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急性髓系白血病伴血小板计数减少的研究进展
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作者 程文亮 李荣 +1 位作者 赵德华(综述) 葛晓军(审校) 《检验医学与临床》 CAS 2024年第15期2292-2296,共5页
急性髓系白血病(AML)细胞与机体血小板之间的相互作用是导致血小板功能紊乱并加剧肿瘤进展的重要原因,这一病理过程主要通过AML细胞分泌细胞因子异常活化血小板、血小板表达膜糖蛋白掩护AML细胞逃逸、血小板分泌细胞因子下调免疫杀伤细... 急性髓系白血病(AML)细胞与机体血小板之间的相互作用是导致血小板功能紊乱并加剧肿瘤进展的重要原因,这一病理过程主要通过AML细胞分泌细胞因子异常活化血小板、血小板表达膜糖蛋白掩护AML细胞逃逸、血小板分泌细胞因子下调免疫杀伤细胞实现。该文从AML伴血小板计数减少对机体的影响出发,重点叙述AML细胞与血小板之间相互作用的病理与分子机制,阐明血小板计数减少及相关参数恢复对机体的影响,并对基于血小板的靶向和模拟药物进行总结,旨在为临床工作者探索新的临床治疗靶点提供理论依据。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 血小板计数减少 掩护作用 免疫细胞 分子机制
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ABCG2在奥希替尼耐药的非小细胞肺癌中的作用及机制研究 被引量:3
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作者 王妹 姜钧耀 +2 位作者 杜雨軒 刘帅妹 葛晓军 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第6期1027-1034,共8页
目的:探索ABCG2在非小细胞肺癌细胞对奥希替尼耐药中的作用机制及逆转其耐药的方法。方法:选取A549、NCI-H1299、NCI-H1975细胞并诱导其对奥希替尼产生耐药;通过慢病毒转染使A549、NCI-H1299产生T790M基因突变,并诱导其对奥希替尼耐药;... 目的:探索ABCG2在非小细胞肺癌细胞对奥希替尼耐药中的作用机制及逆转其耐药的方法。方法:选取A549、NCI-H1299、NCI-H1975细胞并诱导其对奥希替尼产生耐药;通过慢病毒转染使A549、NCI-H1299产生T790M基因突变,并诱导其对奥希替尼耐药;通过CCK-8法检测细胞对奥希替尼的IC_(50)值;通过高效液相色谱法检测细胞内奥希替尼浓度;Western-blot检测细胞内EGFR、p-EGFR、ABCG2、AKT、p-AKT、PI3K、GSK、p-ERK和ERK等蛋白表达;基因测序检测18、19、20和21号外显子是否发生突变;通过质粒转染调控肺癌细胞中ABCG2的表达并检测细胞对奥希替尼的敏感性变化。结果:通过CCK-8法检测,验证耐药系数大于10,证明耐药细胞构建成功。奥希替尼耐药细胞中ABCG2表达增加,且细胞内奥希替尼浓度降低。使用过表达质粒上调了肺癌细胞中ABCG2表达后,发现肺癌细胞对奥希替尼的敏感性明显降低;相反,下调耐药细胞中ABCG2表达后细胞对奥希替尼的敏感性恢复。抑制MAPK通路及PI3K/AKT通路能明显抑制ABCG2的表达。结论:ABCG2表达增高是导致非小细胞肺癌对奥希替尼耐药的重要原因之一;ABCG2的表达与MAPK及PI3K/AKT信号通路的激活相关。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 奥希替尼 三磷酸腺苷结合转运蛋白G超家族成员2 表皮生长因子受体
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miR-7低表达导致非小细胞肺癌细胞吉非替尼耐药的作用机制 被引量:6
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作者 王妹 姜钧耀 +1 位作者 杜雨軒 葛晓军 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2020年第5期460-465,共6页
