辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异分析

目的了解2000～2006年辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法利用辽宁省流感监测的咽拭分离株中的甲1亚型流感病毒核酸，采用逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）扩增，测序，并推导出其氨基酸序列，进行基因进化特征分析。结果辽宁省2000～2002年均分离到甲1亚型流感病毒，但消失了近3年后，2005年底又出现，且基因序列碱基发生变异，与2005年以前的病毒株和疫苗株A／New Caledonia／20／1999比较，在其HA1蛋白分子上存在有4个氨基酸位点（187位W〉R，188位Y〉F，209位Q〉K，249位V〉A）发生了替换。基因序列及氨基酸序列同源性均有下降。结论辽宁省2000～2006年甲1亚型流感病毒基因序列发生了明显变异，与甲1亚型疫苗株A／New Caledonia／20／1999同源性有下降趋势，提示其抗原可能发生部分漂移或更换，这对流行季节疫苗选择和流行病学研究都具有重要意义。

单一ARIMA模型和联合模型比较预测辽宁省感染性腹泻疫情

目的联合运用乘积季节自回归积分滑动平均模型(autoregressive integrated moving average model,ARIMA)联合季节变动模型和单一ARIMA模型对感染性腹泻发病数据建模,预测辽宁省2014年1—6月感染性腹泻疫情,为预防控制工作提供依据。方法对辽宁省2009—2013年感染性腹泻月发病数通过SPSS软件进行建模,比较联合模型和单一模型的预测效果。结果对感染性腹泻的季节性时间序列建立ARIMA(0,1,1)(1,1,0)12模型,与季节变动的测定进行联合,联合模型相对误差率为6.05%,单一ARIMA模型相对误差率为17.89%,联合应用上述模型的预测效果优于单一模型。应用联合模型对2014年1—6月感染性腹泻发病数进行短期预测,预测相对误差率分别为-2.15%、0.21%、-7.06%、-4.91%、12.79%和9.14%。结论联合模型效果优于单一ARIMA乘积季节模型,可用于感染性腹泻的短期预测,且效果较好。

辽宁省甲3亚型流感病毒HA1基因特性分析

目的了解2001—2006年间辽宁省甲3亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法采用辽宁省流感监测的咽拭分离株，对其中的7株甲3病毒核酸提取，经逆转录一聚合酶链反应（RT—PCR），扩增产物测序，推导出其氨基酸序列，并用DNAMAN软件包中的Alignment做了差异和同源性比较，用Mega软件包中的Neighbor Joining方法，通过与NCBI数据库中2000--2006年28株H3N2流感病毒同源比对后，制作种系进化树，进行基因进化特征分析。结果序列分析发现，甲3亚型流感病毒与WHO当年的疫苗株A／California／7／2004比较，在其HA1核酸序列上有12处碱基不同，4个氨基酸位点发生了替换。基因及氨基酸序列同源性下降。与WHO北半球疫苗株A／Wisconsin／67／2005序列更接近，但仍有4处碱基不同。结论甲3亚型流感病毒基因序列发生了变异，与甲3亚型疫苗株A／California／7／2004同源性有下降趋势，提示其抗原可能发生部分漂移或更换，与南方浙江2005年株、WHO北半球2006--2007疫苗株A／Wisconsin／67／2005序列接近，提示南方春夏季流感流行株极有可能在北方秋冬季流行，对流感流行病学监测，疫苗株使用指导都具有重要意义。

辽宁省1999-2005年度流感病原学监测

目的分析辽宁省1999-2005年度流感的病原学及流行特征。方法在流行季节采集咽拭子用鸡胚和细胞分离方法,进行间接血凝抑制试验。结果1999年11月至2005年3月末,辽宁省及省内其他6市疾病预防控制中心(CDC)共采集咽拭子标本2713份,分离流感病毒188株,平均分离率为7.0%;其中辽宁省CDC和大连市CDC共采集标本1466份,分离病毒167份,平均分离率为11.4%;在2002年以前均分离到A3、A1和B型,且B型为Yamagata谱系;2002年后再未见A1型出现,A3与B型优势并重,且抗原分析显示B型已与Victoria谱系更类似。辽宁省作为北方省在中国-WHO第一个五年流感监测项目中只进行秋冬季监测,发现流行期出现在当年11月份至次年2月份。结论辽宁省不同年份流感病原学监测结果的分析对于了解辽宁省流感流行特点、亚型漂移、对流感乃至禽流感的监测与预防控制具有重要意义。

辽宁省2009年呼吸道标本病原体检测分析

急性呼吸道感染性疾病对人类健康的威胁严重,严重者可在短时间内造成死亡。中国人口密度高,人员流动频繁,易于呼吸系统传染性疾病的传播。因此,及时检测呼吸道传染病的病原体、明确其致病性对公共卫生部门防控措施的制定至关重要。

