目的：采用测序技术检测拷贝数变异,探讨测序技术在染色体疾病上的应用和拷贝数变异在流产物检测中的应用价值。方法：选择2013年7月至2014年4月在贵阳医学院附属医院贵州省产前诊断中心就诊孕妇中胚胎停止发育的50例患者,孕周为7-23周,留取流产物,提取DNA,制备文库,高通量测序,对流产物DNA进行测序分析,得出流产物的拷贝数变异。同时对孕妇和流产物做染色体核型分析。结果：50例孕妇的流产物染色体基因拷贝数变异检测,除1例为母源性污染,未得出结果外,测序检出率78%,染色体核型检出率为28%。结论：测序技术检测流产物的检出阳性率高于染色体核型检出率,流产物染色体核型能检出的整倍体改变、非平衡易位改变,测序技术均能检出,且在染色体微缺失微重复检出上优于染色体核型检出,推荐临床上使用对流产物进行测序技术检测查找流产原因。

高通量测序技术筛查单基因隐性遗传病

目的探讨用高通量测序技术筛查新生儿单基因隐性遗传病,评估其用于孕前筛查或产前诊断的可行性。方法用目标基因筛选和高通量测序分析法分别对非孕妇的血液基因组DNA和孕妇的血浆游离DNA样本进行400多种遗传病相关基因的全面筛查分析。结果用高通量测序技术成功地在非孕妇的血液中检测出相关的致病基因,并在疑似地中海贫血患者的基因组中发现了导致地中海贫血症的致病突变基因HBB（chr11：5246595 C/G）;成功地从孕妇血浆游离DNA检测出来自胎儿的遗传病相关致病基因突变,平均每个样本中有1～4个突变,基因型为杂合型。结论高通量测序技术可用于隐性基因携带者的孕前筛查及产前诊断。

Illumina测序技术在母血检测胎儿非整倍体中的应用

目的探讨Illumina无创测序技术检测孕妇外周血中的胎儿游离DNA，在胎儿染色体非整倍体的无创产前检测的应用价值。方法选择2011年4月至2013年4月在贵阳医学院附属医院贵州省产前诊断中心就诊孕妇2200人，孕周为12～30周，高龄妊娠、血清学高危和（或）超声提示胎儿异常等，抽取孕妇外周血，提取DNA，制备文库，应用Illumina Hiseq2000高通量测序，对母血中游离DNA进行测序分析，对阳性结果进行羊水穿刺或脐血穿刺行染色体核型分析；对阴性结果进行随访，对新生儿外周血进行染色体核型分析。结果2200名孕妇的游离DNA检测结果为阳性31例，其中21三体14例，18三体4例，13三体5例，4号三体1例，45，X3例，47，XXX4例；所有阳性结果均经羊水穿刺或脐血穿刺行染色体核型分析，其中21三体、18三体、4号三体符合率100％，13三体有1例不符合，45，X有1例不符合，47，XXX有2例不符合，其中1例经核型证实来源于孕妇，孕妇本身为47，XXX；所有阴性结果均在随访时行外周血染色体核型分析，检测出易位19例、倒位24例、多态20例。结论Illumina无创测序技术适合用于胎儿非整倍体检测，对染色体易位、倒位、多态等不具有检出作用，在性染色体非整倍体的检出率上还有待加深测序深度，提高检出率。