目的非小细胞肺癌(NSCLC)患者吉非替尼耐药的机制仍然是目前研究的热点。文中旨在探讨吉非替尼获得性耐药肺癌细胞与非耐药细胞相比,MicroRNA(miRNA)的表达差异及调控MicroRNA表达后细胞的生长特性。方法以NSCLC细胞A549、H1299为研究对... 目的非小细胞肺癌(NSCLC)患者吉非替尼耐药的机制仍然是目前研究的热点。文中旨在探讨吉非替尼获得性耐药肺癌细胞与非耐药细胞相比,MicroRNA(miRNA)的表达差异及调控MicroRNA表达后细胞的生长特性。方法以NSCLC细胞A549、H1299为研究对象,构建吉非替尼耐药细胞,应用CCK-8法检测吉非替尼对细胞活性的影响,实时荧光定量PCR检测耐药、非耐药细胞中MicroRNA的表达量,微阵列检测细胞内MicroRNA表达谱,转染质粒上调mir-7的表达,Western blot检测细胞内表皮生长因子受体(EGFR)蛋白表达。结果吉非替尼耐药A549、H1299细胞的IC 50值是非耐药细胞的3倍。与A549、H1299非耐药细胞比较,其耐药细胞生长较为缓慢。MiRNA阵列分析中检测到43种miRNA的表达谱发生了显著变化,其中有25种上调的miRNA和18种下调的miRNA,miR-7在耐药细胞中显著下调。qPCR定量检测结果表明mir-21、mir-124c、mir-181明显上调,mir-7、mir-146a、mir-145-p明显下调,其中mir-7变化最显著(P<0.05)。与未转染细胞mir-7表达量(0.84±0.10)比较,转染过表达mir-7的质粒后细胞(6.72±0.84)升高(P<0.05)。Western blot检测结果显示,miR-7表达升高后,细胞内EGFR表达明显降低。H1299耐药细胞IC 50由7.23μg/mL降低至2.46μg/mL,A549耐药细胞IC 50由6.85μg/mL降低至2.23μg/mL(P<0.05)。结论miR-7的表达能负向调控EGFR的表达,miR-7的下调是导致NSCLC细胞吉非替尼耐药的机制之一。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 吉非替尼 MICRORNA表达谱 miR-7 表皮生长因子受体 耐药
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慢性移植物抗宿主病患者免疫细胞亚群分选的表面标志组合策略 被引量:1
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作者 杜雨軒 王平 +9 位作者 葛晓军 王筱淇 洪涛 王蔚浩 何云地 黄瑞昊 邓小娟 刘帅妹 杨世杰 张曦 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第21期2331-2336,共6页
目的观测慢性移植物抗宿主病(chronic graft-versus-host disease,cGVHD)患者免疫细胞亚群分布变化规律,探讨免疫细胞表面标志物分选出的特定细胞亚群在cGVHD发病过程中对疾病发展的预测作用。方法收集2020年10月至2021年7月在陆军军医... 目的观测慢性移植物抗宿主病(chronic graft-versus-host disease,cGVHD)患者免疫细胞亚群分布变化规律,探讨免疫细胞表面标志物分选出的特定细胞亚群在cGVHD发病过程中对疾病发展的预测作用。方法收集2020年10月至2021年7月在陆军军医大学第二附属医院血液病医学中心接受造血干细胞移植后的患者58例,根据移植后是否发生cGVHD分为cGVHD组(发生cGVHD,n=43)和对照组(未发生cGVHD,n=15),采用流式细胞术分析两组患者免疫细胞亚群比率及分布情况,募集患者原发诊断包括ALL、AML、CML、MDS、SAA和重型β地中海贫血。其中发生cGVHD的中位时间为178.5(47~1328)d,每例患者于随访过程中发生cGVHD时或病程中随访当日留取外周血标本。结果cGVHD组患者外周血中调节性T细胞(regulatory T cells,Tregs)及过渡型B细胞的分布水平显著降低,CD19^(+)B淋巴细胞的分布水平较对照组显著增加;接受造血干细胞移植后发生cGVHD的患者组外周血中Tregs较接受造血干细胞移植后未发生cGVHD的患者组明显降低,中度cGVHD患者Th17细胞较轻度患者分布水平显著升高,CD19^(+)B淋巴细胞在轻度、中度患者中显著升高;比较不同cGVHD靶器官,仅累及皮肤病变的患者与仅累及肝脏的患者Tregs较对照组中显著降低,而合并皮肤及肝脏损伤患者的外周血中滤泡辅助T细胞的分布显著高于仅累及黏膜或眼睛等器官的患者。结论移植后免疫细胞亚群检测是临床辅助cGVHD诊疗随访的重要参考指标。使用免疫细胞表面标志组合的特异性策略分选出的调节性T细胞、过渡型B细胞对cGVHD患者的发病及严重程度、靶器官损伤都有特异性的指示作用。 展开更多
关键词 异基因造血干细胞移植 慢性移植物抗宿主病 免疫细胞亚群 调节性T细胞 过渡型B细胞 辅助滤泡T细胞
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人脐带间充质干细胞预防小鼠急性移植物抗宿主病作用及其机制研究
