螨虫过敏原Der f 22蛋白质结构与表位多肽的预测与分析

目的分析螨虫过敏原Der f 22的氨基酸序列特性与二级结构,构建其三维结构模型并基于此对其B、T细胞表位进行预测与分析。方法通过ProtParam对Der f 22的理化性质进行计算。根据其理化性质与氨基酸序列,使用AlphaFold 2和GalaxyRefined2构建并优化Der f 22过敏原的三维结构,进一步利用DNAStar、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope 2.0和TepiTool预测Der f 22的B细胞表位和T细胞表位。结果基于氨基酸序列,我们得到了Der f 22蛋白的二级结构特征与三维结构。利用多种生物信息学工具,我们预测并筛选出6个线性B细胞表位、19个参与形成构象B细胞表位的关键残基和4个T细胞表位。结论本研究得到的蛋白质结构和抗原表位为进一步对Der f 22功能改造及低免疫原性疫苗的开发奠定基础。

粉尘螨Der f 38的结构与免疫优势表位的生物信息学预测分析

目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征进行分析。通过SWISS-MODEL、AlphaFold2及GalaxyRefine对Der f 38的三维结构模型进行综合构建、优化得到最佳的蛋白模型。利用DNAStar Protean、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTop、TepiTool进行Der f 38蛋白的B细胞线性、构象型表位以及T细胞表位的综合预测。结果:Der f 38为分子量13.99kDa且等电点为9.08,总平均亲水性为-0.337,不稳定指数为31.79。通过多种生物信息学工具综合分析,共得到4个优势B细胞线性表位、8个B细胞构象表位和8个T细胞表位。结论:Der f 38属于碱性蛋白,具有一定的亲水性和稳定性,含有多个免疫优势的B细胞和T细胞抗原表位,为进一步针对该蛋白的疫苗和过敏原特异性免疫疗法的设计与开发提供理论参考。

急性脑卒中患者血清生物标志物GFAP、MMP-9、UCH-L1的研究进展

脑卒中是临床常见的一种急性脑血管疾病,主要因脑血管在多因素综合作用下,脑局部血管阻塞或突然破裂,血管血液流动受阻,引发脑局部血管微循环障碍,导致脑局部神经组织细胞因缺血缺氧而损伤或坏死,包括出血性和缺血性两种类型。脑卒中是导致全球人类死亡的第二原因,也是导致成年人残疾的重要原因,具有较高的发病率、致残率、病死率以及复发率。因此,积极防治脑卒中成为临床研究热点。随着临床对急性脑卒中认识的深入,临床发现急性脑卒中患者的血清生物标志物在一定程度上可早期诊断和早期辅助诊断急性脑卒中、评估患者的病情严重程度及预测患者的预后。基于此,本文选取典型的三种血清生物标志物胶质纤维酸性蛋白(GFAP),基质金属蛋白酶-9(MMP-9),泛素羧基末端水解酶Ll(UCH-L1)为综述的对象,旨在阐述GFAP、MMP-9、UCH-L1对急性脑卒中早期诊断与鉴别诊断的临床意义,并进一步探究这三种生物标志物对疾病评估及预后价值。

新型致癌蛋白:Gankyrin

Gankyrin又称PSMD10,最早发现于肝癌组织,是肝癌的重要标志蛋白。Gankyrin在许多肿瘤组织中存在高表达,且与肿瘤的恶性程度和进展有关。Gankyrin调节肿瘤相关蛋白P53和pRB的表达,造成肿瘤细胞增殖失控,引发恶性肿瘤。研究发现gankyrin不仅可以作为肿瘤细胞的生物标志物,同时也是肿瘤增殖转移的重要监测指标。调节gankyrin蛋白成为治疗和改善肿瘤重要手段。本综述总结了近年来gankyrin在肿瘤细胞的增殖转移和耐药机制以及现有的基于gankyrin蛋白的肿瘤治疗方法,为临床上治疗肿瘤提供新思路。