刀鲚MyoG基因克隆和组织表达分析

为了探究刀鲚(Coilia nasus)MyoG基因的生物学功能及组织表达特征,采用RACE克隆其MyoG基因cDNA全长序列,并进行生物信息学分析,从GenBank中选择硬骨鱼类、两栖动物、鸟类和哺乳动物4种物种的MyoG氨基酸序列,通过DNAMAN进行氨基酸序列比对,以MEGA 7.0中的邻接法(NJ)构建系统发育进化树,应用实时荧光定量PCR检测分析刀鲚MyoG基因在不同组织的表达情况。结果表明,刀鲚MyoG基因cDNA全长1836 bp,包括118 bp的5'非编码区(5'-UTR)、944 bp的3'非编码区(3'-UTR)和774 bp的开放阅读框(ORF),共编码257个氨基酸残基。刀鲚MyoG氨基酸序列具有MRFs典型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域,与其他鱼类的MyoG氨基酸序列同源性较高,其中与大西洋鲱(Monopterus albus)的MyoG氨基酸序列相似性最高。刀鲚MyoG基因在其肌肉组织中的相对表达量最高,在心脏和脾脏中最低。综上,本研究成功克隆了刀鲚MyoG基因cDNA全长序列,并对其生物信息学及组织表达特征进行了分析,研究结果为进一步探究刀鲚MyoG基因功能特征提供了参考。