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作者 洪涛 王瑞 +10 位作者 王筱淇 王蔚浩 杜雨軒 何云地 马超 安慧慧 王俊洁 张云芳 高强国 杨世杰 张曦 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第21期2276-2285,共10页
目的探讨人脐带间充质干细胞(human umbilical cord mesenchymal stem cells,HUCMSCs)对小鼠急性移植物抗宿主病(acute graft-versus-host disease,aGVHD)的预防效果并初步探索其作用机制。方法通过对接受全身辐照的雄性BALB/c小鼠移植... 目的探讨人脐带间充质干细胞(human umbilical cord mesenchymal stem cells,HUCMSCs)对小鼠急性移植物抗宿主病(acute graft-versus-host disease,aGVHD)的预防效果并初步探索其作用机制。方法通过对接受全身辐照的雄性BALB/c小鼠移植雄性C57BL/6小鼠的骨髓细胞和脾脏细胞,构建小鼠异基因造血干细胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT)后aGVHD模型,建模部分实验分组:BM组[尾静脉注射500μL供者C57BL/6小鼠骨髓细胞(5×10^(6)/只)悬液]和aGVHD组[尾静脉注射500μL骨髓细胞(5×10^(6)/只)和脾脏细胞(5×10^(6)/只)混悬液]。观察小鼠生存率、临床评分和体质量变化;流式细胞术检测移植后嵌合度;HE染色观察aGVHD靶器官(肺脏、肝脏、结肠、小肠)的病理学改变。收集P4代HUCMSCs,于移植当天混合供者骨髓细胞和脾脏细胞输注BALB/c小鼠,实验分组:①aGVHD组(处理同建模部分);②aGVHD+MSCs组[经尾静脉注射500μL骨髓细胞(5×10^(6)/只)、脾脏细胞(5×10^(6)/只)和HUCMSCs(5×10^(5)/只)混悬液]。观察HUCMSCs对aGVHD的预防效果,应用ELISA检测各组小鼠血清IFN-γ、TNF-α浓度;流式细胞术检测CD4^(+)T细胞在靶器官中绝对数计数和凋亡水平。结果aGVHD组较BM组生存率降低、临床评分增高、体质量减轻明显(P<0.05),靶器官病理损伤更为严重(P<0.05);移植后小鼠达完全嵌合。HUCMSCs输注显著改善移植后小鼠生存、降低临床评分和靶器官病理损伤(P<0.05),并降低血清炎症因子浓度(P<0.05),增加CD4^(+)T细胞在靶器官中的凋亡,CD4^(+)T细胞绝对数计数显著下降(P<0.05)。结论HUCMSCs联合allo-HSCT能有效预防及减轻小鼠aGVHD,其作用机制主要是HUCMSCs介导淋巴细胞凋亡,减少其在靶器官中的浸润和调控炎症因子分泌。 展开更多
关键词 异基因造血干细胞移植 急性移植物抗宿主病 人脐带间充质干细胞 细胞疗法 炎症因子
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皮肤优势型慢性移植物抗宿主病小鼠模型的构建
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作者 王蔚浩 杨世杰 +10 位作者 杜雨軒 王筱淇 洪涛 何云地 王瑞 马超 安慧慧 王俊洁 张云芳 高强国 张曦 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第21期2286-2293,共8页
目的构建皮肤优势型慢性移植物抗宿主病(chronic graft-versus-host disease,cGVHD)小鼠模型。方法利用致死剂量辐照BALB/c小鼠,并接受来自B10.D2供鼠混合的骨髓细胞和脾脏细胞以构建皮肤优势型cGVHD小鼠模型,通过小鼠临床表现、病理特... 目的构建皮肤优势型慢性移植物抗宿主病(chronic graft-versus-host disease,cGVHD)小鼠模型。方法利用致死剂量辐照BALB/c小鼠,并接受来自B10.D2供鼠混合的骨髓细胞和脾脏细胞以构建皮肤优势型cGVHD小鼠模型,通过小鼠临床表现、病理特征及靶器官细胞亚群评估模型构建情况。结果模型小鼠的临床表现以皮肤脱毛、硬化、皮屑、结痂和由皮肤皱缩硬化引起的弓背和关节僵直为主,临床病理评分随疾病进展升高,但无明显肠道cGVHD表现。病理改变中皮肤出现明显胶原沉积,毛囊减少甚至消失,而其他靶器官病理改变不明显。对以上靶器官行T细胞亚群分析,发现Th1细胞、CD4^(+)IL-13^(+)T细胞和Tc1细胞与疾病进展密切。结论成功构建可用于实验研究的皮肤优势型小鼠cGVHD模型,病理变化主要以皮肤纤维化表现为主。 展开更多