应用直线回归统计方法对肾综合征出血热疫情进行预测研究

目的确定肾综合征出血热(HFRS)预测指标,进行疫情预测预报。方法选用直线回归统计方法,用带病毒鼠指数与发病率做相关分析。结果姬鼠型疫区HFRS发病率与黑线姬鼠带病毒鼠指数呈正相关(r=0.720,t=3.741,P<0.01);家鼠型疫区HFRS发病率与褐家鼠带病毒鼠指数也呈正相关(r=0.610,t=3.103,P<0.01)。流行强度与主要宿主动物数呈正相关。结论带病毒鼠指数可以作为疫情预测的重要指标,进行预测预报。

广谱细菌性病原体监测方法建立

通过细菌的16S rRNA序列分析对细菌进行鉴定与分类是目前细菌鉴定最有效的方法之一,尤其适用于复杂疫情的快速筛查与检验[1]。但是,现有的16S rRNA扩增引物大多具有种属亲嗜性,在模板浓度较低时难以获得阳性扩增结果,

从棘突蛋白基因重组探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒的来源

目的探讨SARS冠状病毒(SARS-CoV)的起源。方法运用生物信息学的方法,比较不同SARS样冠状病毒之间的异同,着重分析蝙蝠所携带的SARS样冠状病毒(SL-CoV)跨越种属屏障传播的可能性。结果除编码棘突蛋白(S蛋白)基因外,SARS-CoV与蝙蝠SL-CoV间编码结构蛋白的基因与编码复制酶的基因相似程度均很高;而S基因的差异主要集巾在S1片段,且该片段的GC含量与SARS-CoV基因组的GC含量明显不同。进一步分析表明,由S1片段构建的冠状病毒进化树与由S2片段构建的进化树存在拓扑结构上的不平行性。结论人类SARS病毒可能来源于蝙蝠SL-CoV,但在S基因内发生了基因重组事件,从而导致其获得跨越种属屏障传播的能力。

沈阳市类流感样病例病原检测分析

目的运用多重巢式反转录聚合酶链反应（multiplex nested reverse transcription polumerase chainreaction，多重巢式RT—PCR）快速检测类流感样病例（influenza like illness，ILI）相关病原，掌握流感症状人群的病原谱，并探讨类流感样病例百分比（Consultation rates of influenza—like illness，ILI％）作为流感流行监测指标的适用程度。方法于2007年1～4月采集辽宁省沈阳市纳入国家流感监测网络的医院门诊ILI病例咽拭子118份，同时采用传代狗肾（MDCK）细胞分离流感病毒，采用多重巢式RT—PCR检测13种类流感样病例相关病原，计算各病原的阳性率与构成比，并与同时期监测所得的ILI％比较。结果2007年1～4月，ILI％在5．0％左右波动，而流感病毒分离阳性率从峰值42．1％下降至0；多重巢式RT—PCR共检测出11种病原体，其中流感病毒阳性率亦从52．6％逐步下降至5．7％，鼻病毒、腺病毒和副流感病毒3者之和的阳性率在37．8％左右波动。结论结果提示，ILI的病原构成较复杂，难以从临床症状区分由流感病毒或其他病原导致的类流感样症状。因此，ILI％单独不足以表明流感病毒在人群中的流行情况，尚需辅助以敏感的实验室检测方法。

对2004—2014年人间布鲁杆菌病实验室检测方法的系统评价

目的分析近10年我国人间布鲁杆菌病（简称布病）实验室检测方法的使用现状，并对其敏感度和特异度进行评价。方法检索2004—2014年《中国人兽共患病学报》、《中华流行病学杂志》、《中华地方病学杂志》、《中国地方病防治杂志》、《疾病监测》杂志中有关布病实验室检测的文献，统计各省份各检测方法的检测样本量和各检测方法的灵敏度、特异度及符合率。结果筛选出157篇文献，共由24个省份报告，实际样本检测时间为1954—2012年，共使用14种方法检查了716280份次的样本。检测方法中，检测样本量由大到小分别为试管凝集试验（SAT，256050份），虎红平板凝集试验（RBPT，224699份），皮内变态反应试验（CET，184787份）．平板凝集试验（PAT，33018份）。24个省份使用SAT，20个省份使用RBPT，10个省份使用CET，7个省份分离布鲁杆菌；各省份检测样本量由大到小分别为河南（114031份）、内蒙古（104287份）、浙江（93484份）；使用的检测方法由多到少分别为浙江（9种）、内蒙古（7种）、山东（5种）和黑龙江（5种）。各检测方法与SAT的符合率最高的是胶体金方法，为99．77％（9811／9834）；其次为PAT，为97．73％（86／88）；双抗原夹心酶联免疫吸附试验（BAgS—ELISA），为96．49％（110／114）；RBPT为94．55％（2465／2607）；人免疫球蛋白G酶联免疫吸附试验（IgGELISA）为86-38％（2068／2394）；IgMELISA为76．23％（1825／2394）；补体结合试验（CFT）为69．17％（83／120）；CET为56.36％（31／55）。结论大多数省份都采用了SAT和RBPT方法，且检测样本量大，灵敏度、特异度均高。使用其他方法的检测单位和检测量都相对较少。胶体金操作简便，可现场使用；ELISA的灵敏度、特异度均不是很高，但是可以分别检测IgG及IgM．对慢性布病诊断有一定参考价值。