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题名胃癌组织中碳酸酐酶Ⅸ表达的临床意义及分子机制
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作者
付佳音
莫非
何芸
袁蕴馨
卢涵
渠巍
于湧
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机构
贵州医科大学附属医院临床检验中心
贵州医科大学医学检验学院
贵阳市妇幼保健院检验科
贵阳市公共卫生救治中心放射治疗科
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出处
《贵州医科大学学报》
CAS
2023年第3期285-292,共8页
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基金
贵州医科大学国家自然科学基金培育项目(gyfynsfc〔2020〕-1)。
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文摘
目的探讨胃癌(GC)组织中碳酸酐酶(CAⅨ)的临床意义及其分子机制。方法采用基因表达谱动态数据分析(GEPIA2)数据库预测GC组织中CAⅨ基因的差异性表达,利用癌症数据分析(UALCAN)数据库分析CAⅨ表达与GC患者临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier Plotter分析CAⅨ对GC的预后价值;收集10例GC患者的癌患组织(GC组)及其癌旁组织标本(对照组),采用免疫组织化学法检测CAⅨ表达;采用交互式基因检索工具(STRING)和可视代综合发现(DAVID)数据库进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析预测CAⅨ的蛋白质互作关系及调控网络。结果GEPIA2数据库结果显示,与对照组比较,GC组CAⅨ的表达量降低(P<0.05);UALCAN数据库显示,CAⅨ的表达与种族、肿瘤分化等级、幽门螺杆菌感染有相关性(P<0.05);Kaplan-Meier Plotter数据库分析显示,低CAⅨ表达组与高CAⅨ表达组的5年无进展生存期(PFS)相比,差异有统计学意义(P<0.05);临床标本免疫组织化学结果显示,GC组标本中CAⅨ表达量较对照组降低(P<0.05),与数据库预测结果一致;STRING数据库分析显示,CAⅨ与缺氧诱导因子-1α(HIF1α)、溶质载体家族4成员4(SLC4A4)、芳烃受体核转位器(ARNT)等蛋白具有较强相互作用关系;GO分析显示,CAⅨ参与低氧反应下RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调节等过程;KEGG分析显示CAⅨ与癌症信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路的调节有关。结论CAⅨ在GC组织中呈低表达,其水平与GC患者肿瘤分化等级、PFS呈负相关,CAⅨ可能参与肿瘤代谢过程。
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关键词
数据挖掘
胃肿瘤
碳酸酐酶Ⅸ
差异表达
基因本体分析
京都基因与基因组百科全书通路分析
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Keywords
data mining
stomach neoplasms
carbonic anhydraseⅨ(CAⅨ)
differential expression
gene ontology(GO)analysis
Kyoto encyclopedia of gene and genomes(KEGG)pathway analysis
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分类号
R735.2
[医药卫生—肿瘤]
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