关键词 慢性移植物抗宿主病 皮肤 肝脏 肺脏 T细胞
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细胞因子检测在急性移植物抗宿主病诊治中的临床应用 被引量:1
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作者 杜雨軒 王妹 +4 位作者 陈婷 王平 彭贤贵 张曦 葛晓军 《检验医学与临床》 CAS 2021年第16期2441-2445,共5页
细胞因子是一组激素样多肽介体,在介导宿主免疫防御中发挥重要的调节作用。细胞因子可由不同类型的细胞产生,起到细胞间信号传递、增强或抑制目标细胞增殖、分化、活化和运动的作用。造血干细胞移植(HSCT)是治疗血液系统疾病的重要手段... 细胞因子是一组激素样多肽介体,在介导宿主免疫防御中发挥重要的调节作用。细胞因子可由不同类型的细胞产生,起到细胞间信号传递、增强或抑制目标细胞增殖、分化、活化和运动的作用。造血干细胞移植(HSCT)是治疗血液系统疾病的重要手段之一。移植物抗宿主病(GVHD)是移植后的常见并发症,是引起HSCT后死亡的重要原因。GVHD是指患者在接受造血干细胞移植后,由于供体移植物中的免疫活性细胞T淋巴细胞与体内组织间发生特异性免疫反应,从而导致受体的靶组织或靶器官受损。临床上GVHD可分为移植后100 d以内及100 d之后的急性GVHD(aGVHD)和慢性GVHD(cGVHD)。研究发现,辅助T淋巴细胞中Th1和Th2亚群所分泌的细胞因子失衡会导致GVHD的发生,从而对该疾病的分层诊断、预后判断及靶向治疗产生影响。因此,对于患者体内特异性细胞因子的检测分析可能会为GVHD的防治提供线索和思路[1]。 展开更多
关键词 急性移植物抗宿主病 细胞因子 诊断 预防
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NSCLC患者恶性胸水中H19下调miR-203对肺癌细胞侵袭能力的影响
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作者 刘帅妹 王妹 +3 位作者 杜雨轩 程文亮 李洁 葛晓军 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第10期1069-1075,共7页
目的H19在非小细胞肺癌(NSCLC)的异常高表达是目前研究的热点。文中旨在探究NSCLC患者恶性胸水中H19的表达水平及其与miR-203的调控关系。方法收集2019年6至2021年5月遵义医科大学第二附属医院检验科132例NSCLC胸水标本。根据H19的相对... 目的H19在非小细胞肺癌(NSCLC)的异常高表达是目前研究的热点。文中旨在探究NSCLC患者恶性胸水中H19的表达水平及其与miR-203的调控关系。方法收集2019年6至2021年5月遵义医科大学第二附属医院检验科132例NSCLC胸水标本。根据H19的相对表达水平,将患者分为H19高表达组(肿瘤/对照≥1.5)和H19低表达组(肿瘤/对照<1.5),健康供者为对照组。根据miR-203的相对表达水平,将患者分为miR-203高表达组(肿瘤/对照≥2.0)和miR-203低表达组(肿瘤/对照≤2.0)。在萤光素酶检测分析中,健康供者为空白对照组,未加入miR-203激活剂和miR-203抑制剂为阴性对照组,加入miR-203激活剂为miR-203激活剂组,加入miR-203抑制剂为miR-203抑制剂组。在EMT标记蛋白的变化分析,未加入miR-203抑制剂和H19抑制剂为阴性组,加入miR-203抑制剂和H19抑制剂为miR-203抑制剂+H19抑制剂组,加入miR-203抑制剂为miR-203抑制剂组。采用Western blot检测细胞内蛋白表达;CCK-8检测细胞增殖能力;Transwell检测细胞侵袭能力;流式细胞术检测细胞周期及凋亡等。结果H19高表达组的生存时间[(59.22±20.97)个月]较H19低表达组[(85.70±13.12)个月]明显缩短(P<0.05),即H19高表达与NSCLC的预后不良相关。而miR-203高表达组生存时间[(64.15±25.89)个月]较miR-203低表达组生存时间[(55.44±26.65)个月]明显延长(P<0.05)。相关性分析发现,H19与miR-203呈负相关(r=-0.66,P<0.01)。与阴性对照组比较,miR-203抑制剂组能抑制上皮标志物CDH1的表达,并促进间质标志物SNAI1和Vimentin的表达(P<0.05)。与阴性对照组比较,miR-203抑制剂组和H19抑制剂组能促进上皮标志物CDH1的表达,且抑制间质标志物SNAI1和Vimentin的表达(P<0.05)。结论H19的表达能负向调控miR-203的表达,抑制H19的表达降低NSCLC细胞的增殖、侵袭,H19是NSCLC的调控机制之一。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 H19 miR-203 恶性胸水
