千里光脂肪酸脱氢酶(D6D)的保守基序(CSM)与功能结构域分析

Δ6-脂肪酸脱氢酶(Δ6 desaturase,D6D)是不饱和脂肪酸合成途径中的限速酶。以高等植物千里光为材料,通过构建全长c DNA文库克隆得到脂肪酸脱氢酶基因(D6D),明确了D6D基因的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)对蛋白质功能结构域的决定作用。结果显示,千里光D6D基因由466个氨基酸残基组成;预测蛋白分子量为53.40 ku,理论等电点为8.48;进化树和序列比对结果提示3个富含His的保守基元序列(HisⅠ-片段、HisⅡ-片段、HisⅢ-片段)在不同物种中表现出高度保守性;三维结构预测结果表明,D6D基因的保守结构域以及一个类似于细胞色素(cytochrome,cyt)b5的血红素结合区是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。