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幽门螺旋杆菌感染对胃癌的影响研究
被引量:
9
1
作者
王识宇
袁德成
+1 位作者
顾芳
齐泽华
《中国临床实用医学》
2017年第2期42-47,共6页
目的 探讨未感染幽门螺旋杆菌(HP)的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间的差异.方法 提取TCGA数据库中胃癌样本基因表达量(MRNA)的数据.根据胃癌样本中有无HP感染将样本分为2组,通过edgeR算法分别对比表达量数据,并得到差异基因.再将...
目的 探讨未感染幽门螺旋杆菌(HP)的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间的差异.方法 提取TCGA数据库中胃癌样本基因表达量(MRNA)的数据.根据胃癌样本中有无HP感染将样本分为2组,通过edgeR算法分别对比表达量数据,并得到差异基因.再将得到的两组差异基因分别进行富集分析,最后比较两组富集分析的结果,得出未感染HP的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间富集通路的差异.结果 由KEGG数据库可知,未感染HP的胃癌样本在代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P〈0.00001).感染HP的胃癌样本在细胞因子-细胞因子受体相互作用方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P〈0.00001).结论 HP感染导致细胞因子-细胞因子受体相互作用异常.可能有2种不同的胃癌亚型,分别对于代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与细胞因子-细胞因子受体相互作用方面产生影响.
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关键词
胃癌
幽门螺旋杆菌
edgeR算法
原文传递
题名
幽门螺旋杆菌感染对胃癌的影响研究
被引量:
9
1
作者
王识宇
袁德成
顾芳
齐泽华
机构
辽宁省沈阳化工大学信息工程学院
辽宁省
沈阳
市中医院肿瘤科
出处
《中国临床实用医学》
2017年第2期42-47,共6页
基金
沈阳市科技攻关课题资助(F16-206-9-33)
文摘
目的 探讨未感染幽门螺旋杆菌(HP)的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间的差异.方法 提取TCGA数据库中胃癌样本基因表达量(MRNA)的数据.根据胃癌样本中有无HP感染将样本分为2组,通过edgeR算法分别对比表达量数据,并得到差异基因.再将得到的两组差异基因分别进行富集分析,最后比较两组富集分析的结果,得出未感染HP的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间富集通路的差异.结果 由KEGG数据库可知,未感染HP的胃癌样本在代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P〈0.00001).感染HP的胃癌样本在细胞因子-细胞因子受体相互作用方面与癌旁比较,差异有统计学意义(P〈0.00001).结论 HP感染导致细胞因子-细胞因子受体相互作用异常.可能有2种不同的胃癌亚型,分别对于代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与细胞因子-细胞因子受体相互作用方面产生影响.
关键词
胃癌
幽门螺旋杆菌
edgeR算法
Keywords
Gastric cancer
Helicobacter pylori
EdgeR algorithm
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
幽门螺旋杆菌感染对胃癌的影响研究
王识宇
袁德成
顾芳
齐泽华
《中国临床实用医学》
2017
9
原文传递
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