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西罗莫司和伊马替尼治疗激素难治性慢性移植物抗宿主病的临床观察:一项单中心回顾性分析
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作者 何云地 黄瑞昊 +6 位作者 洪涛 王蔚浩 杜雨軒 王筱淇 王峥 张云芳 张曦 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第21期2313-2320,共8页
目的对比西罗莫司和伊马替尼作为二线药物,治疗异基因干细胞移植后激素难治性慢性移植物抗宿主病(steroid-refractory chronic graft-versus-host disease,SR-cGVHD)的疗效和预后。方法回顾性分析2017年9月至2020年12月于我中心确诊为... 目的对比西罗莫司和伊马替尼作为二线药物,治疗异基因干细胞移植后激素难治性慢性移植物抗宿主病(steroid-refractory chronic graft-versus-host disease,SR-cGVHD)的疗效和预后。方法回顾性分析2017年9月至2020年12月于我中心确诊为异基因造血干细胞移植后SR-cGVHD的33例患者临床资料,接受伊马替尼治疗16例,接受西罗莫司治疗17例。比较两组患者二线治疗后6个月和1年的缓解率、2年总生存(overall survival,OS)、2年无病生存(disease free survival,DFS)、1年无失败生存(failure free survival,FFS)和药物相关毒性。结果伊马替尼和西罗莫司治疗6个月整体缓解率分别是62.5%和41.2%(P=0.303),1年整体缓解率分别是73.3%和43.8%(P=0.149),6个月完全缓解率分别是12.5%和23.5%(P=0.656),1年完全缓解率分别是20.0%和31.3%(P=0.685),差异无统计学意义;伊马替尼2年OS和2年DFS均优于西罗莫司(P=0.041,P=0.043);伊马替尼和西罗莫司的药物相关毒性率差异无统计学意义。结论伊马替尼和西罗莫司治疗SR-cGVHD缓解率疗效相当,伊马替尼在短期生存和无病生存方面优于西罗莫司。 展开更多
关键词 慢性移植物抗宿主病 异基因造血干细胞移植 伊马替尼 西罗莫司
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1例获得性血友病A的诊断分析
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作者 蒋丽 魏琳丹 +1 位作者 杨小理 葛晓军 《临床检验杂志(电子版)》 2019年第4期295-296,共2页
目的分析1例获得性血友病A的诊断情况。方法收集1例获得性血友病A患者,对其诊断结果进行分析。结果此例患者入院后间断呕血,量约100mL,便血约200mL,测量血压96/69mmHg。1.上消化道出血。2.失血性贫血。3.凝血功能障碍原因待查。4.盆腔... 目的分析1例获得性血友病A的诊断情况。方法收集1例获得性血友病A患者,对其诊断结果进行分析。结果此例患者入院后间断呕血,量约100mL,便血约200mL,测量血压96/69mmHg。1.上消化道出血。2.失血性贫血。3.凝血功能障碍原因待查。4.盆腔占位并局限性腹膜炎。5.卵巢肿瘤。结论对于获得性血友病A而言,临床常规治疗手段无效,临床应予重视,及时行相关实验室检查,以明确出血原因。 展开更多
关键词 获得性血友病A 自身抗体 凝血因子Ⅷ抑制物
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巴西苏木素对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌葡萄黄质的抑制作用及其机制
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作者 周永雯 陈泽慧 +5 位作者 周小仙 杨智芳 余孟飞 刘和兰 黎瑞 李明哲 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期652-657,共6页
目的 探究巴西苏木素对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)葡萄黄质(STX)的抑制作用及其机制。方法 基于转录组学数据,分析巴西苏木素作用于MRSA后编码STX合成的操纵子crtOPQMN基因变化情况;将不同浓度巴西苏木素(16、32、64μg/ml)与MRSA... 目的 探究巴西苏木素对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)葡萄黄质(STX)的抑制作用及其机制。方法 基于转录组学数据,分析巴西苏木素作用于MRSA后编码STX合成的操纵子crtOPQMN基因变化情况;将不同浓度巴西苏木素(16、32、64μg/ml)与MRSA共培养:转平板观察菌落、离心沉淀观察菌体颜色变化及酶标仪检测STX含量;逆转录实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测STX合成中主要影响颜色的基因表达水平变化;光谱定量检测STX代谢中间产物变化情况;过氧化氢敏感性试验观察抑菌圈大小及存活菌数量;全血杀伤试验观察存活菌数量。结果 调控STX生成的操纵子基因表达均下调,其中主要影响颜色的基因crtM和crtN分别为-6.542479954、-6.107726632;随药物浓度增加,平板菌落及菌沉淀黄色变浅变白,STX含量减少,其中64μg/ml药物对STX抑制率最大,达50%;qRT-PCR结果显示随药物浓度增加crtM和crtN表达量下降;光谱定量结果显示STX代谢中间产物含量随药物浓度增加而减少;过氧化氢敏感性试验结果显示随药物浓度增大,抑菌圈直径增大,存活菌数量减低(P<0.05);全血杀伤试验结果显示随药物浓度增大,存活菌数量减低(P<0.05)。结论 巴西苏木素通过抑制crtM和crtN的表达减少MRSASTX生成;巴西苏木素抑制STX后可降低细菌抗氧化及抗宿主免疫杀伤能力,为开发新型抗毒力药物提供参考。 展开更多
关键词 巴西苏木素 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 葡萄黄质 crt M基因 crt N基因 抗氧化 抗杀伤
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基于机器学习联合加权基因共表达网络分析鉴定狼疮肾炎潜在生物标志物 被引量:1
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作者 白志勋 王艳平 +1 位作者 杨杰 谭州科 《华西医学》 CAS 2023年第7期996-1005,共10页
目的探讨狼疮肾炎(lupus nephritis,LN)发生发展的潜在机制,探讨与LN进展相关的关键生物标志物和免疫相关途径。方法从Gene Expression Omnibus数据库中下载数据集。通过对差异表达基因的差异表达分析和加权基因共表达网络分析(weighted... 目的探讨狼疮肾炎(lupus nephritis,LN)发生发展的潜在机制,探讨与LN进展相关的关键生物标志物和免疫相关途径。方法从Gene Expression Omnibus数据库中下载数据集。通过对差异表达基因的差异表达分析和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)挖掘,通过基因本体论基因功能富集分析、疾病本体论疾病富集分析、京都基因和基因组数据库通路富集分析,探索LN中差异表达基因的生物学功能。利用LASSO回归、支持向量机和随机森林3种机器学习模型获得LN中的枢纽基因(hub基因),构建基于hub基因的列线图诊断模型,并通过受试者操作特征曲线评价hub基因的诊断准确性,同时采用单样本基因集富集分析对已知标记基因集与hub基因的表达之间的关系进行分析。结果共获得2297个具有统计学意义的差异表达基因。WGCNA得到7个共表达模块;青色模块与LN的相关性最高;通过结合差异基因,共获得347个目标基因。通过支持向量机、LASSO和随机森林3种机器学习技术获得了3个hub基因(CLC、ADGRE4P、CISD2),作为LN的潜在生物标志物。受试者操作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)分析显示3个hub基因具有诊断价值(AUCCLC=0.718,AUCADGRE4P=0.813,AUCCISD2=0.718)。根据单样本基因集富集分析,hub基因主要在细胞凋亡、糖酵解、代谢、缺氧以及肿瘤坏死因子-α-核因子-κB相关途径中得到增强。结论通过机器学习技术结合WGCNA筛选获得3个LN疾病发生发展中的hub基因(CLC、ADGRE4P和CISD2)。以上3个基因可以为临床早期诊断LN提供帮助,并可能为进一步深入研究LN进展机制提供思路。 展开更多
关键词 枢纽基因 加权基因共表达网络分析 潜在生物标志物 狼疮肾炎
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